MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 36426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017730	AG	3	6	194213	194218	50 %	0 %	50 %	0 %	386739537
3003	NC_017730	GGC	2	6	194254	194259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739537
3004	NC_017730	GCA	2	6	194280	194285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739537
3005	NC_017730	AAG	2	6	194287	194292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739537
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3007	NC_017730	TTG	2	6	194382	194387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739537
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3009	NC_017730	A	6	6	194492	194497	100 %	0 %	0 %	0 %	386739537
3010	NC_017730	ACG	2	6	194547	194552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739537
3011	NC_017730	GAT	2	6	194574	194579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739537
3012	NC_017730	GCA	2	6	194619	194624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739537
3013	NC_017730	AAC	2	6	194630	194635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739537
3014	NC_017730	TAC	2	6	194652	194657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739537
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3017	NC_017730	CAC	2	6	194767	194772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739537
3018	NC_017730	GCAC	2	8	194879	194886	25 %	0 %	25 %	50 %	386739537
3019	NC_017730	ATG	2	6	194902	194907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739537
3020	NC_017730	CAA	2	6	194968	194973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739537
3021	NC_017730	ACT	2	6	194999	195004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739537
3022	NC_017730	TGC	2	6	195073	195078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739537
3023	NC_017730	AGG	2	6	195081	195086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739537
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3025	NC_017730	GCCA	2	8	195217	195224	25 %	0 %	25 %	50 %	386739537
3026	NC_017730	GCAGT	2	10	195261	195270	20 %	20 %	40 %	20 %	386739537
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3028	NC_017730	CCAG	2	8	195391	195398	25 %	0 %	25 %	50 %	386739537
3029	NC_017730	CAC	2	6	195454	195459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739537
3030	NC_017730	TGC	3	9	195478	195486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739537
3031	NC_017730	CAATG	2	10	195532	195541	40 %	20 %	20 %	20 %	386739537
3032	NC_017730	CTG	2	6	195542	195547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739537
3033	NC_017730	CTA	2	6	195570	195575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739537
3034	NC_017730	CAT	2	6	195598	195603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739537
3035	NC_017730	A	6	6	195648	195653	100 %	0 %	0 %	0 %	386739537
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3042	NC_017730	CCA	2	6	195933	195938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739538
3043	NC_017730	CTGC	2	8	196147	196154	0 %	25 %	25 %	50 %	386739538
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3055	NC_017730	GAG	2	6	197002	197007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739540
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3061	NC_017730	CA	3	6	197209	197214	50 %	0 %	0 %	50 %	386739540
3062	NC_017730	AGCC	2	8	197230	197237	25 %	0 %	25 %	50 %	386739540
3063	NC_017730	GCA	2	6	197247	197252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739540
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3105	NC_017730	CTCA	2	8	199377	199384	25 %	25 %	0 %	50 %	386739542
3106	NC_017730	TAC	2	6	199406	199411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739542
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3108	NC_017730	CG	3	6	199506	199511	0 %	0 %	50 %	50 %	386739542
3109	NC_017730	TGG	2	6	199529	199534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739542
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3111	NC_017730	TTAA	2	8	199594	199601	50 %	50 %	0 %	0 %	386739542
3112	NC_017730	TCA	2	6	199639	199644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739542
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3115	NC_017730	GGCCC	2	10	199906	199915	0 %	0 %	40 %	60 %	386739543
3116	NC_017730	TGA	2	6	199962	199967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739543
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3119	NC_017730	GAT	2	6	200199	200204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739544
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3121	NC_017730	ATC	2	6	200314	200319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739544
3122	NC_017730	ATC	2	6	200374	200379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739544
3123	NC_017730	AAT	2	6	200394	200399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386739544
3124	NC_017730	TGG	2	6	200408	200413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739544
3125	NC_017730	AGG	2	6	200429	200434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739544
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3130	NC_017730	GTC	2	6	200651	200656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739545
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3190	NC_017730	GAATT	2	10	203471	203480	40 %	40 %	20 %	0 %	386739548
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3201	NC_017730	AT	3	6	204133	204138	50 %	50 %	0 %	0 %	386739548
3202	NC_017730	CAT	2	6	204227	204232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739548
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3225	NC_017730	GCA	2	6	205294	205299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739548
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3228	NC_017730	GAAG	2	8	205404	205411	50 %	0 %	50 %	0 %	386739548
3229	NC_017730	CGT	2	6	205451	205456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739548
3230	NC_017730	TCA	2	6	205496	205501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739548
3231	NC_017730	T	7	7	205526	205532	0 %	100 %	0 %	0 %	386739548
3232	NC_017730	GAG	2	6	205584	205589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739548
3233	NC_017730	AGCT	2	8	205623	205630	25 %	25 %	25 %	25 %	386739548
3234	NC_017730	CAG	2	6	205703	205708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739548
3235	NC_017730	CAG	2	6	205743	205748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739548
3236	NC_017730	CAGC	2	8	205751	205758	25 %	0 %	25 %	50 %	386739548
3237	NC_017730	TC	3	6	205773	205778	0 %	50 %	0 %	50 %	386739548
3238	NC_017730	CAGC	2	8	205820	205827	25 %	0 %	25 %	50 %	386739548
3239	NC_017730	GCT	2	6	206078	206083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739549
3240	NC_017730	GGA	2	6	206152	206157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739549
3241	NC_017730	CGCC	2	8	206203	206210	0 %	0 %	25 %	75 %	386739549
3242	NC_017730	AGC	2	6	206262	206267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739549
3243	NC_017730	CA	4	8	206278	206285	50 %	0 %	0 %	50 %	386739549
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3352	NC_017730	TGA	2	6	213457	213462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739554
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3357	NC_017730	GCT	2	6	214079	214084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739556
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3363	NC_017730	T	7	7	214847	214853	0 %	100 %	0 %	0 %	386739557
3364	NC_017730	GAT	2	6	214931	214936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739557
3365	NC_017730	ACGT	2	8	215005	215012	25 %	25 %	25 %	25 %	386739557
3366	NC_017730	GCG	2	6	215075	215080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739557
3367	NC_017730	TGC	2	6	215105	215110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739557
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3369	NC_017730	ATG	2	6	215164	215169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739557
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3372	NC_017730	GACT	2	8	215368	215375	25 %	25 %	25 %	25 %	386739558
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3374	NC_017730	GCGAC	2	10	215549	215558	20 %	0 %	40 %	40 %	386739558
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3487	NC_017730	CCA	2	6	222435	222440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739567
3488	NC_017730	CAC	2	6	222441	222446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739567
3489	NC_017730	CAC	2	6	222600	222605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739567
3490	NC_017730	CCGAAT	2	12	222647	222658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386739567
3491	NC_017730	GTT	2	6	222689	222694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739567
3492	NC_017730	TC	3	6	222725	222730	0 %	50 %	0 %	50 %	386739567
3493	NC_017730	TC	3	6	222749	222754	0 %	50 %	0 %	50 %	386739567
3494	NC_017730	CCA	2	6	222830	222835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739567
3495	NC_017730	GAT	2	6	222855	222860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739567
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3498	NC_017730	ATGC	2	8	222885	222892	25 %	25 %	25 %	25 %	386739567
3499	NC_017730	AATG	2	8	222934	222941	50 %	25 %	25 %	0 %	386739567
3500	NC_017730	CTC	2	6	222972	222977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386739567

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