MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Sweden2

Total Repeats: 20037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017441	TTC	2	6	212367	212372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262539
4003	NC_017441	TAAC	2	8	212387	212394	50 %	25 %	0 %	25 %	386262539
4004	NC_017441	TCT	2	6	212395	212400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262539
4005	NC_017441	ATA	2	6	212418	212423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262539
4006	NC_017441	TGT	2	6	212554	212559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262539
4007	NC_017441	TAC	2	6	212598	212603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262539
4008	NC_017441	AAG	2	6	212629	212634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262539
4009	NC_017441	TTTA	2	8	212664	212671	25 %	75 %	0 %	0 %	386262539
4010	NC_017441	TTC	3	9	212684	212692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262539
4011	NC_017441	AAC	2	6	212832	212837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262539
4012	NC_017441	T	6	6	212853	212858	0 %	100 %	0 %	0 %	386262539
4013	NC_017441	ATTT	2	8	212969	212976	25 %	75 %	0 %	0 %	386262539
4014	NC_017441	AAT	2	6	213000	213005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262539
4015	NC_017441	GC	3	6	213049	213054	0 %	0 %	50 %	50 %	386262539
4016	NC_017441	AAT	2	6	213111	213116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262539
4017	NC_017441	CCT	2	6	213118	213123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262539
4018	NC_017441	AATT	2	8	213207	213214	50 %	50 %	0 %	0 %	386262539
4019	NC_017441	TTG	2	6	213239	213244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262539
4020	NC_017441	GAG	2	6	213265	213270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262539
4021	NC_017441	GCA	2	6	213424	213429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262539
4022	NC_017441	CAA	2	6	213470	213475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262539
4023	NC_017441	AAT	2	6	213690	213695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262539
4024	NC_017441	GAT	2	6	213756	213761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262539
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4026	NC_017441	TTTA	2	8	213768	213775	25 %	75 %	0 %	0 %	386262539
4027	NC_017441	ATT	2	6	213806	213811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262540
4028	NC_017441	TTG	2	6	213952	213957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262540
4029	NC_017441	TC	3	6	213982	213987	0 %	50 %	0 %	50 %	386262540
4030	NC_017441	TTC	2	6	214021	214026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262540
4031	NC_017441	AGT	2	6	214039	214044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262540
4032	NC_017441	AACA	2	8	214066	214073	75 %	0 %	0 %	25 %	386262540
4033	NC_017441	TCT	2	6	214092	214097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262540
4034	NC_017441	TGGA	2	8	214124	214131	25 %	25 %	50 %	0 %	386262540
4035	NC_017441	TTC	2	6	214178	214183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262540
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4037	NC_017441	TTC	2	6	214226	214231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262540
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4041	NC_017441	T	6	6	214370	214375	0 %	100 %	0 %	0 %	386262540
4042	NC_017441	AACG	2	8	214418	214425	50 %	0 %	25 %	25 %	386262540
4043	NC_017441	TCA	2	6	214461	214466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262540
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4045	NC_017441	CCAT	2	8	214509	214516	25 %	25 %	0 %	50 %	386262540
4046	NC_017441	GA	3	6	214527	214532	50 %	0 %	50 %	0 %	386262540
4047	NC_017441	T	6	6	214547	214552	0 %	100 %	0 %	0 %	386262540
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4050	NC_017441	AGA	2	6	214627	214632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262540
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4052	NC_017441	ATA	4	12	214683	214694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262540
4053	NC_017441	GCT	2	6	214752	214757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262540
4054	NC_017441	GAA	2	6	214837	214842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262540
4055	NC_017441	ACG	2	6	214853	214858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262540
4056	NC_017441	AGCG	2	8	214963	214970	25 %	0 %	50 %	25 %	386262540
4057	NC_017441	CT	3	6	215000	215005	0 %	50 %	0 %	50 %	386262540
4058	NC_017441	CT	3	6	215008	215013	0 %	50 %	0 %	50 %	386262540
4059	NC_017441	AGC	2	6	215015	215020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262540
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4064	NC_017441	TCT	2	6	215229	215234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262540
4065	NC_017441	TAGA	2	8	215260	215267	50 %	25 %	25 %	0 %	386262540
4066	NC_017441	CTTGT	2	10	215338	215347	0 %	60 %	20 %	20 %	386262540
4067	NC_017441	ATT	2	6	215354	215359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262540
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4071	NC_017441	CTGGAT	2	12	215665	215676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262540
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4091	NC_017441	CTT	2	6	217069	217074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262542
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4101	NC_017441	GC	3	6	217598	217603	0 %	0 %	50 %	50 %	386262543
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4107	NC_017441	C	6	6	217969	217974	0 %	0 %	0 %	100 %	386262543
4108	NC_017441	ATGA	2	8	217975	217982	50 %	25 %	25 %	0 %	386262543
4109	NC_017441	T	6	6	218009	218014	0 %	100 %	0 %	0 %	386262543
4110	NC_017441	GCA	2	6	218097	218102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262543
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4112	NC_017441	GAAA	2	8	218168	218175	75 %	0 %	25 %	0 %	386262543
4113	NC_017441	TCA	2	6	218216	218221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262543
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4116	NC_017441	T	6	6	218248	218253	0 %	100 %	0 %	0 %	386262543
4117	NC_017441	TAA	2	6	218328	218333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262543
4118	NC_017441	CCAC	2	8	218366	218373	25 %	0 %	0 %	75 %	386262543
4119	NC_017441	AGC	2	6	218374	218379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262543
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4121	NC_017441	T	7	7	218551	218557	0 %	100 %	0 %	0 %	386262543
4122	NC_017441	AGA	2	6	218841	218846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262544
4123	NC_017441	AGT	2	6	218866	218871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262544
4124	NC_017441	CTC	2	6	218925	218930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262544
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4238	NC_017441	CTGCTT	2	12	223966	223977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386262548
4239	NC_017441	CAAA	2	8	224053	224060	75 %	0 %	0 %	25 %	386262548
4240	NC_017441	CGA	2	6	224061	224066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262548
4241	NC_017441	AT	3	6	224083	224088	50 %	50 %	0 %	0 %	386262548
4242	NC_017441	AAG	2	6	224176	224181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262548
4243	NC_017441	CCT	2	6	224188	224193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262548
4244	NC_017441	TCCT	2	8	224221	224228	0 %	50 %	0 %	50 %	386262548
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4247	NC_017441	CAA	2	6	224268	224273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262548
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4367	NC_017441	ACT	2	6	230416	230421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262554
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4371	NC_017441	CTAT	2	8	230586	230593	25 %	50 %	0 %	25 %	386262554
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4486	NC_017441	A	7	7	236528	236534	100 %	0 %	0 %	0 %	386262558
4487	NC_017441	CAT	2	6	236551	236556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262558
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4496	NC_017441	AT	5	10	237319	237328	50 %	50 %	0 %	0 %	386262559
4497	NC_017441	TTGA	2	8	237370	237377	25 %	50 %	25 %	0 %	386262559
4498	NC_017441	CTT	2	6	237382	237387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262559
4499	NC_017441	AAGT	2	8	237451	237458	50 %	25 %	25 %	0 %	386262559
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