MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Sweden2

Total Repeats: 2487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017441	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	386262358
2	NC_017441	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	386262358
3	NC_017441	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	386262358
4	NC_017441	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	386262358
5	NC_017441	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	386262358
6	NC_017441	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	386262359
7	NC_017441	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	386262360
8	NC_017441	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	386262360
9	NC_017441	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	386262361
10	NC_017441	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	386262361
11	NC_017441	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	386262361
12	NC_017441	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	386262362
13	NC_017441	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	386262362
14	NC_017441	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	386262362
15	NC_017441	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	386262362
16	NC_017441	TGGA	2	8	5923	5930	25 %	25 %	50 %	0 %	386262363
17	NC_017441	CTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	0 %	25 %	386262363
18	NC_017441	GGGA	2	8	6815	6822	25 %	0 %	75 %	0 %	386262363
19	NC_017441	GGTG	2	8	7118	7125	0 %	25 %	75 %	0 %	386262364
20	NC_017441	AAAT	2	8	7184	7191	75 %	25 %	0 %	0 %	386262364
21	NC_017441	AAGC	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	386262365
22	NC_017441	ATTG	2	8	8819	8826	25 %	50 %	25 %	0 %	386262366
23	NC_017441	AGCG	2	8	9286	9293	25 %	0 %	50 %	25 %	386262366
24	NC_017441	AAAG	2	8	9307	9314	75 %	0 %	25 %	0 %	386262366
25	NC_017441	CTTT	2	8	9647	9654	0 %	75 %	0 %	25 %	386262366
26	NC_017441	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	386262367
27	NC_017441	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	386262367
28	NC_017441	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	386262367
29	NC_017441	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	386262368
30	NC_017441	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	386262368
31	NC_017441	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	386262368
32	NC_017441	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	386262368
33	NC_017441	GTTT	2	8	13163	13170	0 %	75 %	25 %	0 %	386262369
34	NC_017441	ATGC	2	8	13593	13600	25 %	25 %	25 %	25 %	386262369
35	NC_017441	TTGT	2	8	14629	14636	0 %	75 %	25 %	0 %	386262370
36	NC_017441	TTCT	2	8	14800	14807	0 %	75 %	0 %	25 %	386262370
37	NC_017441	ATTT	2	8	15006	15013	25 %	75 %	0 %	0 %	386262370
38	NC_017441	TTTC	2	8	15668	15675	0 %	75 %	0 %	25 %	386262371
39	NC_017441	AAAT	2	8	16150	16157	75 %	25 %	0 %	0 %	386262371
40	NC_017441	GTAA	2	8	16992	16999	50 %	25 %	25 %	0 %	386262372
41	NC_017441	CTAA	2	8	17185	17192	50 %	25 %	0 %	25 %	386262372
42	NC_017441	AGAA	2	8	17448	17455	75 %	0 %	25 %	0 %	386262372
43	NC_017441	ATTT	2	8	17594	17601	25 %	75 %	0 %	0 %	386262372
44	NC_017441	CTTT	2	8	19155	19162	0 %	75 %	0 %	25 %	386262374
45	NC_017441	GAAG	2	8	20100	20107	50 %	0 %	50 %	0 %	386262374
46	NC_017441	TTTG	2	8	20126	20133	0 %	75 %	25 %	0 %	386262374
47	NC_017441	TGTA	2	8	20818	20825	25 %	50 %	25 %	0 %	386262375
48	NC_017441	TGGG	2	8	22236	22243	0 %	25 %	75 %	0 %	386262376
49	NC_017441	CATT	2	8	23293	23300	25 %	50 %	0 %	25 %	386262376
50	NC_017441	GCTT	2	8	23636	23643	0 %	50 %	25 %	25 %	386262376
51	NC_017441	GGTT	2	8	23684	23691	0 %	50 %	50 %	0 %	386262376
52	NC_017441	TTCT	2	8	24054	24061	0 %	75 %	0 %	25 %	386262376
53	NC_017441	TAAC	2	8	24156	24163	50 %	25 %	0 %	25 %	386262376
54	NC_017441	CATT	2	8	24279	24286	25 %	50 %	0 %	25 %	386262376
55	NC_017441	GGTA	2	8	24649	24656	25 %	25 %	50 %	0 %	386262376
56	NC_017441	TTGA	2	8	25644	25651	25 %	50 %	25 %	0 %	386262377
57	NC_017441	TTCG	2	8	25789	25796	0 %	50 %	25 %	25 %	386262377
58	NC_017441	TAGG	2	8	25868	25875	25 %	25 %	50 %	0 %	386262377
59	NC_017441	TTCC	2	8	25992	25999	0 %	50 %	0 %	50 %	386262377
60	NC_017441	TAGG	2	8	26106	26113	25 %	25 %	50 %	0 %	386262377
61	NC_017441	TTTC	2	8	26541	26548	0 %	75 %	0 %	25 %	386262377
62	NC_017441	GCTT	2	8	26878	26885	0 %	50 %	25 %	25 %	386262377
63	NC_017441	GGAA	2	8	27461	27468	50 %	0 %	50 %	0 %	386262378
64	NC_017441	TTAA	2	8	27534	27541	50 %	50 %	0 %	0 %	386262378
65	NC_017441	AAAG	2	8	27584	27591	75 %	0 %	25 %	0 %	386262378
66	NC_017441	GGGC	2	8	27864	27871	0 %	0 %	75 %	25 %	386262378
67	NC_017441	GTTT	2	8	28147	28154	0 %	75 %	25 %	0 %	386262379
68	NC_017441	CAGA	2	8	28169	28176	50 %	0 %	25 %	25 %	386262379
69	NC_017441	CTTT	2	8	30141	30148	0 %	75 %	0 %	25 %	386262381
70	NC_017441	TTTG	2	8	30156	30163	0 %	75 %	25 %	0 %	386262381
71	NC_017441	TTGT	2	8	30191	30198	0 %	75 %	25 %	0 %	386262381
72	NC_017441	TGGC	2	8	30354	30361	0 %	25 %	50 %	25 %	386262381
73	NC_017441	AAAG	2	8	30914	30921	75 %	0 %	25 %	0 %	386262382
74	NC_017441	AAAC	2	8	30984	30991	75 %	0 %	0 %	25 %	386262382
75	NC_017441	GATG	2	8	31127	31134	25 %	25 %	50 %	0 %	386262382
76	NC_017441	GATA	2	8	32236	32243	50 %	25 %	25 %	0 %	386262384
77	NC_017441	TGAT	2	8	34731	34738	25 %	50 %	25 %	0 %	386262387
78	NC_017441	AAGA	3	12	34859	34870	75 %	0 %	25 %	0 %	386262387
79	NC_017441	AAGC	2	8	35079	35086	50 %	0 %	25 %	25 %	386262388
80	NC_017441	GTTC	2	8	35112	35119	0 %	50 %	25 %	25 %	386262388
81	NC_017441	GGCA	2	8	35491	35498	25 %	0 %	50 %	25 %	386262389
82	NC_017441	TCGA	2	8	35748	35755	25 %	25 %	25 %	25 %	386262389
83	NC_017441	TGCT	2	8	35901	35908	0 %	50 %	25 %	25 %	386262389
84	NC_017441	TTGG	2	8	36133	36140	0 %	50 %	50 %	0 %	386262389
85	NC_017441	AGAT	2	8	36853	36860	50 %	25 %	25 %	0 %	386262389
86	NC_017441	CTTT	2	8	37226	37233	0 %	75 %	0 %	25 %	386262390
87	NC_017441	ATGA	2	8	37716	37723	50 %	25 %	25 %	0 %	386262390
88	NC_017441	TAGG	2	8	37875	37882	25 %	25 %	50 %	0 %	386262390
89	NC_017441	CAAT	2	8	38059	38066	50 %	25 %	0 %	25 %	386262390
90	NC_017441	AATG	2	8	38846	38853	50 %	25 %	25 %	0 %	386262390
91	NC_017441	AGAA	2	8	39683	39690	75 %	0 %	25 %	0 %	386262391
92	NC_017441	AAGA	2	8	39735	39742	75 %	0 %	25 %	0 %	386262391
93	NC_017441	ATCC	2	8	39743	39750	25 %	25 %	0 %	50 %	386262391
94	NC_017441	TAAT	2	8	39954	39961	50 %	50 %	0 %	0 %	386262391
95	NC_017441	GTGC	2	8	42042	42049	0 %	25 %	50 %	25 %	386262393
96	NC_017441	AGAA	2	8	42461	42468	75 %	0 %	25 %	0 %	386262393
97	NC_017441	GGAT	2	8	42613	42620	25 %	25 %	50 %	0 %	386262393
98	NC_017441	AAAC	2	8	43821	43828	75 %	0 %	0 %	25 %	386262395
99	NC_017441	CAAT	2	8	44025	44032	50 %	25 %	0 %	25 %	386262395
100	NC_017441	ATTT	2	8	44782	44789	25 %	75 %	0 %	0 %	386262397
101	NC_017441	GCTC	2	8	45090	45097	0 %	25 %	25 %	50 %	386262397
102	NC_017441	TTCT	2	8	45232	45239	0 %	75 %	0 %	25 %	386262397
103	NC_017441	TTGA	2	8	45832	45839	25 %	50 %	25 %	0 %	386262398
104	NC_017441	TGTT	2	8	46004	46011	0 %	75 %	25 %	0 %	386262398
105	NC_017441	CTAT	2	8	46034	46041	25 %	50 %	0 %	25 %	386262398
106	NC_017441	TGTT	2	8	46063	46070	0 %	75 %	25 %	0 %	386262398
107	NC_017441	CTAT	2	8	46359	46366	25 %	50 %	0 %	25 %	386262398
108	NC_017441	AAGA	2	8	46855	46862	75 %	0 %	25 %	0 %	386262399
109	NC_017441	AAGA	2	8	46912	46919	75 %	0 %	25 %	0 %	386262399
110	NC_017441	AAAG	2	8	46952	46959	75 %	0 %	25 %	0 %	386262399
111	NC_017441	AAGA	2	8	47067	47074	75 %	0 %	25 %	0 %	386262399
112	NC_017441	ACTT	2	8	47328	47335	25 %	50 %	0 %	25 %	386262399
113	NC_017441	ATGG	2	8	47954	47961	25 %	25 %	50 %	0 %	386262399
114	NC_017441	AGGA	2	8	47985	47992	50 %	0 %	50 %	0 %	386262399
115	NC_017441	GAAC	2	8	48532	48539	50 %	0 %	25 %	25 %	386262399
116	NC_017441	AACA	2	8	48776	48783	75 %	0 %	0 %	25 %	386262400
117	NC_017441	CTTT	2	8	48972	48979	0 %	75 %	0 %	25 %	386262400
118	NC_017441	CTTT	2	8	49857	49864	0 %	75 %	0 %	25 %	386262401
119	NC_017441	GTAG	2	8	49875	49882	25 %	25 %	50 %	0 %	386262401
120	NC_017441	GAAG	2	8	51303	51310	50 %	0 %	50 %	0 %	386262402
121	NC_017441	TTCA	2	8	51725	51732	25 %	50 %	0 %	25 %	386262402
122	NC_017441	TCTA	2	8	51942	51949	25 %	50 %	0 %	25 %	386262402
123	NC_017441	GGAA	2	8	52891	52898	50 %	0 %	50 %	0 %	386262404
124	NC_017441	TTAA	2	8	53632	53639	50 %	50 %	0 %	0 %	386262404
125	NC_017441	CCTT	2	8	53839	53846	0 %	50 %	0 %	50 %	386262405
126	NC_017441	TTTA	2	8	54006	54013	25 %	75 %	0 %	0 %	386262405
127	NC_017441	AAAG	2	8	54230	54237	75 %	0 %	25 %	0 %	386262405
128	NC_017441	GATT	2	8	54367	54374	25 %	50 %	25 %	0 %	386262405
129	NC_017441	AATC	2	8	54422	54429	50 %	25 %	0 %	25 %	386262405
130	NC_017441	GGAT	2	8	54715	54722	25 %	25 %	50 %	0 %	386262406
131	NC_017441	TCGA	2	8	54877	54884	25 %	25 %	25 %	25 %	386262406
132	NC_017441	CTTC	2	8	54971	54978	0 %	50 %	0 %	50 %	386262406
133	NC_017441	GAAT	2	8	55006	55013	50 %	25 %	25 %	0 %	386262406
134	NC_017441	TTGA	2	8	55076	55083	25 %	50 %	25 %	0 %	386262406
135	NC_017441	GGAA	2	8	55432	55439	50 %	0 %	50 %	0 %	386262406
136	NC_017441	CTGG	3	12	56343	56354	0 %	25 %	50 %	25 %	386262407
137	NC_017441	TTGC	2	8	56480	56487	0 %	50 %	25 %	25 %	386262407
138	NC_017441	AGCT	2	8	56979	56986	25 %	25 %	25 %	25 %	386262407
139	NC_017441	GGTT	2	8	57682	57689	0 %	50 %	50 %	0 %	386262407
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