MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 2935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018415	TTC	2	6	42	47	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404026
2	NC_018415	TAA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
3	NC_018415	TAA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
4	NC_018415	TTA	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
5	NC_018415	TAA	3	9	378	386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
6	NC_018415	TAT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
7	NC_018415	ATA	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
8	NC_018415	TTA	2	6	487	492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
9	NC_018415	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
10	NC_018415	TAT	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
11	NC_018415	TAA	2	6	600	605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
12	NC_018415	TAC	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404026
13	NC_018415	TAA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
14	NC_018415	CAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404026
15	NC_018415	AAT	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
16	NC_018415	TAT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
17	NC_018415	TAA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
18	NC_018415	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
19	NC_018415	ATT	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
20	NC_018415	TAT	2	6	1166	1171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
21	NC_018415	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400404026
22	NC_018415	ATT	3	9	1219	1227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
23	NC_018415	TAA	2	6	1235	1240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
24	NC_018415	AAT	2	6	1282	1287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
25	NC_018415	TCT	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404027
26	NC_018415	TAA	2	6	1403	1408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
27	NC_018415	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
28	NC_018415	AAT	2	6	1520	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
29	NC_018415	ATT	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
30	NC_018415	ATT	3	9	1646	1654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
31	NC_018415	TAA	2	6	1669	1674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
32	NC_018415	TTA	2	6	1699	1704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
33	NC_018415	TAA	2	6	1726	1731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
34	NC_018415	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
35	NC_018415	CCA	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400404027
36	NC_018415	ATA	3	9	2008	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
37	NC_018415	TAA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
38	NC_018415	ATA	2	6	2103	2108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
39	NC_018415	TAA	2	6	2162	2167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
40	NC_018415	TAG	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404027
41	NC_018415	TAT	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
42	NC_018415	TAC	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404027
43	NC_018415	GAA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404027
44	NC_018415	GCA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404027
45	NC_018415	TAT	2	6	2494	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
46	NC_018415	TAA	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
47	NC_018415	ATT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
48	NC_018415	ATT	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
49	NC_018415	TAT	2	6	2691	2696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
50	NC_018415	AAT	2	6	2697	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
51	NC_018415	ATA	3	9	2884	2892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
52	NC_018415	TAT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
53	NC_018415	TAA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
54	NC_018415	ATT	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
55	NC_018415	TAA	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
56	NC_018415	TAA	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
57	NC_018415	AAC	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404028
58	NC_018415	AAT	2	6	3159	3164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
59	NC_018415	ATT	2	6	3169	3174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
60	NC_018415	ATT	2	6	3327	3332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
61	NC_018415	ATA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
62	NC_018415	ATT	2	6	3428	3433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
63	NC_018415	TTA	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
64	NC_018415	TTA	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404029
65	NC_018415	ATC	3	9	3533	3541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404029
66	NC_018415	ATG	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404029
67	NC_018415	TCT	2	6	3558	3563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404029
68	NC_018415	ATT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404029
69	NC_018415	ATA	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404029
70	NC_018415	TTA	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404029
71	NC_018415	TTA	2	6	3675	3680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404029
72	NC_018415	TAT	2	6	3730	3735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404029
73	NC_018415	TAA	2	6	3737	3742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404029
74	NC_018415	AAT	2	6	3853	3858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404030
75	NC_018415	TAT	2	6	3862	3867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404030
76	NC_018415	ATT	2	6	3877	3882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404030
77	NC_018415	TAA	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404030
78	NC_018415	TAA	2	6	4098	4103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404030
79	NC_018415	ATA	2	6	4172	4177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404030
80	NC_018415	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404031
81	NC_018415	TAT	2	6	4307	4312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404031
82	NC_018415	AGA	2	6	4339	4344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404031
83	NC_018415	ATT	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404031
84	NC_018415	ATA	3	9	4358	4366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404031
85	NC_018415	AAT	2	6	4377	4382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404031
86	NC_018415	ATG	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404032
87	NC_018415	TTG	2	6	4414	4419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400404032
88	NC_018415	AAT	2	6	4506	4511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
89	NC_018415	TAT	2	6	4522	4527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
90	NC_018415	GAA	2	6	4615	4620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404032
91	NC_018415	ATT	2	6	4848	4853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
92	NC_018415	TCT	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404032
93	NC_018415	ATT	3	9	4965	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
94	NC_018415	TGC	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400404032
95	NC_018415	ATT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
96	NC_018415	ATG	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404032
97	NC_018415	TAT	2	6	5125	5130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
98	NC_018415	ATT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
99	NC_018415	ATC	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404032
100	NC_018415	TAA	2	6	5213	5218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
101	NC_018415	TTA	2	6	5224	5229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
102	NC_018415	CTT	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404032
103	NC_018415	CTA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404032
104	NC_018415	TTA	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
105	NC_018415	ATA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
106	NC_018415	TGG	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400404032
107	NC_018415	GCA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404032
108	NC_018415	AAT	2	6	5471	5476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
109	NC_018415	AAT	2	6	5553	5558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
110	NC_018415	ATT	2	6	5573	5578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404032
111	NC_018415	TAA	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
112	NC_018415	TAA	2	6	5620	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
113	NC_018415	TAA	2	6	5635	5640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
114	NC_018415	AGT	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404032
115	NC_018415	ATA	2	6	5752	5757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
116	NC_018415	TAA	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404032
117	NC_018415	GTA	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404032
118	NC_018415	TAA	2	6	5818	5823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
119	NC_018415	TAA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
120	NC_018415	GAA	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404033
121	NC_018415	AAT	2	6	5995	6000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
122	NC_018415	TTG	2	6	6004	6009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400404033
123	NC_018415	TAA	3	9	6012	6020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
124	NC_018415	GTA	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404033
125	NC_018415	AAT	2	6	6050	6055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
126	NC_018415	TAA	2	6	6156	6161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
127	NC_018415	ATA	3	9	6279	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
128	NC_018415	ATT	2	6	6307	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404033
129	NC_018415	TAA	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
130	NC_018415	TAA	2	6	6358	6363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
131	NC_018415	TAA	2	6	6382	6387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404033
132	NC_018415	GAT	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404033
133	NC_018415	TTA	2	6	6479	6484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404033
134	NC_018415	ATT	2	6	6497	6502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404033
135	NC_018415	ATT	2	6	6548	6553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404033
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389	NC_018415	ATA	2	6	20333	20338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404047
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392	NC_018415	TTA	2	6	20493	20498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404047
393	NC_018415	TAA	2	6	20505	20510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404047
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