MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 258 chromosome

Total Repeats: 27601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017945	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
2	NC_017945	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
3	NC_017945	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849361
4	NC_017945	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
5	NC_017945	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849361
6	NC_017945	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849361
7	NC_017945	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849361
8	NC_017945	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
9	NC_017945	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
10	NC_017945	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849361
11	NC_017945	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
12	NC_017945	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
13	NC_017945	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389849361
14	NC_017945	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
15	NC_017945	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
16	NC_017945	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849361
17	NC_017945	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849361
18	NC_017945	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849361
19	NC_017945	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849361
20	NC_017945	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849361
21	NC_017945	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
22	NC_017945	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
23	NC_017945	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
24	NC_017945	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849361
25	NC_017945	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
26	NC_017945	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
27	NC_017945	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849361
28	NC_017945	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849362
29	NC_017945	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849363
30	NC_017945	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849363
31	NC_017945	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849363
32	NC_017945	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849363
33	NC_017945	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849363
34	NC_017945	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849363
35	NC_017945	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849363
36	NC_017945	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849363
37	NC_017945	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849363
38	NC_017945	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849364
39	NC_017945	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849364
40	NC_017945	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849364
41	NC_017945	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849364
42	NC_017945	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849364
43	NC_017945	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849364
44	NC_017945	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849364
45	NC_017945	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849364
46	NC_017945	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849364
47	NC_017945	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849365
48	NC_017945	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849365
49	NC_017945	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849365
50	NC_017945	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849365
51	NC_017945	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849365
52	NC_017945	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849365
53	NC_017945	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849365
54	NC_017945	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849366
55	NC_017945	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849366
56	NC_017945	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849366
57	NC_017945	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849366
58	NC_017945	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849366
59	NC_017945	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
60	NC_017945	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
61	NC_017945	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
62	NC_017945	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
63	NC_017945	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
64	NC_017945	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849366
65	NC_017945	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
66	NC_017945	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
67	NC_017945	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
68	NC_017945	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849366
69	NC_017945	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849366
70	NC_017945	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849366
71	NC_017945	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849366
72	NC_017945	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
73	NC_017945	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849366
74	NC_017945	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
75	NC_017945	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849366
76	NC_017945	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849366
77	NC_017945	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
78	NC_017945	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849366
79	NC_017945	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
80	NC_017945	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
81	NC_017945	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
82	NC_017945	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
83	NC_017945	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849367
84	NC_017945	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849367
85	NC_017945	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849367
86	NC_017945	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849367
87	NC_017945	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849367
88	NC_017945	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849367
89	NC_017945	ATT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849368
90	NC_017945	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849369
91	NC_017945	TGT	2	6	8593	8598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849369
92	NC_017945	CTG	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849369
93	NC_017945	TGC	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849369
94	NC_017945	GTC	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849369
95	NC_017945	GCG	2	6	8724	8729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849370
96	NC_017945	TGA	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849370
97	NC_017945	GCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849370
98	NC_017945	CGA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849371
99	NC_017945	GCG	2	6	9102	9107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849371
100	NC_017945	GAG	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849371
101	NC_017945	CCG	2	6	9235	9240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849371
102	NC_017945	ACG	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849371
103	NC_017945	CGC	2	6	9451	9456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849371
104	NC_017945	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849371
105	NC_017945	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849371
106	NC_017945	TCT	2	6	9681	9686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849371
107	NC_017945	GAA	3	9	9857	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849371
108	NC_017945	ACA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849371
109	NC_017945	TGC	2	6	10158	10163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849371
110	NC_017945	TTA	2	6	10165	10170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849371
111	NC_017945	TCG	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849371
112	NC_017945	GAA	2	6	10220	10225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849371
113	NC_017945	CGA	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849371
114	NC_017945	AGA	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849371
115	NC_017945	CGT	2	6	10556	10561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849371
116	NC_017945	ATT	2	6	10568	10573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849371
117	NC_017945	GAA	2	6	10595	10600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849371
118	NC_017945	GTG	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849371
119	NC_017945	CGT	2	6	10688	10693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849371
120	NC_017945	CTT	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849371
121	NC_017945	AAG	2	6	10973	10978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849371
122	NC_017945	GGT	2	6	11012	11017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849371
123	NC_017945	GAA	2	6	11039	11044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849371
124	NC_017945	ATG	2	6	11076	11081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849371
125	NC_017945	GCT	2	6	11086	11091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849371
126	NC_017945	GAA	2	6	11102	11107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849371
127	NC_017945	TGA	3	9	11131	11139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849371
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129	NC_017945	GCT	2	6	11206	11211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849371
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500	NC_017945	CAG	2	6	38461	38466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849401

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