MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 492

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018415	AT	3	6	145	150	50 %	50 %	0 %	0 %	400404026
2	NC_018415	AT	3	6	336	341	50 %	50 %	0 %	0 %	400404026
3	NC_018415	AT	3	6	1078	1083	50 %	50 %	0 %	0 %	400404026
4	NC_018415	TA	3	6	1624	1629	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
5	NC_018415	TA	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
6	NC_018415	TA	3	6	1877	1882	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
7	NC_018415	TA	4	8	1885	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
8	NC_018415	TA	3	6	2058	2063	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
9	NC_018415	AT	3	6	2807	2812	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
10	NC_018415	AT	3	6	3255	3260	50 %	50 %	0 %	0 %	400404028
11	NC_018415	TA	3	6	3397	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	400404028
12	NC_018415	TA	4	8	3715	3722	50 %	50 %	0 %	0 %	400404029
13	NC_018415	AT	3	6	4535	4540	50 %	50 %	0 %	0 %	400404032
14	NC_018415	AG	3	6	4791	4796	50 %	0 %	50 %	0 %	400404032
15	NC_018415	AT	3	6	5006	5011	50 %	50 %	0 %	0 %	400404032
16	NC_018415	TA	3	6	5676	5681	50 %	50 %	0 %	0 %	400404032
17	NC_018415	AT	3	6	5796	5801	50 %	50 %	0 %	0 %	400404032
18	NC_018415	AT	3	6	6271	6276	50 %	50 %	0 %	0 %	400404033
19	NC_018415	TA	3	6	6365	6370	50 %	50 %	0 %	0 %	400404033
20	NC_018415	AT	3	6	6564	6569	50 %	50 %	0 %	0 %	400404033
21	NC_018415	TA	3	6	6628	6633	50 %	50 %	0 %	0 %	400404034
22	NC_018415	TA	3	6	6672	6677	50 %	50 %	0 %	0 %	400404034
23	NC_018415	TA	3	6	7446	7451	50 %	50 %	0 %	0 %	400404034
24	NC_018415	TA	3	6	8277	8282	50 %	50 %	0 %	0 %	400404036
25	NC_018415	AT	3	6	8691	8696	50 %	50 %	0 %	0 %	400404037
26	NC_018415	TA	3	6	9074	9079	50 %	50 %	0 %	0 %	400404037
27	NC_018415	TA	3	6	9449	9454	50 %	50 %	0 %	0 %	400404037
28	NC_018415	AT	3	6	9934	9939	50 %	50 %	0 %	0 %	400404037
29	NC_018415	AT	3	6	10055	10060	50 %	50 %	0 %	0 %	400404037
30	NC_018415	TA	3	6	10352	10357	50 %	50 %	0 %	0 %	400404037
31	NC_018415	TA	3	6	10367	10372	50 %	50 %	0 %	0 %	400404037
32	NC_018415	TA	3	6	10689	10694	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
33	NC_018415	TA	3	6	10741	10746	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
34	NC_018415	TA	3	6	10921	10926	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
35	NC_018415	AT	3	6	11360	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
36	NC_018415	AT	3	6	11450	11455	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
37	NC_018415	AT	3	6	11506	11511	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
38	NC_018415	AT	4	8	11626	11633	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
39	NC_018415	TA	3	6	11806	11811	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
40	NC_018415	AT	5	10	11930	11939	50 %	50 %	0 %	0 %	400404038
41	NC_018415	TA	3	6	12543	12548	50 %	50 %	0 %	0 %	400404039
42	NC_018415	TA	4	8	12597	12604	50 %	50 %	0 %	0 %	400404039
43	NC_018415	TA	3	6	13467	13472	50 %	50 %	0 %	0 %	400404041
44	NC_018415	AT	3	6	13789	13794	50 %	50 %	0 %	0 %	400404041
45	NC_018415	AT	3	6	14078	14083	50 %	50 %	0 %	0 %	400404041
46	NC_018415	TA	3	6	14555	14560	50 %	50 %	0 %	0 %	400404042
47	NC_018415	TA	3	6	14738	14743	50 %	50 %	0 %	0 %	400404042
48	NC_018415	AT	3	6	14934	14939	50 %	50 %	0 %	0 %	400404043
49	NC_018415	AT	3	6	15675	15680	50 %	50 %	0 %	0 %	400404044
50	NC_018415	AT	3	6	15740	15745	50 %	50 %	0 %	0 %	400404044
51	NC_018415	AT	3	6	15809	15814	50 %	50 %	0 %	0 %	400404044
52	NC_018415	AT	3	6	16022	16027	50 %	50 %	0 %	0 %	400404044
53	NC_018415	TA	3	6	16188	16193	50 %	50 %	0 %	0 %	400404044
54	NC_018415	AT	3	6	16837	16842	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
55	NC_018415	AT	3	6	16917	16922	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
56	NC_018415	AT	4	8	17096	17103	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
57	NC_018415	AT	3	6	17219	17224	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
58	NC_018415	TA	3	6	17394	17399	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
59	NC_018415	TA	3	6	17782	17787	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
60	NC_018415	AT	3	6	18181	18186	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
61	NC_018415	TA	3	6	18751	18756	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
62	NC_018415	TA	3	6	18766	18771	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
63	NC_018415	AT	3	6	18982	18987	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
64	NC_018415	TA	3	6	19055	19060	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
65	NC_018415	TA	3	6	19099	19104	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
66	NC_018415	TA	3	6	19337	19342	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
67	NC_018415	TA	3	6	19404	19409	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
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69	NC_018415	AT	3	6	19497	19502	50 %	50 %	0 %	0 %	400404046
70	NC_018415	AT	5	10	20413	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	400404047
71	NC_018415	AT	3	6	20472	20477	50 %	50 %	0 %	0 %	400404047
72	NC_018415	TA	3	6	20919	20924	50 %	50 %	0 %	0 %	400404048
73	NC_018415	AT	3	6	20988	20993	50 %	50 %	0 %	0 %	400404048
74	NC_018415	AT	4	8	21093	21100	50 %	50 %	0 %	0 %	400404048
75	NC_018415	AT	3	6	22095	22100	50 %	50 %	0 %	0 %	400404048
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78	NC_018415	TA	3	6	23536	23541	50 %	50 %	0 %	0 %	400404051
79	NC_018415	AT	3	6	23931	23936	50 %	50 %	0 %	0 %	400404052
80	NC_018415	TA	3	6	24051	24056	50 %	50 %	0 %	0 %	400404052
81	NC_018415	TA	3	6	24381	24386	50 %	50 %	0 %	0 %	400404052
82	NC_018415	AT	3	6	24749	24754	50 %	50 %	0 %	0 %	400404053
83	NC_018415	TA	3	6	25169	25174	50 %	50 %	0 %	0 %	400404053
84	NC_018415	TA	3	6	25634	25639	50 %	50 %	0 %	0 %	400404053
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89	NC_018415	TA	3	6	26855	26860	50 %	50 %	0 %	0 %	400404054
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92	NC_018415	TA	3	6	27115	27120	50 %	50 %	0 %	0 %	400404054
93	NC_018415	TA	3	6	27298	27303	50 %	50 %	0 %	0 %	400404054
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102	NC_018415	TA	3	6	30951	30956	50 %	50 %	0 %	0 %	400404059
103	NC_018415	TA	3	6	31406	31411	50 %	50 %	0 %	0 %	400404059
104	NC_018415	AT	3	6	31433	31438	50 %	50 %	0 %	0 %	400404059
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106	NC_018415	AT	4	8	32365	32372	50 %	50 %	0 %	0 %	400404060
107	NC_018415	TA	3	6	32940	32945	50 %	50 %	0 %	0 %	400404061
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109	NC_018415	AT	3	6	33110	33115	50 %	50 %	0 %	0 %	400404061
110	NC_018415	AT	3	6	33888	33893	50 %	50 %	0 %	0 %	400404062
111	NC_018415	TA	3	6	34382	34387	50 %	50 %	0 %	0 %	400404063
112	NC_018415	AT	3	6	34624	34629	50 %	50 %	0 %	0 %	400404063
113	NC_018415	AT	4	8	34957	34964	50 %	50 %	0 %	0 %	400404063
114	NC_018415	TA	3	6	35009	35014	50 %	50 %	0 %	0 %	400404063
115	NC_018415	TA	3	6	35115	35120	50 %	50 %	0 %	0 %	400404063
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125	NC_018415	AT	3	6	38194	38199	50 %	50 %	0 %	0 %	400404067
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