MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 267 chromosome

Total Repeats: 38347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017462	GATGGC	2	12	175667	175678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385806613
3003	NC_017462	GGC	2	6	175699	175704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806613
3004	NC_017462	TG	3	6	175711	175716	0 %	50 %	50 %	0 %	385806613
3005	NC_017462	CTGG	2	8	175836	175843	0 %	25 %	50 %	25 %	385806613
3006	NC_017462	TTC	2	6	175866	175871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806613
3007	NC_017462	GC	3	6	175940	175945	0 %	0 %	50 %	50 %	385806613
3008	NC_017462	GCC	2	6	175950	175955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806613
3009	NC_017462	CGT	2	6	175999	176004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806613
3010	NC_017462	CGG	2	6	176021	176026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806613
3011	NC_017462	CAA	2	6	176117	176122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806613
3012	NC_017462	TGT	2	6	176134	176139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806613
3013	NC_017462	CAT	2	6	176255	176260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806613
3014	NC_017462	AT	3	6	176393	176398	50 %	50 %	0 %	0 %	385806613
3015	NC_017462	CGC	2	6	176441	176446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806614
3016	NC_017462	CTA	2	6	176480	176485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806614
3017	NC_017462	CCAT	2	8	176495	176502	25 %	25 %	0 %	50 %	385806614
3018	NC_017462	CGA	2	6	176564	176569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806614
3019	NC_017462	TGGC	2	8	176588	176595	0 %	25 %	50 %	25 %	385806614
3020	NC_017462	CTG	2	6	176631	176636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806614
3021	NC_017462	GCCG	2	8	176658	176665	0 %	0 %	50 %	50 %	385806614
3022	NC_017462	TGG	2	6	176687	176692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806614
3023	NC_017462	AAG	2	6	176701	176706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806614
3024	NC_017462	AGT	2	6	176950	176955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806614
3025	NC_017462	TCG	2	6	176971	176976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806614
3026	NC_017462	CGT	2	6	176993	176998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806614
3027	NC_017462	ACA	2	6	177032	177037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806614
3028	NC_017462	TAA	2	6	177057	177062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385806614
3029	NC_017462	CCA	2	6	177126	177131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806614
3030	NC_017462	CAC	2	6	177201	177206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806614
3031	NC_017462	AAG	2	6	177255	177260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806614
3032	NC_017462	GTC	2	6	177586	177591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806615
3033	NC_017462	TTC	2	6	177606	177611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806615
3034	NC_017462	TCG	2	6	177633	177638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806615
3035	NC_017462	ACG	2	6	177677	177682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806615
3036	NC_017462	GTG	2	6	177688	177693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806615
3037	NC_017462	TAC	2	6	177711	177716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806615
3038	NC_017462	CGA	2	6	177717	177722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806615
3039	NC_017462	GCT	2	6	177723	177728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806615
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3041	NC_017462	CG	3	6	177762	177767	0 %	0 %	50 %	50 %	385806615
3042	NC_017462	CAC	2	6	177885	177890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806615
3043	NC_017462	TGAA	2	8	177950	177957	50 %	25 %	25 %	0 %	385806615
3044	NC_017462	TTG	2	6	177971	177976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806615
3045	NC_017462	GTG	2	6	178028	178033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806615
3046	NC_017462	CGG	2	6	178046	178051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806615
3047	NC_017462	CTG	2	6	178118	178123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806615
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3050	NC_017462	CGTT	2	8	178260	178267	0 %	50 %	25 %	25 %	385806615
3051	NC_017462	CGT	2	6	178268	178273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806615
3052	NC_017462	GGA	2	6	178311	178316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806615
3053	NC_017462	GAA	2	6	178327	178332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806615
3054	NC_017462	TGC	2	6	178550	178555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806615
3055	NC_017462	TCC	2	6	178569	178574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385806615
3056	NC_017462	CAT	2	6	178595	178600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806615
3057	NC_017462	CCCG	2	8	178626	178633	0 %	0 %	25 %	75 %	385806615
3058	NC_017462	ATTGA	2	10	178699	178708	40 %	40 %	20 %	0 %	385806615
3059	NC_017462	TAC	2	6	178710	178715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806615
3060	NC_017462	GCT	2	6	178762	178767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806615
3061	NC_017462	TGG	2	6	178797	178802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806615
3062	NC_017462	AAAT	2	8	178991	178998	75 %	25 %	0 %	0 %	385806616
3063	NC_017462	AG	3	6	179200	179205	50 %	0 %	50 %	0 %	385806617
3064	NC_017462	GA	3	6	179231	179236	50 %	0 %	50 %	0 %	385806617
3065	NC_017462	CTG	2	6	179316	179321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806617
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3068	NC_017462	TTG	2	6	179394	179399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806617
3069	NC_017462	GAA	2	6	179543	179548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806617
3070	NC_017462	ACC	2	6	179573	179578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806617
3071	NC_017462	T	6	6	179642	179647	0 %	100 %	0 %	0 %	385806617
3072	NC_017462	TAC	2	6	179671	179676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806617
3073	NC_017462	TAC	2	6	179683	179688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806617
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3080	NC_017462	CGA	2	6	180103	180108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806617
3081	NC_017462	AGT	2	6	180169	180174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806617
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3083	NC_017462	AGC	2	6	180315	180320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806617
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3085	NC_017462	CCA	2	6	180513	180518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806617
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3087	NC_017462	A	7	7	180683	180689	100 %	0 %	0 %	0 %	385806617
3088	NC_017462	TGG	2	6	180841	180846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806617
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3090	NC_017462	ACT	2	6	180949	180954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806617
3091	NC_017462	GCG	2	6	180999	181004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806617
3092	NC_017462	GAA	2	6	181030	181035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806617
3093	NC_017462	GTGGA	2	10	181108	181117	20 %	20 %	60 %	0 %	385806617
3094	NC_017462	CAG	2	6	181202	181207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806617
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3099	NC_017462	TGC	2	6	181411	181416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806617
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3102	NC_017462	GCT	2	6	181725	181730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806617
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3105	NC_017462	AAG	2	6	181880	181885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806617
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3107	NC_017462	TGA	2	6	182095	182100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806617
3108	NC_017462	CAG	2	6	182276	182281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806617
3109	NC_017462	GAA	2	6	182320	182325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806617
3110	NC_017462	GCAC	2	8	182333	182340	25 %	0 %	25 %	50 %	385806617
3111	NC_017462	TGC	2	6	182371	182376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806617
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3113	NC_017462	TGACTA	2	12	182678	182689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385806618
3114	NC_017462	CGT	2	6	182697	182702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806618
3115	NC_017462	GAG	2	6	182746	182751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806618
3116	NC_017462	T	6	6	182778	182783	0 %	100 %	0 %	0 %	385806618
3117	NC_017462	CTG	2	6	182798	182803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806618
3118	NC_017462	TC	3	6	182869	182874	0 %	50 %	0 %	50 %	385806618
3119	NC_017462	GCA	2	6	182909	182914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806618
3120	NC_017462	GCC	2	6	182944	182949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806618
3121	NC_017462	TGG	2	6	182960	182965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806618
3122	NC_017462	AAC	2	6	183037	183042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806618
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3135	NC_017462	GCT	2	6	183811	183816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806619
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3232	NC_017462	ATGC	2	8	189211	189218	25 %	25 %	25 %	25 %	385806626
3233	NC_017462	GGT	2	6	189219	189224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806626
3234	NC_017462	CA	3	6	189230	189235	50 %	0 %	0 %	50 %	385806626
3235	NC_017462	AC	3	6	189288	189293	50 %	0 %	0 %	50 %	385806626
3236	NC_017462	TG	3	6	189300	189305	0 %	50 %	50 %	0 %	385806626
3237	NC_017462	GGC	2	6	189366	189371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806626
3238	NC_017462	GAC	2	6	189409	189414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806626
3239	NC_017462	AGC	2	6	189452	189457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806626
3240	NC_017462	TTC	2	6	189463	189468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806626
3241	NC_017462	CGGAT	2	10	189524	189533	20 %	20 %	40 %	20 %	385806626
3242	NC_017462	GCG	2	6	189535	189540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806626
3243	NC_017462	CCGC	2	8	189638	189645	0 %	0 %	25 %	75 %	385806626
3244	NC_017462	GCCA	2	8	189675	189682	25 %	0 %	25 %	50 %	385806626
3245	NC_017462	CG	4	8	189826	189833	0 %	0 %	50 %	50 %	385806626
3246	NC_017462	ATTA	2	8	189922	189929	50 %	50 %	0 %	0 %	385806626
3247	NC_017462	TCG	2	6	190033	190038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806627
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3250	NC_017462	CAT	2	6	190238	190243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806627
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3259	NC_017462	CTG	3	9	190650	190658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806627
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3275	NC_017462	A	6	6	191400	191405	100 %	0 %	0 %	0 %	385806628
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3363	NC_017462	TCA	3	9	195824	195832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806631
3364	NC_017462	ACA	2	6	195833	195838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806631
3365	NC_017462	CTA	2	6	195913	195918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806632
3366	NC_017462	T	6	6	195946	195951	0 %	100 %	0 %	0 %	385806632
3367	NC_017462	CTGCCG	2	12	196052	196063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385806632
3368	NC_017462	CT	3	6	196116	196121	0 %	50 %	0 %	50 %	385806632
3369	NC_017462	CAC	2	6	196130	196135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806632
3370	NC_017462	GCA	2	6	196164	196169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806632
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3372	NC_017462	CCA	2	6	196246	196251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806632
3373	NC_017462	CTCA	2	8	196262	196269	25 %	25 %	0 %	50 %	385806632
3374	NC_017462	TAC	2	6	196291	196296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806632
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3376	NC_017462	TGG	2	6	196414	196419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806632
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3379	NC_017462	TCA	2	6	196524	196529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806632
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3382	NC_017462	TTG	2	6	196764	196769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806633
3383	NC_017462	GGCCC	2	10	196791	196800	0 %	0 %	40 %	60 %	385806633
3384	NC_017462	TGA	2	6	196847	196852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806633
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3403	NC_017462	TGG	2	6	197809	197814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806636
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3456	NC_017462	GAATT	2	10	200356	200365	40 %	40 %	20 %	0 %	385806638
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3467	NC_017462	AT	3	6	201018	201023	50 %	50 %	0 %	0 %	385806638
3468	NC_017462	CAT	2	6	201112	201117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806638
3469	NC_017462	TTTG	2	8	201163	201170	0 %	75 %	25 %	0 %	385806638
3470	NC_017462	ACC	2	6	201204	201209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806638
3471	NC_017462	AAT	2	6	201215	201220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385806638
3472	NC_017462	CAAGG	2	10	201245	201254	40 %	0 %	40 %	20 %	385806638
3473	NC_017462	TCT	2	6	201267	201272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806638
3474	NC_017462	GC	3	6	201343	201348	0 %	0 %	50 %	50 %	385806638
3475	NC_017462	CTT	2	6	201385	201390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806638
3476	NC_017462	CAA	2	6	201433	201438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806638
3477	NC_017462	AG	3	6	201463	201468	50 %	0 %	50 %	0 %	385806638
3478	NC_017462	AGG	2	6	201489	201494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806638
3479	NC_017462	CTT	2	6	201547	201552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806638
3480	NC_017462	G	6	6	201572	201577	0 %	0 %	100 %	0 %	385806638
3481	NC_017462	CGC	2	6	201596	201601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806638
3482	NC_017462	GAA	2	6	201642	201647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806638
3483	NC_017462	TGG	2	6	201784	201789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806638
3484	NC_017462	T	7	7	201833	201839	0 %	100 %	0 %	0 %	385806638
3485	NC_017462	GCC	2	6	201867	201872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806638
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3488	NC_017462	GCT	2	6	202014	202019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806638
3489	NC_017462	GGT	2	6	202103	202108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806638
3490	NC_017462	TGG	2	6	202159	202164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806638
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