MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CE isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 3010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018414	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
2	NC_018414	TTC	2	6	42	47	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400403788
3	NC_018414	TTA	2	6	89	94	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
4	NC_018414	TAA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
5	NC_018414	TGT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400403788
6	NC_018414	TAA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
7	NC_018414	ATT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
8	NC_018414	AAC	2	6	379	384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400403788
9	NC_018414	TAT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
10	NC_018414	TAA	2	6	455	460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
11	NC_018414	ATA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
12	NC_018414	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
13	NC_018414	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403788
14	NC_018414	ATT	2	6	582	587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
15	NC_018414	TAT	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
16	NC_018414	TAA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
17	NC_018414	CAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400403788
18	NC_018414	ATT	2	6	973	978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
19	NC_018414	TAA	2	6	983	988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
20	NC_018414	ATT	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
21	NC_018414	AAT	2	6	1107	1112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
22	NC_018414	ATT	3	9	1125	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
23	NC_018414	TAA	2	6	1173	1178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
24	NC_018414	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400403788
25	NC_018414	TAA	2	6	1235	1240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
26	NC_018414	TAA	3	9	1281	1289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
27	NC_018414	ATT	3	9	1341	1349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
28	NC_018414	TCT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400403789
29	NC_018414	GTA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403789
30	NC_018414	ATA	2	6	1435	1440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
31	NC_018414	AGG	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400403789
32	NC_018414	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
33	NC_018414	AGG	2	6	1514	1519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400403789
34	NC_018414	ATT	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
35	NC_018414	ATT	3	9	1646	1654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
36	NC_018414	TAA	2	6	1669	1674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
37	NC_018414	TAA	2	6	1726	1731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
38	NC_018414	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
39	NC_018414	ATA	3	9	2008	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
40	NC_018414	TAA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
41	NC_018414	TCA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403789
42	NC_018414	TAA	2	6	2162	2167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
43	NC_018414	TTA	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
44	NC_018414	TAG	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403789
45	NC_018414	TAT	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
46	NC_018414	GAA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400403789
47	NC_018414	GCA	3	9	2436	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400403789
48	NC_018414	TAT	3	9	2491	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
49	NC_018414	ATT	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
50	NC_018414	TAT	2	6	2691	2696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
51	NC_018414	AAT	2	6	2697	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
52	NC_018414	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
53	NC_018414	ATA	3	9	2778	2786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
54	NC_018414	ATA	3	9	2878	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403790
55	NC_018414	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
56	NC_018414	ATT	2	6	2954	2959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
57	NC_018414	TAT	2	6	3044	3049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
58	NC_018414	TTA	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
59	NC_018414	TAA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403790
60	NC_018414	TAA	2	6	3096	3101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403790
61	NC_018414	ACA	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400403790
62	NC_018414	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
63	NC_018414	ATT	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
64	NC_018414	AAT	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403790
65	NC_018414	TAA	2	6	3362	3367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403790
66	NC_018414	ATT	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
67	NC_018414	TTA	2	6	3467	3472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
68	NC_018414	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403791
69	NC_018414	ATG	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403791
70	NC_018414	TCT	2	6	3551	3556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400403791
71	NC_018414	AGG	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400403791
72	NC_018414	ATT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403791
73	NC_018414	TTA	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403791
74	NC_018414	TTA	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403791
75	NC_018414	TAT	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403791
76	NC_018414	TAA	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403791
77	NC_018414	ATA	2	6	3736	3741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403791
78	NC_018414	AAT	2	6	3846	3851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403792
79	NC_018414	TAT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403792
80	NC_018414	ATT	2	6	3870	3875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403792
81	NC_018414	TAA	2	6	3877	3882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403792
82	NC_018414	ATA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403792
83	NC_018414	ATA	2	6	3979	3984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403792
84	NC_018414	TTA	2	6	4057	4062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403792
85	NC_018414	ATT	2	6	4155	4160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403792
86	NC_018414	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403792
87	NC_018414	AGA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400403793
88	NC_018414	TAT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403793
89	NC_018414	ATA	2	6	4351	4356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403793
90	NC_018414	AAT	2	6	4370	4375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403793
91	NC_018414	ATG	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403794
92	NC_018414	TTG	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400403794
93	NC_018414	AAT	2	6	4499	4504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
94	NC_018414	TAT	2	6	4515	4520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403794
95	NC_018414	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400403794
96	NC_018414	ATA	2	6	4793	4798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
97	NC_018414	ACT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403794
98	NC_018414	AAT	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
99	NC_018414	ATC	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403794
100	NC_018414	GCA	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400403794
101	NC_018414	TAA	2	6	5064	5069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
102	NC_018414	GAT	2	6	5075	5080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403794
103	NC_018414	TAT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403794
104	NC_018414	ATT	2	6	5182	5187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403794
105	NC_018414	ATC	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403794
106	NC_018414	TAA	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
107	NC_018414	CTA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403794
108	NC_018414	TTA	2	6	5316	5321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403794
109	NC_018414	ATA	2	6	5349	5354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
110	NC_018414	TGG	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400403794
111	NC_018414	AGC	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400403794
112	NC_018414	AAT	2	6	5464	5469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
113	NC_018414	TCA	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403794
114	NC_018414	AAT	2	6	5546	5551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
115	NC_018414	ATT	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403794
116	NC_018414	ATG	2	6	5589	5594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403794
117	NC_018414	AAC	2	6	5614	5619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400403794
118	NC_018414	TAA	3	9	5628	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
119	NC_018414	TTA	2	6	5691	5696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403794
120	NC_018414	TAA	2	6	5775	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403794
121	NC_018414	GTA	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403794
122	NC_018414	TAA	2	6	5811	5816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
123	NC_018414	TAA	2	6	5907	5912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
124	NC_018414	TAA	2	6	5918	5923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
125	NC_018414	AAT	2	6	5988	5993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
126	NC_018414	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400403795
127	NC_018414	TAT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403795
128	NC_018414	TAA	2	6	6084	6089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
129	NC_018414	ATT	2	6	6125	6130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403795
130	NC_018414	ATA	2	6	6209	6214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
131	NC_018414	AAT	2	6	6220	6225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
132	NC_018414	TAA	2	6	6270	6275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403795
133	NC_018414	TAT	2	6	6276	6281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403795
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257	NC_018414	ATA	2	6	13036	13041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403802
258	NC_018414	TCA	2	6	13055	13060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403802
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