MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SW3

Total Repeats: 645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017952	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	389858575
2	NC_017952	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	389858576
3	NC_017952	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	389858576
4	NC_017952	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	389858576
5	NC_017952	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	389858576
6	NC_017952	GTCTT	2	10	5819	5828	0 %	60 %	20 %	20 %	389858577
7	NC_017952	TGGTA	2	10	8291	8300	20 %	40 %	40 %	0 %	389858579
8	NC_017952	CGAAA	2	10	9699	9708	60 %	0 %	20 %	20 %	389858580
9	NC_017952	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	389858581
10	NC_017952	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	389858582
11	NC_017952	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	389858582
12	NC_017952	AAAGA	2	10	13792	13801	80 %	0 %	20 %	0 %	389858583
13	NC_017952	GGTGT	2	10	13896	13905	0 %	40 %	60 %	0 %	389858583
14	NC_017952	GATTT	2	10	15639	15648	20 %	60 %	20 %	0 %	389858585
15	NC_017952	CGTTC	2	10	16750	16759	0 %	40 %	20 %	40 %	389858586
16	NC_017952	GCTTC	2	10	17123	17132	0 %	40 %	20 %	40 %	389858586
17	NC_017952	GAAGG	2	10	17494	17503	40 %	0 %	60 %	0 %	389858586
18	NC_017952	GTTGT	2	10	20920	20929	0 %	60 %	40 %	0 %	389858589
19	NC_017952	AAGAT	2	10	22032	22041	60 %	20 %	20 %	0 %	389858590
20	NC_017952	TTTGC	2	10	22643	22652	0 %	60 %	20 %	20 %	389858590
21	NC_017952	GGAAA	2	10	24397	24406	60 %	0 %	40 %	0 %	389858590
22	NC_017952	AGAGG	2	10	26122	26131	40 %	0 %	60 %	0 %	389858591
23	NC_017952	GGAGA	2	10	27901	27910	40 %	0 %	60 %	0 %	389858592
24	NC_017952	ATCCG	2	10	28652	28661	20 %	20 %	20 %	40 %	389858594
25	NC_017952	AGGGT	2	10	29170	29179	20 %	20 %	60 %	0 %	389858594
26	NC_017952	CCTAT	2	10	30210	30219	20 %	40 %	0 %	40 %	389858595
27	NC_017952	AAGGA	2	10	31010	31019	60 %	0 %	40 %	0 %	389858596
28	NC_017952	GAGCT	2	10	32049	32058	20 %	20 %	40 %	20 %	389858597
29	NC_017952	TCAGT	2	10	36289	36298	20 %	40 %	20 %	20 %	389858603
30	NC_017952	CTATT	2	10	36723	36732	20 %	60 %	0 %	20 %	389858603
31	NC_017952	TCCTA	2	10	36770	36779	20 %	40 %	0 %	40 %	389858603
32	NC_017952	ACGAT	2	10	38686	38695	40 %	20 %	20 %	20 %	389858604
33	NC_017952	TTTGA	2	10	39051	39060	20 %	60 %	20 %	0 %	389858604
34	NC_017952	AGCAA	2	10	42701	42710	60 %	0 %	20 %	20 %	389858607
35	NC_017952	CGATG	2	10	42758	42767	20 %	20 %	40 %	20 %	389858607
36	NC_017952	TTTAT	2	10	44831	44840	20 %	80 %	0 %	0 %	389858611
37	NC_017952	CTTTC	2	10	46928	46937	0 %	60 %	0 %	40 %	389858613
38	NC_017952	AGTTT	2	10	47467	47476	20 %	60 %	20 %	0 %	389858613
39	NC_017952	CTTTT	2	10	50630	50639	0 %	80 %	0 %	20 %	389858616
40	NC_017952	CCGTA	2	10	54512	54521	20 %	20 %	20 %	40 %	389858619
41	NC_017952	TTATC	2	10	55921	55930	20 %	60 %	0 %	20 %	389858620
42	NC_017952	TGAGT	2	10	55942	55951	20 %	40 %	40 %	0 %	389858620
43	NC_017952	GTTGT	2	10	56989	56998	0 %	60 %	40 %	0 %	389858621
44	NC_017952	GAGCA	2	10	60437	60446	40 %	0 %	40 %	20 %	389858623
45	NC_017952	TGTGA	2	10	62886	62895	20 %	40 %	40 %	0 %	389858625
46	NC_017952	AGTGA	2	10	64407	64416	40 %	20 %	40 %	0 %	389858626
47	NC_017952	CCTTC	2	10	64681	64690	0 %	40 %	0 %	60 %	389858626
48	NC_017952	AGGAG	2	10	66909	66918	40 %	0 %	60 %	0 %	389858628
49	NC_017952	GTTAA	2	10	67039	67048	40 %	40 %	20 %	0 %	389858628
50	NC_017952	GGAGC	2	10	70287	70296	20 %	0 %	60 %	20 %	389858631
51	NC_017952	GCGAT	2	10	70477	70486	20 %	20 %	40 %	20 %	389858631
52	NC_017952	CTCTT	2	10	70831	70840	0 %	60 %	0 %	40 %	389858631
53	NC_017952	AGGGG	2	10	71477	71486	20 %	0 %	80 %	0 %	389858631
54	NC_017952	AAGAA	2	10	71519	71528	80 %	0 %	20 %	0 %	389858631
55	NC_017952	ATTGG	2	10	72809	72818	20 %	40 %	40 %	0 %	389858633
56	NC_017952	GAAAA	2	10	73881	73890	80 %	0 %	20 %	0 %	389858633
57	NC_017952	TGGGA	2	10	74298	74307	20 %	20 %	60 %	0 %	389858634
58	NC_017952	TATTT	2	10	76825	76834	20 %	80 %	0 %	0 %	389858635
59	NC_017952	TGTCT	2	10	80618	80627	0 %	60 %	20 %	20 %	389858638
60	NC_017952	TTACT	2	10	81125	81134	20 %	60 %	0 %	20 %	389858638
61	NC_017952	AGAAA	2	10	82515	82524	80 %	0 %	20 %	0 %	389858640
62	NC_017952	GGAAG	2	10	83028	83037	40 %	0 %	60 %	0 %	389858640
63	NC_017952	AGCGA	2	10	85494	85503	40 %	0 %	40 %	20 %	389858642
64	NC_017952	GATCC	2	10	86579	86588	20 %	20 %	20 %	40 %	389858643
65	NC_017952	AGAGC	2	10	87914	87923	40 %	0 %	40 %	20 %	389858644
66	NC_017952	TTTTC	2	10	91646	91655	0 %	80 %	0 %	20 %	389858647
67	NC_017952	GGATG	2	10	91906	91915	20 %	20 %	60 %	0 %	389858648
68	NC_017952	CAACA	2	10	93445	93454	60 %	0 %	0 %	40 %	389858649
69	NC_017952	ACAGC	2	10	94489	94498	40 %	0 %	20 %	40 %	389858651
70	NC_017952	GGAAC	2	10	95202	95211	40 %	0 %	40 %	20 %	389858652
71	NC_017952	GGATT	2	10	96102	96111	20 %	40 %	40 %	0 %	389858652
72	NC_017952	CAATC	2	10	97198	97207	40 %	20 %	0 %	40 %	389858654
73	NC_017952	TTTGC	2	10	97332	97341	0 %	60 %	20 %	20 %	389858654
74	NC_017952	ATTCA	2	10	97596	97605	40 %	40 %	0 %	20 %	389858654
75	NC_017952	GATCC	2	10	97855	97864	20 %	20 %	20 %	40 %	389858654
76	NC_017952	GTTTT	2	10	98276	98285	0 %	80 %	20 %	0 %	389858654
77	NC_017952	AAGCT	2	10	99479	99488	40 %	20 %	20 %	20 %	389858655
78	NC_017952	AGGGG	2	10	99838	99847	20 %	0 %	80 %	0 %	389858655
79	NC_017952	ATAGC	2	10	100537	100546	40 %	20 %	20 %	20 %	389858656
80	NC_017952	TTCCC	2	10	101141	101150	0 %	40 %	0 %	60 %	389858657
81	NC_017952	AGCGA	2	10	103465	103474	40 %	0 %	40 %	20 %	389858659
82	NC_017952	TTTCT	2	10	103823	103832	0 %	80 %	0 %	20 %	389858659
83	NC_017952	CTTCT	2	10	103877	103886	0 %	60 %	0 %	40 %	389858659
84	NC_017952	ATCAT	2	10	105029	105038	40 %	40 %	0 %	20 %	389858660
85	NC_017952	GGCAT	2	10	105737	105746	20 %	20 %	40 %	20 %	389858660
86	NC_017952	AAAGC	2	10	109463	109472	60 %	0 %	20 %	20 %	389858663
87	NC_017952	GCATT	2	10	110623	110632	20 %	40 %	20 %	20 %	389858665
88	NC_017952	TGTTT	2	10	115300	115309	0 %	80 %	20 %	0 %	389858668
89	NC_017952	CATGT	2	10	115678	115687	20 %	40 %	20 %	20 %	389858668
90	NC_017952	TATCG	2	10	116382	116391	20 %	40 %	20 %	20 %	389858668
91	NC_017952	TTTCT	2	10	116898	116907	0 %	80 %	0 %	20 %	389858669
92	NC_017952	AAAGA	2	10	119143	119152	80 %	0 %	20 %	0 %	389858671
93	NC_017952	GCTTC	2	10	123133	123142	0 %	40 %	20 %	40 %	389858674
94	NC_017952	TACAA	2	10	126922	126931	60 %	20 %	0 %	20 %	389858678
95	NC_017952	ATCCA	2	10	129330	129339	40 %	20 %	0 %	40 %	389858681
96	NC_017952	GAAGA	2	10	130880	130889	60 %	0 %	40 %	0 %	389858681
97	NC_017952	AAAAG	2	10	132793	132802	80 %	0 %	20 %	0 %	389858682
98	NC_017952	GATTC	2	10	133124	133133	20 %	40 %	20 %	20 %	389858682
99	NC_017952	ATTGG	2	10	136409	136418	20 %	40 %	40 %	0 %	389858685
100	NC_017952	TGTTT	2	10	136868	136877	0 %	80 %	20 %	0 %	389858686
101	NC_017952	TCCAG	2	10	140614	140623	20 %	20 %	20 %	40 %	389858692
102	NC_017952	GTACA	2	10	141345	141354	40 %	20 %	20 %	20 %	389858693
103	NC_017952	TAGAT	2	10	141718	141727	40 %	40 %	20 %	0 %	389858693
104	NC_017952	AAAAC	2	10	142610	142619	80 %	0 %	0 %	20 %	389858694
105	NC_017952	TGCTA	2	10	143696	143705	20 %	40 %	20 %	20 %	389858696
106	NC_017952	GGAGC	2	10	143743	143752	20 %	0 %	60 %	20 %	389858696
107	NC_017952	CTGGG	2	10	145157	145166	0 %	20 %	60 %	20 %	389858698
108	NC_017952	GTTTT	2	10	145904	145913	0 %	80 %	20 %	0 %	389858699
109	NC_017952	GAACC	2	10	149638	149647	40 %	0 %	20 %	40 %	389858700
110	NC_017952	ATTCT	2	10	153137	153146	20 %	60 %	0 %	20 %	389858704
111	NC_017952	CTGTG	2	10	153341	153350	0 %	40 %	40 %	20 %	389858704
112	NC_017952	TTCTT	2	10	155814	155823	0 %	80 %	0 %	20 %	389858707
113	NC_017952	AGGAA	2	10	160372	160381	60 %	0 %	40 %	0 %	389858711
114	NC_017952	AGAGA	2	10	163603	163612	60 %	0 %	40 %	0 %	389858714
115	NC_017952	AGCAA	2	10	164038	164047	60 %	0 %	20 %	20 %	389858714
116	NC_017952	CAAAA	2	10	167541	167550	80 %	0 %	0 %	20 %	389858716
117	NC_017952	AAGAG	2	10	168374	168383	60 %	0 %	40 %	0 %	389858716
118	NC_017952	GATTG	2	10	168719	168728	20 %	40 %	40 %	0 %	389858716
119	NC_017952	GTTTT	2	10	175201	175210	0 %	80 %	20 %	0 %	389858720
120	NC_017952	TATTG	2	10	175224	175233	20 %	60 %	20 %	0 %	389858720
121	NC_017952	CAGCA	2	10	175583	175592	40 %	0 %	20 %	40 %	389858720
122	NC_017952	TAGGA	2	10	175888	175897	40 %	20 %	40 %	0 %	389858721
123	NC_017952	TGATT	2	10	177815	177824	20 %	60 %	20 %	0 %	389858722
124	NC_017952	TCAAT	2	10	178456	178465	40 %	40 %	0 %	20 %	389858722
125	NC_017952	TTTTC	2	10	178495	178504	0 %	80 %	0 %	20 %	389858722
126	NC_017952	GGAAT	2	10	180055	180064	40 %	20 %	40 %	0 %	389858723
127	NC_017952	AGAGT	2	10	181013	181022	40 %	20 %	40 %	0 %	389858724
128	NC_017952	TTGAA	2	10	181546	181555	40 %	40 %	20 %	0 %	389858725
129	NC_017952	AGAGA	2	10	185228	185237	60 %	0 %	40 %	0 %	389858727
130	NC_017952	ACGAT	2	10	187301	187310	40 %	20 %	20 %	20 %	389858729
131	NC_017952	GGATC	2	10	190391	190400	20 %	20 %	40 %	20 %	389858732
132	NC_017952	CAGAT	2	10	190506	190515	40 %	20 %	20 %	20 %	389858732
133	NC_017952	ACGAT	2	10	191425	191434	40 %	20 %	20 %	20 %	389858733
134	NC_017952	TTGTA	2	10	192403	192412	20 %	60 %	20 %	0 %	389858733
135	NC_017952	AAAAG	2	10	193103	193112	80 %	0 %	20 %	0 %	389858734
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