MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 35774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018019	CCG	2	6	311036	311041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399865
5003	NC_018019	ACT	2	6	311061	311066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399865
5004	NC_018019	ATC	2	6	311183	311188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399865
5005	NC_018019	GATG	2	8	311265	311272	25 %	25 %	50 %	0 %	392399865
5006	NC_018019	GCT	2	6	311275	311280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399865
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5013	NC_018019	CAT	2	6	311637	311642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399865
5014	NC_018019	GAG	2	6	311755	311760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399865
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5021	NC_018019	AAG	2	6	313283	313288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399866
5022	NC_018019	AAC	2	6	313289	313294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399866
5023	NC_018019	GTT	2	6	313298	313303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399866
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5030	NC_018019	CGA	2	6	313598	313603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399867
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5039	NC_018019	TTGAGG	2	12	313906	313917	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392399867
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5043	NC_018019	CGG	2	6	314168	314173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399867
5044	NC_018019	AGGTTG	2	12	314242	314253	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392399867
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5053	NC_018019	TGC	2	6	314957	314962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399868
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5092	NC_018019	TGGCG	2	10	317066	317075	0 %	20 %	60 %	20 %	392399870
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5102	NC_018019	AT	3	6	317711	317716	50 %	50 %	0 %	0 %	392399871
5103	NC_018019	ACT	2	6	317746	317751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399871
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5112	NC_018019	GAT	2	6	318096	318101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399871
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5122	NC_018019	GGC	2	6	318913	318918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399872
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5124	NC_018019	GC	3	6	318957	318962	0 %	0 %	50 %	50 %	392399872
5125	NC_018019	GCA	2	6	319078	319083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399872
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5134	NC_018019	GAG	2	6	319571	319576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399872
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5230	NC_018019	GAT	2	6	325181	325186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399877
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5240	NC_018019	GC	3	6	325734	325739	0 %	0 %	50 %	50 %	392399878
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5362	NC_018019	CAA	2	6	332077	332082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399882
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5364	NC_018019	TGA	2	6	332134	332139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399882
5365	NC_018019	TGC	2	6	332160	332165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5366	NC_018019	ACCA	2	8	332180	332187	50 %	0 %	0 %	50 %	392399882
5367	NC_018019	CTT	2	6	332303	332308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399882
5368	NC_018019	ATC	2	6	332351	332356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399882
5369	NC_018019	GGA	2	6	332446	332451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399882
5370	NC_018019	TGG	2	6	332553	332558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399882
5371	NC_018019	CTG	2	6	332606	332611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5372	NC_018019	GAT	3	9	332720	332728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399882
5373	NC_018019	GAT	2	6	332749	332754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399882
5374	NC_018019	GTT	2	6	332828	332833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399882
5375	NC_018019	CAT	2	6	332890	332895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399882
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5377	NC_018019	TTGG	3	12	332955	332966	0 %	50 %	50 %	0 %	392399882
5378	NC_018019	CTG	2	6	332967	332972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5379	NC_018019	GCT	2	6	333013	333018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5380	NC_018019	ACG	2	6	333042	333047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5381	NC_018019	CTG	2	6	333051	333056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5382	NC_018019	CCT	2	6	333112	333117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399882
5383	NC_018019	TGG	2	6	333153	333158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399882
5384	NC_018019	TACATG	2	12	333230	333241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392399882
5385	NC_018019	CAC	2	6	333251	333256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399882
5386	NC_018019	TGA	2	6	333262	333267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399882
5387	NC_018019	CACG	2	8	333275	333282	25 %	0 %	25 %	50 %	392399882
5388	NC_018019	CAG	2	6	333311	333316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5389	NC_018019	GGT	2	6	333323	333328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399882
5390	NC_018019	TGA	2	6	333430	333435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399882
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5392	NC_018019	TTCT	2	8	333561	333568	0 %	75 %	0 %	25 %	392399882
5393	NC_018019	GAC	2	6	333605	333610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5394	NC_018019	CGA	2	6	333655	333660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399882
5395	NC_018019	CTT	2	6	333805	333810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399883
5396	NC_018019	CGA	2	6	333811	333816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399883
5397	NC_018019	CGA	2	6	333841	333846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399883
5398	NC_018019	TCG	2	6	333850	333855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399883
5399	NC_018019	GCGA	2	8	333933	333940	25 %	0 %	50 %	25 %	392399883
5400	NC_018019	CAT	2	6	334006	334011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399883
5401	NC_018019	CGTCT	2	10	334122	334131	0 %	40 %	20 %	40 %	392399883
5402	NC_018019	CAT	2	6	334171	334176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399883
5403	NC_018019	CAT	2	6	334192	334197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399883
5404	NC_018019	GACCA	2	10	334229	334238	40 %	0 %	20 %	40 %	392399883
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5412	NC_018019	TGA	2	6	334498	334503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399883
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5420	NC_018019	CAA	2	6	334840	334845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399883
5421	NC_018019	ATC	2	6	334883	334888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399883
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5424	NC_018019	GTC	2	6	334953	334958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399883
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5481	NC_018019	CCTGGG	2	12	338208	338219	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392399884
5482	NC_018019	CTT	2	6	338242	338247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399884
5483	NC_018019	TCC	2	6	338256	338261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399884
5484	NC_018019	TGG	2	6	338264	338269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399884
5485	NC_018019	GTC	2	6	338287	338292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399884
5486	NC_018019	TTGGG	2	10	338457	338466	0 %	40 %	60 %	0 %	392399884
5487	NC_018019	ATT	2	6	338482	338487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399884
5488	NC_018019	ATC	3	9	338488	338496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399884
5489	NC_018019	TGG	2	6	338509	338514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399884
5490	NC_018019	GGA	2	6	338553	338558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399884
5491	NC_018019	GC	3	6	338562	338567	0 %	0 %	50 %	50 %	392399884
5492	NC_018019	AGCTG	2	10	338571	338580	20 %	20 %	40 %	20 %	392399884
5493	NC_018019	GCG	2	6	338581	338586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399884
5494	NC_018019	AGAA	2	8	338592	338599	75 %	0 %	25 %	0 %	392399884
5495	NC_018019	GC	3	6	338608	338613	0 %	0 %	50 %	50 %	392399884
5496	NC_018019	GTA	2	6	338647	338652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399884
5497	NC_018019	GCAG	2	8	338658	338665	25 %	0 %	50 %	25 %	392399884
5498	NC_018019	GAA	2	6	338685	338690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399884
5499	NC_018019	GA	3	6	338781	338786	50 %	0 %	50 %	0 %	392399884
5500	NC_018019	AGGC	2	8	338844	338851	25 %	0 %	50 %	25 %	392399884

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