MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 35774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018019	GCT	2	6	254616	254621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399810
4002	NC_018019	GGA	2	6	254695	254700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399810
4003	NC_018019	TCCTT	2	10	254730	254739	0 %	60 %	0 %	40 %	392399810
4004	NC_018019	T	6	6	254779	254784	0 %	100 %	0 %	0 %	392399810
4005	NC_018019	AGG	2	6	254796	254801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399810
4006	NC_018019	GTC	2	6	254804	254809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399810
4007	NC_018019	TAA	2	6	254884	254889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392399810
4008	NC_018019	GCC	2	6	254930	254935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399810
4009	NC_018019	A	6	6	255004	255009	100 %	0 %	0 %	0 %	392399810
4010	NC_018019	CTT	2	6	255040	255045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399810
4011	NC_018019	GTT	2	6	255079	255084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399810
4012	NC_018019	CAG	3	9	255116	255124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399810
4013	NC_018019	GAT	2	6	255143	255148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399810
4014	NC_018019	AGTT	2	8	255279	255286	25 %	50 %	25 %	0 %	392399811
4015	NC_018019	GGAAG	2	10	255416	255425	40 %	0 %	60 %	0 %	392399811
4016	NC_018019	TCG	2	6	255619	255624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399811
4017	NC_018019	TGG	2	6	255710	255715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399811
4018	NC_018019	CGT	2	6	255728	255733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399811
4019	NC_018019	CTT	2	6	255737	255742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399811
4020	NC_018019	CGC	2	6	255782	255787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399811
4021	NC_018019	CCG	3	9	255802	255810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399811
4022	NC_018019	TCT	2	6	255842	255847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399811
4023	NC_018019	ATG	2	6	255850	255855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399811
4024	NC_018019	TCC	2	6	255856	255861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399811
4025	NC_018019	CGG	2	6	255974	255979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399811
4026	NC_018019	CTCAAG	2	12	256056	256067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392399811
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4028	NC_018019	GA	3	6	256372	256377	50 %	0 %	50 %	0 %	392399812
4029	NC_018019	GCT	3	9	256385	256393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399812
4030	NC_018019	TCT	2	6	256487	256492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399812
4031	NC_018019	TGCATT	2	12	256527	256538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392399812
4032	NC_018019	TCA	2	6	256708	256713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399813
4033	NC_018019	CCATG	2	10	256814	256823	20 %	20 %	20 %	40 %	392399813
4034	NC_018019	TTGCC	2	10	256901	256910	0 %	40 %	20 %	40 %	392399813
4035	NC_018019	TG	3	6	256998	257003	0 %	50 %	50 %	0 %	392399813
4036	NC_018019	GTC	2	6	257022	257027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399813
4037	NC_018019	GTC	3	9	257034	257042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399813
4038	NC_018019	CGA	2	6	257150	257155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399813
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4040	NC_018019	TTGC	2	8	257385	257392	0 %	50 %	25 %	25 %	392399813
4041	NC_018019	TCA	2	6	257401	257406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399813
4042	NC_018019	GCC	2	6	257409	257414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399813
4043	NC_018019	TTGC	2	8	257472	257479	0 %	50 %	25 %	25 %	392399813
4044	NC_018019	AC	3	6	257495	257500	50 %	0 %	0 %	50 %	392399813
4045	NC_018019	GGC	2	6	257511	257516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399813
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4047	NC_018019	GCG	2	6	257587	257592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399813
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4049	NC_018019	AGG	2	6	257693	257698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399813
4050	NC_018019	TCT	2	6	257722	257727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399813
4051	NC_018019	GA	3	6	257914	257919	50 %	0 %	50 %	0 %	392399813
4052	NC_018019	GGC	2	6	257934	257939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399813
4053	NC_018019	CTT	2	6	257993	257998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399813
4054	NC_018019	GA	3	6	258017	258022	50 %	0 %	50 %	0 %	392399813
4055	NC_018019	CGA	2	6	258193	258198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399813
4056	NC_018019	GAT	2	6	258207	258212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399813
4057	NC_018019	TGA	2	6	258245	258250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399813
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4059	NC_018019	TTCG	2	8	258348	258355	0 %	50 %	25 %	25 %	392399813
4060	NC_018019	CTT	2	6	258356	258361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399813
4061	NC_018019	CTT	2	6	258368	258373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399813
4062	NC_018019	GCCA	2	8	258395	258402	25 %	0 %	25 %	50 %	392399813
4063	NC_018019	CAT	2	6	258411	258416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399813
4064	NC_018019	GTCT	2	8	258435	258442	0 %	50 %	25 %	25 %	392399813
4065	NC_018019	GTC	2	6	258462	258467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399813
4066	NC_018019	GGTGTC	2	12	258510	258521	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392399813
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4072	NC_018019	TTG	2	6	258729	258734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399813
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4075	NC_018019	CGA	2	6	259355	259360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399814
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4087	NC_018019	GTG	2	6	259987	259992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399814
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4091	NC_018019	TAC	2	6	260399	260404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399815
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4094	NC_018019	GCTG	2	8	260604	260611	0 %	25 %	50 %	25 %	392399815
4095	NC_018019	AGC	2	6	260723	260728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399816
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4101	NC_018019	GTG	2	6	260830	260835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
4102	NC_018019	TGG	2	6	260939	260944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
4103	NC_018019	CAG	2	6	260960	260965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399816
4104	NC_018019	GGTGT	2	10	260998	261007	0 %	40 %	60 %	0 %	392399816
4105	NC_018019	GTC	2	6	261016	261021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399816
4106	NC_018019	G	6	6	261046	261051	0 %	0 %	100 %	0 %	392399816
4107	NC_018019	CTG	2	6	261080	261085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399816
4108	NC_018019	CTG	2	6	261191	261196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399816
4109	NC_018019	CGGGG	2	10	261239	261248	0 %	0 %	80 %	20 %	392399816
4110	NC_018019	TGG	2	6	261345	261350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
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4113	NC_018019	T	6	6	261463	261468	0 %	100 %	0 %	0 %	392399816
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4116	NC_018019	TAGA	2	8	261608	261615	50 %	25 %	25 %	0 %	392399816
4117	NC_018019	CCA	2	6	261662	261667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399816
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4121	NC_018019	GAACCA	2	12	261775	261786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392399816
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4237	NC_018019	ACCA	2	8	268537	268544	50 %	0 %	0 %	50 %	392399822
4238	NC_018019	TCG	2	6	268564	268569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399822
4239	NC_018019	CGTC	2	8	268583	268590	0 %	25 %	25 %	50 %	392399822
4240	NC_018019	TCT	2	6	268591	268596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399822
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4242	NC_018019	TCG	3	9	268660	268668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399822
4243	NC_018019	GCA	2	6	268689	268694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399822
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4245	NC_018019	CGC	2	6	268859	268864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399822
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4484	NC_018019	A	6	6	281065	281070	100 %	0 %	0 %	0 %	392399837
4485	NC_018019	ACCA	2	8	281093	281100	50 %	0 %	0 %	50 %	392399838
4486	NC_018019	GC	3	6	281185	281190	0 %	0 %	50 %	50 %	392399838
4487	NC_018019	TG	3	6	281207	281212	0 %	50 %	50 %	0 %	392399838
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4491	NC_018019	CAA	2	6	281254	281259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399838
4492	NC_018019	GCA	2	6	281330	281335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399838
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4496	NC_018019	TATT	2	8	281464	281471	25 %	75 %	0 %	0 %	392399838
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