MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 20292

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2241	NC_017440	TC	3	6	119566	119571	0 %	50 %	0 %	50 %	385246001
2242	NC_017440	GCTA	2	8	119599	119606	25 %	25 %	25 %	25 %	385246001
2243	NC_017440	CGGC	2	8	119648	119655	0 %	0 %	50 %	50 %	385246001
2244	NC_017440	AGC	2	6	119689	119694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246001
2245	NC_017440	TGC	2	6	119698	119703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246001
2246	NC_017440	TCC	2	6	119710	119715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246001
2247	NC_017440	AG	3	6	119756	119761	50 %	0 %	50 %	0 %	385246001
2248	NC_017440	GA	4	8	119799	119806	50 %	0 %	50 %	0 %	385246001
2249	NC_017440	GGC	2	6	119839	119844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385246001
2250	NC_017440	T	6	6	119938	119943	0 %	100 %	0 %	0 %	385246001
2251	NC_017440	TCT	2	6	120023	120028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246001
2252	NC_017440	GA	3	6	120132	120137	50 %	0 %	50 %	0 %	385246001
2253	NC_017440	ATC	2	6	120226	120231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246001
2254	NC_017440	TTGGTA	2	12	120527	120538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385246002
2255	NC_017440	TG	3	6	120566	120571	0 %	50 %	50 %	0 %	385246002
2256	NC_017440	TCA	2	6	120574	120579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246002
2257	NC_017440	GAA	2	6	120598	120603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246002
2258	NC_017440	CGC	2	6	120627	120632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385246002
2259	NC_017440	TGC	2	6	120645	120650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246002
2260	NC_017440	CTG	2	6	120653	120658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246002
2261	NC_017440	AGC	2	6	120676	120681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246002
2262	NC_017440	CTTC	2	8	120874	120881	0 %	50 %	0 %	50 %	385246002
2263	NC_017440	GTA	2	6	120883	120888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246002
2264	NC_017440	AGGATC	2	12	120906	120917	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385246002
2265	NC_017440	CTT	2	6	121058	121063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246002
2266	NC_017440	CAG	2	6	121100	121105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246002
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2268	NC_017440	CT	3	6	121191	121196	0 %	50 %	0 %	50 %	385246002
2269	NC_017440	GAA	2	6	121245	121250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246002
2270	NC_017440	TCC	2	6	121336	121341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246002
2271	NC_017440	ATG	2	6	121445	121450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246002
2272	NC_017440	TGC	2	6	121462	121467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246002
2273	NC_017440	CTT	2	6	121487	121492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246002
2274	NC_017440	AGA	2	6	121584	121589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246002
2275	NC_017440	GAA	2	6	121600	121605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246002
2276	NC_017440	TTTC	2	8	121682	121689	0 %	75 %	0 %	25 %	385246002
2277	NC_017440	AAC	2	6	121733	121738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246002
2278	NC_017440	AAG	2	6	121754	121759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246002
2279	NC_017440	TGA	2	6	121781	121786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246002
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2281	NC_017440	AT	3	6	121893	121898	50 %	50 %	0 %	0 %	385246002
2282	NC_017440	GTT	2	6	121933	121938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246002
2283	NC_017440	CAA	2	6	121950	121955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246002
2284	NC_017440	AAG	2	6	121958	121963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246002
2285	NC_017440	AGA	2	6	122025	122030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246002
2286	NC_017440	TGA	2	6	122037	122042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246002
2287	NC_017440	CTT	2	6	122080	122085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246002
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2289	NC_017440	ATC	2	6	122286	122291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246002
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2291	NC_017440	GA	3	6	122433	122438	50 %	0 %	50 %	0 %	385246002
2292	NC_017440	GCTTC	2	10	122441	122450	0 %	40 %	20 %	40 %	385246002
2293	NC_017440	TCTA	2	8	122482	122489	25 %	50 %	0 %	25 %	385246002
2294	NC_017440	ACT	2	6	122643	122648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246003
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2297	NC_017440	T	6	6	122755	122760	0 %	100 %	0 %	0 %	385246003
2298	NC_017440	AGCT	2	8	122788	122795	25 %	25 %	25 %	25 %	385246003
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2303	NC_017440	TAA	2	6	123142	123147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246003
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2311	NC_017440	GGGTTT	2	12	123676	123687	0 %	50 %	50 %	0 %	385246004
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2315	NC_017440	TGGA	2	8	123744	123751	25 %	25 %	50 %	0 %	385246004
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2319	NC_017440	GGA	2	6	123882	123887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246004
2320	NC_017440	CTT	2	6	123909	123914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246004
2321	NC_017440	TTGCAT	2	12	123958	123969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385246004
2322	NC_017440	A	7	7	123976	123982	100 %	0 %	0 %	0 %	385246004
2323	NC_017440	CTG	2	6	123985	123990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246004
2324	NC_017440	TGA	2	6	124012	124017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246004
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2326	NC_017440	ATCG	2	8	124044	124051	25 %	25 %	25 %	25 %	385246004
2327	NC_017440	AG	3	6	124065	124070	50 %	0 %	50 %	0 %	385246004
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2330	NC_017440	TGA	2	6	124312	124317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246004
2331	NC_017440	AAGAGA	2	12	124327	124338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246004
2332	NC_017440	TAC	2	6	124365	124370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246004
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2335	NC_017440	GA	3	6	124435	124440	50 %	0 %	50 %	0 %	385246004
2336	NC_017440	TAG	2	6	124454	124459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246004
2337	NC_017440	CTTC	2	8	124461	124468	0 %	50 %	0 %	50 %	385246004
2338	NC_017440	TCA	2	6	124581	124586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246004
2339	NC_017440	T	6	6	124610	124615	0 %	100 %	0 %	0 %	385246004
2340	NC_017440	ATAA	2	8	124664	124671	75 %	25 %	0 %	0 %	385246004
2341	NC_017440	TGAA	2	8	124749	124756	50 %	25 %	25 %	0 %	385246005
2342	NC_017440	TAA	2	6	125044	125049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246005
2343	NC_017440	AAC	2	6	125079	125084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246005
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2345	NC_017440	GGA	2	6	125210	125215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246005
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2347	NC_017440	CAG	2	6	125285	125290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246005
2348	NC_017440	TCA	2	6	125301	125306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246005
2349	NC_017440	TGA	2	6	125317	125322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246005
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2351	NC_017440	TTAA	2	8	125473	125480	50 %	50 %	0 %	0 %	385246005
2352	NC_017440	T	7	7	125558	125564	0 %	100 %	0 %	0 %	385246006
2353	NC_017440	AGA	2	6	125585	125590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246006
2354	NC_017440	CT	3	6	125661	125666	0 %	50 %	0 %	50 %	385246006
2355	NC_017440	GA	3	6	125747	125752	50 %	0 %	50 %	0 %	385246006
2356	NC_017440	GTA	2	6	125763	125768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246006
2357	NC_017440	GTT	2	6	125783	125788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246006
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2359	NC_017440	TGAT	2	8	125901	125908	25 %	50 %	25 %	0 %	385246006
2360	NC_017440	AGA	2	6	125942	125947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246006
2361	NC_017440	GAA	2	6	126087	126092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246006
2362	NC_017440	CAA	2	6	126196	126201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246006
2363	NC_017440	CTTT	2	8	126204	126211	0 %	75 %	0 %	25 %	385246006
2364	NC_017440	T	7	7	126209	126215	0 %	100 %	0 %	0 %	385246006
2365	NC_017440	TACAA	2	10	126230	126239	60 %	20 %	0 %	20 %	385246006
2366	NC_017440	GCA	2	6	126442	126447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246007
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2490	NC_017440	GGA	2	6	132209	132214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246010
2491	NC_017440	TGA	2	6	132278	132283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246010
2492	NC_017440	GTT	2	6	132300	132305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246010
2493	NC_017440	A	6	6	132331	132336	100 %	0 %	0 %	0 %	385246010
2494	NC_017440	GGAG	2	8	132341	132348	25 %	0 %	75 %	0 %	385246010
2495	NC_017440	GGA	2	6	132371	132376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246010
2496	NC_017440	AGA	2	6	132383	132388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246010
2497	NC_017440	CAGT	2	8	132421	132428	25 %	25 %	25 %	25 %	385246010
2498	NC_017440	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	385246010
2499	NC_017440	GCT	2	6	132441	132446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246010
2500	NC_017440	TAA	2	6	132554	132559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246010

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