MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018416	ATGA	2	8	1	8	50 %	25 %	25 %	0 %	400404264
2	NC_018416	TAAA	2	8	263	270	75 %	25 %	0 %	0 %	400404264
3	NC_018416	TTAA	2	8	271	278	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
4	NC_018416	AGAA	2	8	327	334	75 %	0 %	25 %	0 %	400404264
5	NC_018416	TTAA	2	8	583	590	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
6	NC_018416	TTTA	2	8	681	688	25 %	75 %	0 %	0 %	400404264
7	NC_018416	ATAA	2	8	751	758	75 %	25 %	0 %	0 %	400404264
8	NC_018416	TTTA	2	8	924	931	25 %	75 %	0 %	0 %	400404264
9	NC_018416	TAAT	2	8	983	990	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
10	NC_018416	TAAT	2	8	1076	1083	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
11	NC_018416	TAAT	2	8	1130	1137	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
12	NC_018416	ATTC	2	8	1554	1561	25 %	50 %	0 %	25 %	400404265
13	NC_018416	ATTC	2	8	1593	1600	25 %	50 %	0 %	25 %	400404265
14	NC_018416	TAAA	2	8	1831	1838	75 %	25 %	0 %	0 %	400404265
15	NC_018416	TAAA	2	8	1840	1847	75 %	25 %	0 %	0 %	400404265
16	NC_018416	ATTA	2	8	1941	1948	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
17	NC_018416	TAAT	2	8	2539	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
18	NC_018416	ATTT	2	8	2840	2847	25 %	75 %	0 %	0 %	400404266
19	NC_018416	AATT	2	8	2916	2923	50 %	50 %	0 %	0 %	400404266
20	NC_018416	ATTT	2	8	3041	3048	25 %	75 %	0 %	0 %	400404266
21	NC_018416	ATTT	2	8	3258	3265	25 %	75 %	0 %	0 %	400404266
22	NC_018416	ATTT	2	8	3356	3363	25 %	75 %	0 %	0 %	400404266
23	NC_018416	ATTT	2	8	3426	3433	25 %	75 %	0 %	0 %	400404266
24	NC_018416	ATTA	2	8	3493	3500	50 %	50 %	0 %	0 %	400404267
25	NC_018416	AATC	2	8	3579	3586	50 %	25 %	0 %	25 %	400404267
26	NC_018416	TAAT	2	8	3736	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	400404268
27	NC_018416	AAAT	2	8	3842	3849	75 %	25 %	0 %	0 %	400404268
28	NC_018416	ATAA	2	8	3951	3958	75 %	25 %	0 %	0 %	400404268
29	NC_018416	TAAA	2	8	4021	4028	75 %	25 %	0 %	0 %	400404268
30	NC_018416	TAAA	2	8	4232	4239	75 %	25 %	0 %	0 %	400404269
31	NC_018416	TAAA	2	8	4313	4320	75 %	25 %	0 %	0 %	400404269
32	NC_018416	TAAA	2	8	4447	4454	75 %	25 %	0 %	0 %	400404270
33	NC_018416	CAAA	2	8	4601	4608	75 %	0 %	0 %	25 %	400404270
34	NC_018416	TAAT	2	8	4798	4805	50 %	50 %	0 %	0 %	400404270
35	NC_018416	TATG	2	8	4833	4840	25 %	50 %	25 %	0 %	400404270
36	NC_018416	ATTT	2	8	5167	5174	25 %	75 %	0 %	0 %	400404270
37	NC_018416	TTTA	2	8	5315	5322	25 %	75 %	0 %	0 %	400404270
38	NC_018416	AATA	2	8	5696	5703	75 %	25 %	0 %	0 %	400404270
39	NC_018416	TAAT	2	8	5734	5741	50 %	50 %	0 %	0 %	400404270
40	NC_018416	ATAA	2	8	6218	6225	75 %	25 %	0 %	0 %	400404271
41	NC_018416	ATTT	2	8	6249	6256	25 %	75 %	0 %	0 %	400404271
42	NC_018416	TAAA	2	8	6291	6298	75 %	25 %	0 %	0 %	400404271
43	NC_018416	ATTA	2	8	6320	6327	50 %	50 %	0 %	0 %	400404271
44	NC_018416	ATTT	2	8	6339	6346	25 %	75 %	0 %	0 %	400404271
45	NC_018416	ATTT	2	8	6610	6617	25 %	75 %	0 %	0 %	400404272
46	NC_018416	TTAA	2	8	6646	6653	50 %	50 %	0 %	0 %	400404272
47	NC_018416	TACT	2	8	6722	6729	25 %	50 %	0 %	25 %	400404272
48	NC_018416	ATGA	2	8	7123	7130	50 %	25 %	25 %	0 %	400404272
49	NC_018416	TTAT	2	8	7213	7220	25 %	75 %	0 %	0 %	400404272
50	NC_018416	CAAC	2	8	7300	7307	50 %	0 %	0 %	50 %	400404272
51	NC_018416	AAGA	2	8	7334	7341	75 %	0 %	25 %	0 %	400404272
52	NC_018416	TTTA	2	8	7583	7590	25 %	75 %	0 %	0 %	400404272
53	NC_018416	AAAT	2	8	7919	7926	75 %	25 %	0 %	0 %	400404273
54	NC_018416	ATTA	2	8	8169	8176	50 %	50 %	0 %	0 %	400404274
55	NC_018416	AATA	2	8	8412	8419	75 %	25 %	0 %	0 %	400404274
56	NC_018416	ATTT	2	8	8485	8492	25 %	75 %	0 %	0 %	400404274
57	NC_018416	ATAA	2	8	8548	8555	75 %	25 %	0 %	0 %	400404274
58	NC_018416	TAAA	2	8	8660	8667	75 %	25 %	0 %	0 %	400404274
59	NC_018416	TAAT	2	8	8738	8745	50 %	50 %	0 %	0 %	400404274
60	NC_018416	AAAT	2	8	8831	8838	75 %	25 %	0 %	0 %	400404274
61	NC_018416	ATTT	2	8	9381	9388	25 %	75 %	0 %	0 %	400404275
62	NC_018416	TAAA	2	8	9467	9474	75 %	25 %	0 %	0 %	400404275
63	NC_018416	TATT	2	8	9612	9619	25 %	75 %	0 %	0 %	400404276
64	NC_018416	ATAA	2	8	9754	9761	75 %	25 %	0 %	0 %	400404276
65	NC_018416	TAAT	2	8	9799	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
66	NC_018416	ATAA	2	8	10205	10212	75 %	25 %	0 %	0 %	400404276
67	NC_018416	ATTT	2	8	10346	10353	25 %	75 %	0 %	0 %	400404276
68	NC_018416	ATTT	2	8	10360	10367	25 %	75 %	0 %	0 %	400404276
69	NC_018416	TATT	2	8	10441	10448	25 %	75 %	0 %	0 %	400404276
70	NC_018416	TAAT	2	8	10474	10481	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
71	NC_018416	TTAA	2	8	10593	10600	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
72	NC_018416	ATTT	2	8	10645	10652	25 %	75 %	0 %	0 %	400404276
73	NC_018416	ATAA	2	8	10682	10689	75 %	25 %	0 %	0 %	400404276
74	NC_018416	ACTT	2	8	10699	10706	25 %	50 %	0 %	25 %	400404276
75	NC_018416	TAAA	2	8	10739	10746	75 %	25 %	0 %	0 %	400404276
76	NC_018416	CATC	2	8	10935	10942	25 %	25 %	0 %	50 %	400404276
77	NC_018416	TAAA	2	8	10969	10976	75 %	25 %	0 %	0 %	400404276
78	NC_018416	ATTT	2	8	11155	11162	25 %	75 %	0 %	0 %	400404276
79	NC_018416	TAAA	2	8	11458	11465	75 %	25 %	0 %	0 %	400404277
80	NC_018416	TTAT	2	8	11546	11553	25 %	75 %	0 %	0 %	400404277
81	NC_018416	AAAG	2	8	11778	11785	75 %	0 %	25 %	0 %	400404277
82	NC_018416	ATTA	2	8	11856	11863	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
83	NC_018416	TTAT	2	8	12003	12010	25 %	75 %	0 %	0 %	400404277
84	NC_018416	ATTT	2	8	12148	12155	25 %	75 %	0 %	0 %	400404277
85	NC_018416	TTTA	2	8	12226	12233	25 %	75 %	0 %	0 %	400404277
86	NC_018416	AAAC	2	8	12407	12414	75 %	0 %	0 %	25 %	400404277
87	NC_018416	TAAA	2	8	12700	12707	75 %	25 %	0 %	0 %	400404277
88	NC_018416	AAAT	2	8	12836	12843	75 %	25 %	0 %	0 %	400404277
89	NC_018416	ATTA	2	8	13054	13061	50 %	50 %	0 %	0 %	400404278
90	NC_018416	TATT	2	8	13388	13395	25 %	75 %	0 %	0 %	400404278
91	NC_018416	AAAT	2	8	13560	13567	75 %	25 %	0 %	0 %	400404278
92	NC_018416	CTTC	2	8	14449	14456	0 %	50 %	0 %	50 %	400404280
93	NC_018416	AATT	2	8	15239	15246	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
94	NC_018416	TTTA	2	8	15287	15294	25 %	75 %	0 %	0 %	400404281
95	NC_018416	TAAT	2	8	15558	15565	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
96	NC_018416	ATTT	2	8	15581	15588	25 %	75 %	0 %	0 %	400404281
97	NC_018416	TATT	2	8	15897	15904	25 %	75 %	0 %	0 %	400404282
98	NC_018416	TAAA	2	8	16026	16033	75 %	25 %	0 %	0 %	400404282
99	NC_018416	AATT	2	8	16267	16274	50 %	50 %	0 %	0 %	400404282
100	NC_018416	AATT	2	8	16358	16365	50 %	50 %	0 %	0 %	400404283
101	NC_018416	TAAT	2	8	16757	16764	50 %	50 %	0 %	0 %	400404283
102	NC_018416	AATT	2	8	16812	16819	50 %	50 %	0 %	0 %	400404283
103	NC_018416	ATTA	2	8	16878	16885	50 %	50 %	0 %	0 %	400404283
104	NC_018416	TATT	2	8	16917	16924	25 %	75 %	0 %	0 %	400404283
105	NC_018416	ATAA	2	8	16927	16934	75 %	25 %	0 %	0 %	400404283
106	NC_018416	TAAA	2	8	16994	17001	75 %	25 %	0 %	0 %	400404284
107	NC_018416	ATTA	2	8	17004	17011	50 %	50 %	0 %	0 %	400404284
108	NC_018416	AATT	2	8	17252	17259	50 %	50 %	0 %	0 %	400404284
109	NC_018416	TAAA	2	8	17895	17902	75 %	25 %	0 %	0 %	400404285
110	NC_018416	ATTT	2	8	17969	17976	25 %	75 %	0 %	0 %	400404285
111	NC_018416	AATT	2	8	17989	17996	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
112	NC_018416	AATA	2	8	18424	18431	75 %	25 %	0 %	0 %	400404285
113	NC_018416	TATG	2	8	18858	18865	25 %	50 %	25 %	0 %	400404285
114	NC_018416	ATTT	2	8	19014	19021	25 %	75 %	0 %	0 %	400404285
115	NC_018416	ATTA	2	8	19135	19142	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
116	NC_018416	TTTA	2	8	19327	19334	25 %	75 %	0 %	0 %	400404285
117	NC_018416	TCAA	2	8	19501	19508	50 %	25 %	0 %	25 %	400404285
118	NC_018416	TATG	2	8	19522	19529	25 %	50 %	25 %	0 %	400404285
119	NC_018416	TAAA	2	8	19626	19633	75 %	25 %	0 %	0 %	400404285
120	NC_018416	ATTT	2	8	20328	20335	25 %	75 %	0 %	0 %	400404285
121	NC_018416	TAAA	2	8	20820	20827	75 %	25 %	0 %	0 %	400404285
122	NC_018416	TAAT	2	8	21155	21162	50 %	50 %	0 %	0 %	400404286
123	NC_018416	TAAT	2	8	21551	21558	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
124	NC_018416	ATTT	2	8	21713	21720	25 %	75 %	0 %	0 %	400404287
125	NC_018416	TTAT	2	8	21789	21796	25 %	75 %	0 %	0 %	400404287
126	NC_018416	AAAT	2	8	22001	22008	75 %	25 %	0 %	0 %	400404287
127	NC_018416	TAAA	2	8	22112	22119	75 %	25 %	0 %	0 %	400404287
128	NC_018416	AAAT	2	8	22272	22279	75 %	25 %	0 %	0 %	400404287
129	NC_018416	ATTA	2	8	22281	22288	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
130	NC_018416	TAAT	2	8	22319	22326	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
131	NC_018416	ATTT	2	8	22528	22535	25 %	75 %	0 %	0 %	400404287
132	NC_018416	AGAA	2	8	22590	22597	75 %	0 %	25 %	0 %	400404287
133	NC_018416	ATGG	2	8	22652	22659	25 %	25 %	50 %	0 %	400404287
134	NC_018416	TAAT	2	8	23213	23220	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
135	NC_018416	TAAT	2	8	23339	23346	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
136	NC_018416	ATAA	2	8	23347	23354	75 %	25 %	0 %	0 %	400404287
137	NC_018416	AAAT	2	8	23475	23482	75 %	25 %	0 %	0 %	400404288
138	NC_018416	TAAT	2	8	23554	23561	50 %	50 %	0 %	0 %	400404288
139	NC_018416	ATAA	2	8	23632	23639	75 %	25 %	0 %	0 %	400404288
140	NC_018416	ATTT	2	8	23658	23665	25 %	75 %	0 %	0 %	400404288
141	NC_018416	AAAT	2	8	24244	24251	75 %	25 %	0 %	0 %	400404290
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