MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SW3

Total Repeats: 20058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017952	GAG	2	6	28951	28956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858594
503	NC_017952	TG	3	6	28983	28988	0 %	50 %	50 %	0 %	389858594
504	NC_017952	GCA	2	6	29007	29012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858594
505	NC_017952	TC	3	6	29036	29041	0 %	50 %	0 %	50 %	389858594
506	NC_017952	AGGGT	2	10	29170	29179	20 %	20 %	60 %	0 %	389858594
507	NC_017952	TTC	2	6	29206	29211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858594
508	NC_017952	CAG	2	6	29218	29223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858594
509	NC_017952	GAA	2	6	29232	29237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858594
510	NC_017952	TGA	2	6	29246	29251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858594
511	NC_017952	TTC	2	6	29279	29284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858594
512	NC_017952	GC	4	8	29450	29457	0 %	0 %	50 %	50 %	389858594
513	NC_017952	AAG	2	6	29458	29463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858594
514	NC_017952	TA	3	6	29572	29577	50 %	50 %	0 %	0 %	389858594
515	NC_017952	GAA	2	6	29661	29666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858594
516	NC_017952	TGT	2	6	29693	29698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858595
517	NC_017952	TCT	2	6	29761	29766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858595
518	NC_017952	ACA	2	6	29989	29994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858595
519	NC_017952	ATG	2	6	29999	30004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858595
520	NC_017952	CTTT	2	8	30141	30148	0 %	75 %	0 %	25 %	389858595
521	NC_017952	TTTG	2	8	30156	30163	0 %	75 %	25 %	0 %	389858595
522	NC_017952	TTGT	2	8	30191	30198	0 %	75 %	25 %	0 %	389858595
523	NC_017952	CCTAT	2	10	30210	30219	20 %	40 %	0 %	40 %	389858595
524	NC_017952	T	6	6	30226	30231	0 %	100 %	0 %	0 %	389858595
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527	NC_017952	T	8	8	30460	30467	0 %	100 %	0 %	0 %	389858595
528	NC_017952	ATG	2	6	30485	30490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858595
529	NC_017952	GA	3	6	30523	30528	50 %	0 %	50 %	0 %	389858595
530	NC_017952	AG	3	6	30621	30626	50 %	0 %	50 %	0 %	389858596
531	NC_017952	GTT	2	6	30702	30707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858596
532	NC_017952	GAA	2	6	30711	30716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858596
533	NC_017952	TC	3	6	30730	30735	0 %	50 %	0 %	50 %	389858596
534	NC_017952	TCT	2	6	30777	30782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858596
535	NC_017952	ACT	2	6	30867	30872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858596
536	NC_017952	TTC	2	6	30895	30900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858596
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538	NC_017952	CCT	2	6	30931	30936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858596
539	NC_017952	AAAC	2	8	30984	30991	75 %	0 %	0 %	25 %	389858596
540	NC_017952	T	6	6	31001	31006	0 %	100 %	0 %	0 %	389858596
541	NC_017952	AAGGA	2	10	31010	31019	60 %	0 %	40 %	0 %	389858596
542	NC_017952	GGC	2	6	31037	31042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389858596
543	NC_017952	GAT	2	6	31116	31121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858596
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545	NC_017952	TAG	2	6	31138	31143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858596
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547	NC_017952	TAA	2	6	31322	31327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858596
548	NC_017952	GA	3	6	31351	31356	50 %	0 %	50 %	0 %	389858596
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550	NC_017952	TCG	2	6	31544	31549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858596
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553	NC_017952	GAA	2	6	31623	31628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858596
554	NC_017952	ATT	2	6	31659	31664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858596
555	NC_017952	ATG	2	6	31782	31787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858596
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559	NC_017952	A	7	7	31842	31848	100 %	0 %	0 %	0 %	389858596
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561	NC_017952	TGT	2	6	31909	31914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858597
562	NC_017952	T	6	6	32028	32033	0 %	100 %	0 %	0 %	389858597
563	NC_017952	GAGCT	2	10	32049	32058	20 %	20 %	40 %	20 %	389858597
564	NC_017952	A	6	6	32123	32128	100 %	0 %	0 %	0 %	389858597
565	NC_017952	A	6	6	32154	32159	100 %	0 %	0 %	0 %	389858597
566	NC_017952	TGC	2	6	32182	32187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858597
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569	NC_017952	TC	3	6	32245	32250	0 %	50 %	0 %	50 %	389858598
570	NC_017952	AAG	2	6	32449	32454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858598
571	NC_017952	AAG	2	6	32456	32461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858598
572	NC_017952	CTT	2	6	32495	32500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858598
573	NC_017952	CGT	2	6	32526	32531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858598
574	NC_017952	TGA	2	6	32572	32577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858598
575	NC_017952	GAG	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858598
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600	NC_017952	AG	3	6	34367	34372	50 %	0 %	50 %	0 %	389858600
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607	NC_017952	TTA	2	6	34666	34671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858601
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612	NC_017952	AAGA	3	12	34859	34870	75 %	0 %	25 %	0 %	389858601
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