MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018415	AACAA	2	10	753	762	80 %	0 %	0 %	20 %	400404026
2	NC_018415	ATATT	2	10	886	895	40 %	60 %	0 %	0 %	400404026
3	NC_018415	AATTT	2	10	905	914	40 %	60 %	0 %	0 %	400404026
4	NC_018415	AATAA	2	10	952	961	80 %	20 %	0 %	0 %	400404026
5	NC_018415	AATTA	2	10	1142	1151	60 %	40 %	0 %	0 %	400404026
6	NC_018415	ATATA	2	10	2318	2327	60 %	40 %	0 %	0 %	400404027
7	NC_018415	ATTTT	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	400404028
8	NC_018415	ATTTT	2	10	3013	3022	20 %	80 %	0 %	0 %	400404028
9	NC_018415	TATTT	2	10	3045	3054	20 %	80 %	0 %	0 %	400404028
10	NC_018415	TAATT	2	10	3081	3090	40 %	60 %	0 %	0 %	400404028
11	NC_018415	TTTAA	2	10	3361	3370	40 %	60 %	0 %	0 %	400404028
12	NC_018415	ATTAT	2	10	4162	4171	40 %	60 %	0 %	0 %	400404030
13	NC_018415	TTATT	2	10	4287	4296	20 %	80 %	0 %	0 %	400404031
14	NC_018415	ATATA	2	10	4469	4478	60 %	40 %	0 %	0 %	400404032
15	NC_018415	AAAAT	2	10	5832	5841	80 %	20 %	0 %	0 %	400404033
16	NC_018415	ATATT	2	10	6102	6111	40 %	60 %	0 %	0 %	400404033
17	NC_018415	AAAAT	2	10	6504	6513	80 %	20 %	0 %	0 %	400404033
18	NC_018415	ATATA	2	10	9705	9714	60 %	40 %	0 %	0 %	400404037
19	NC_018415	TATTT	3	15	9720	9734	20 %	80 %	0 %	0 %	400404037
20	NC_018415	TAAAA	2	10	10009	10018	80 %	20 %	0 %	0 %	400404037
21	NC_018415	TAATA	2	10	10733	10742	60 %	40 %	0 %	0 %	400404038
22	NC_018415	ATTTA	2	10	12119	12128	40 %	60 %	0 %	0 %	400404038
23	NC_018415	ATTAT	2	10	12147	12156	40 %	60 %	0 %	0 %	400404038
24	NC_018415	TATAA	2	10	12951	12960	60 %	40 %	0 %	0 %	400404040
25	NC_018415	CTAAT	2	10	13742	13751	40 %	40 %	0 %	20 %	400404041
26	NC_018415	ATATT	2	10	13849	13858	40 %	60 %	0 %	0 %	400404041
27	NC_018415	AATTT	2	10	13985	13994	40 %	60 %	0 %	0 %	400404041
28	NC_018415	AAATT	2	10	14045	14054	60 %	40 %	0 %	0 %	400404041
29	NC_018415	AAATA	2	10	14709	14718	80 %	20 %	0 %	0 %	400404042
30	NC_018415	AAATT	2	10	15257	15266	60 %	40 %	0 %	0 %	400404043
31	NC_018415	TTAAT	2	10	15534	15543	40 %	60 %	0 %	0 %	400404043
32	NC_018415	TTTAG	2	10	15610	15619	20 %	60 %	20 %	0 %	400404044
33	NC_018415	AAATT	2	10	15773	15782	60 %	40 %	0 %	0 %	400404044
34	NC_018415	ATAAA	2	10	15830	15839	80 %	20 %	0 %	0 %	400404044
35	NC_018415	AATTT	2	10	15998	16007	40 %	60 %	0 %	0 %	400404044
36	NC_018415	ATTTT	2	10	16150	16159	20 %	80 %	0 %	0 %	400404044
37	NC_018415	ATTTT	2	10	16365	16374	20 %	80 %	0 %	0 %	400404045
38	NC_018415	AAAAT	2	10	16542	16551	80 %	20 %	0 %	0 %	400404045
39	NC_018415	ATTAA	2	10	16649	16658	60 %	40 %	0 %	0 %	400404045
40	NC_018415	AAGTA	2	10	17324	17333	60 %	20 %	20 %	0 %	400404046
41	NC_018415	AATGA	2	10	17409	17418	60 %	20 %	20 %	0 %	400404046
42	NC_018415	TAAAT	2	10	17501	17510	60 %	40 %	0 %	0 %	400404046
43	NC_018415	AATTA	2	10	18628	18637	60 %	40 %	0 %	0 %	400404046
44	NC_018415	TTATT	2	10	18676	18685	20 %	80 %	0 %	0 %	400404046
45	NC_018415	TTTTA	2	10	19444	19453	20 %	80 %	0 %	0 %	400404046
46	NC_018415	ATTTT	2	10	20773	20782	20 %	80 %	0 %	0 %	400404048
47	NC_018415	TATTT	2	10	20844	20853	20 %	80 %	0 %	0 %	400404048
48	NC_018415	TTATA	2	10	21101	21110	40 %	60 %	0 %	0 %	400404048
49	NC_018415	ATTTA	2	10	21598	21607	40 %	60 %	0 %	0 %	400404048
50	NC_018415	ATTTT	2	10	22176	22185	20 %	80 %	0 %	0 %	400404048
51	NC_018415	ATTTT	2	10	22284	22293	20 %	80 %	0 %	0 %	400404048
52	NC_018415	TTAAT	2	10	22375	22384	40 %	60 %	0 %	0 %	400404048
53	NC_018415	ATATA	2	10	22520	22529	60 %	40 %	0 %	0 %	400404048
54	NC_018415	AAAAT	2	10	24502	24511	80 %	20 %	0 %	0 %	400404052
55	NC_018415	ATCTA	2	10	24603	24612	40 %	40 %	0 %	20 %	400404052
56	NC_018415	TAAAT	2	10	24990	24999	60 %	40 %	0 %	0 %	400404053
57	NC_018415	ATTTA	2	10	26365	26374	40 %	60 %	0 %	0 %	400404054
58	NC_018415	AATTT	2	10	27209	27218	40 %	60 %	0 %	0 %	400404054
59	NC_018415	TTTAA	2	10	28835	28844	40 %	60 %	0 %	0 %	400404056
60	NC_018415	AATTT	2	10	30049	30058	40 %	60 %	0 %	0 %	400404058
61	NC_018415	AATTT	2	10	30066	30075	40 %	60 %	0 %	0 %	400404058
62	NC_018415	TAATT	2	10	30266	30275	40 %	60 %	0 %	0 %	400404058
63	NC_018415	ATTAT	2	10	30447	30456	40 %	60 %	0 %	0 %	400404058
64	NC_018415	ATTAA	2	10	33001	33010	60 %	40 %	0 %	0 %	400404061
65	NC_018415	TAATT	2	10	33204	33213	40 %	60 %	0 %	0 %	400404061
66	NC_018415	TATAA	2	10	33810	33819	60 %	40 %	0 %	0 %	400404062
67	NC_018415	ATTTT	2	10	34496	34505	20 %	80 %	0 %	0 %	400404063
68	NC_018415	AAATA	2	10	34880	34889	80 %	20 %	0 %	0 %	400404063
69	NC_018415	TATTT	2	10	35781	35790	20 %	80 %	0 %	0 %	400404065
70	NC_018415	ATTAA	2	10	35845	35854	60 %	40 %	0 %	0 %	400404065
71	NC_018415	ACAAA	2	10	36343	36352	80 %	0 %	0 %	20 %	400404066
72	NC_018415	TTTTA	2	10	36847	36856	20 %	80 %	0 %	0 %	400404066
73	NC_018415	TAAAA	2	10	37707	37716	80 %	20 %	0 %	0 %	400404067
74	NC_018415	TAAAA	2	10	37800	37809	80 %	20 %	0 %	0 %	400404067
75	NC_018415	ATATA	2	10	38528	38537	60 %	40 %	0 %	0 %	400404068
76	NC_018415	ATTTT	2	10	39266	39275	20 %	80 %	0 %	0 %	400404069
77	NC_018415	TAAAA	2	10	40442	40451	80 %	20 %	0 %	0 %	400404070
78	NC_018415	TTTTA	2	10	40481	40490	20 %	80 %	0 %	0 %	400404070
79	NC_018415	TAAAA	2	10	41369	41378	80 %	20 %	0 %	0 %	400404072
80	NC_018415	TAAAT	2	10	41513	41522	60 %	40 %	0 %	0 %	400404072
81	NC_018415	ATTTT	2	10	42705	42714	20 %	80 %	0 %	0 %	400404073
82	NC_018415	AATTT	2	10	42939	42948	40 %	60 %	0 %	0 %	400404073
83	NC_018415	ATTTT	2	10	43392	43401	20 %	80 %	0 %	0 %	400404073
84	NC_018415	TTTTA	2	10	43691	43700	20 %	80 %	0 %	0 %	400404073
85	NC_018415	TAAAA	2	10	43793	43802	80 %	20 %	0 %	0 %	400404074
86	NC_018415	TAAAA	2	10	43950	43959	80 %	20 %	0 %	0 %	400404075
87	NC_018415	ATATT	2	10	44516	44525	40 %	60 %	0 %	0 %	400404076
88	NC_018415	AATTT	2	10	44874	44883	40 %	60 %	0 %	0 %	400404076
89	NC_018415	TAATA	2	10	45533	45542	60 %	40 %	0 %	0 %	400404076
90	NC_018415	AAAAT	2	10	45654	45663	80 %	20 %	0 %	0 %	400404077
91	NC_018415	TAAAT	2	10	46044	46053	60 %	40 %	0 %	0 %	400404078
92	NC_018415	AAATT	2	10	46216	46225	60 %	40 %	0 %	0 %	400404078
93	NC_018415	AATAA	2	10	46479	46488	80 %	20 %	0 %	0 %	400404079
94	NC_018415	ATTTT	2	10	46624	46633	20 %	80 %	0 %	0 %	400404079
95	NC_018415	ATTTA	2	10	46676	46685	40 %	60 %	0 %	0 %	400404079
96	NC_018415	TAATT	2	10	46694	46703	40 %	60 %	0 %	0 %	400404079
97	NC_018415	ATTAA	2	10	47381	47390	60 %	40 %	0 %	0 %	400404080
98	NC_018415	ATTAC	2	10	47969	47978	40 %	40 %	0 %	20 %	400404081
99	NC_018415	ATTTA	2	10	48729	48738	40 %	60 %	0 %	0 %	400404081
100	NC_018415	ATATT	2	10	49165	49174	40 %	60 %	0 %	0 %	400404082
101	NC_018415	ATTTA	2	10	49458	49467	40 %	60 %	0 %	0 %	400404082
102	NC_018415	TAATT	2	10	49630	49639	40 %	60 %	0 %	0 %	400404082
103	NC_018415	TAAAT	2	10	49882	49891	60 %	40 %	0 %	0 %	400404082
104	NC_018415	TTTCA	2	10	50503	50512	20 %	60 %	0 %	20 %	400404083
105	NC_018415	AAATT	2	10	50769	50778	60 %	40 %	0 %	0 %	400404083
106	NC_018415	TTTCT	2	10	50811	50820	0 %	80 %	0 %	20 %	400404083
107	NC_018415	AAATA	2	10	51057	51066	80 %	20 %	0 %	0 %	400404083
108	NC_018415	ATTTT	2	10	51651	51660	20 %	80 %	0 %	0 %	400404083
109	NC_018415	ATTAT	2	10	51766	51775	40 %	60 %	0 %	0 %	400404084
110	NC_018415	ATTTT	2	10	51895	51904	20 %	80 %	0 %	0 %	400404084
111	NC_018415	TTTAA	2	10	52659	52668	40 %	60 %	0 %	0 %	400404085
112	NC_018415	TAAAA	2	10	52917	52926	80 %	20 %	0 %	0 %	400404086
113	NC_018415	TAAAT	2	10	53921	53930	60 %	40 %	0 %	0 %	400404087
114	NC_018415	TAAAA	2	10	54684	54693	80 %	20 %	0 %	0 %	400404088
115	NC_018415	ATAAA	2	10	55059	55068	80 %	20 %	0 %	0 %	400404089
116	NC_018415	ATTTT	2	10	55218	55227	20 %	80 %	0 %	0 %	400404090
117	NC_018415	ATTAT	2	10	55936	55945	40 %	60 %	0 %	0 %	400404091
118	NC_018415	ATTTA	2	10	56267	56276	40 %	60 %	0 %	0 %	400404091
119	NC_018415	AAATA	2	10	56989	56998	80 %	20 %	0 %	0 %	400404092
120	NC_018415	TTTTA	2	10	57234	57243	20 %	80 %	0 %	0 %	400404092
121	NC_018415	CTATA	2	10	57299	57308	40 %	40 %	0 %	20 %	400404092
122	NC_018415	AATTA	2	10	57333	57342	60 %	40 %	0 %	0 %	400404092
123	NC_018415	ATATT	2	10	57485	57494	40 %	60 %	0 %	0 %	400404092
124	NC_018415	TTTAA	2	10	57817	57826	40 %	60 %	0 %	0 %	400404092
125	NC_018415	ATATC	2	10	58050	58059	40 %	40 %	0 %	20 %	400404093
126	NC_018415	ATTTA	2	10	58720	58729	40 %	60 %	0 %	0 %	400404094
127	NC_018415	TAAAA	2	10	60035	60044	80 %	20 %	0 %	0 %	400404096
128	NC_018415	ATTTA	2	10	62421	62430	40 %	60 %	0 %	0 %	400404099
129	NC_018415	AAATA	2	10	62698	62707	80 %	20 %	0 %	0 %	400404099
130	NC_018415	ATTTG	2	10	63073	63082	20 %	60 %	20 %	0 %	400404099
131	NC_018415	TAAAA	2	10	63512	63521	80 %	20 %	0 %	0 %	400404099
132	NC_018415	TTAAT	2	10	64127	64136	40 %	60 %	0 %	0 %	400404101
133	NC_018415	AATTT	2	10	64175	64184	40 %	60 %	0 %	0 %	400404101
134	NC_018415	ATTTT	2	10	64928	64937	20 %	80 %	0 %	0 %	400404102
135	NC_018415	TAAAA	2	10	64938	64947	80 %	20 %	0 %	0 %	400404102
136	NC_018415	AATTA	2	10	65151	65160	60 %	40 %	0 %	0 %	400404102
137	NC_018415	CAAAA	2	10	65206	65215	80 %	0 %	0 %	20 %	400404102
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.