MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 20292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017440	TAA	2	6	82750	82755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245968
1503	NC_017440	CAT	2	6	82766	82771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245968
1504	NC_017440	GAA	2	6	82778	82783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245968
1505	NC_017440	GA	3	6	82863	82868	50 %	0 %	50 %	0 %	385245968
1506	NC_017440	TAC	2	6	82914	82919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245969
1507	NC_017440	T	6	6	82938	82943	0 %	100 %	0 %	0 %	385245969
1508	NC_017440	T	7	7	82950	82956	0 %	100 %	0 %	0 %	385245969
1509	NC_017440	T	6	6	82963	82968	0 %	100 %	0 %	0 %	385245969
1510	NC_017440	GTA	2	6	83049	83054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245969
1511	NC_017440	T	6	6	83060	83065	0 %	100 %	0 %	0 %	385245969
1512	NC_017440	TATG	2	8	83084	83091	25 %	50 %	25 %	0 %	385245969
1513	NC_017440	TAT	2	6	83113	83118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245969
1514	NC_017440	GTCTGT	2	12	83127	83138	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385245969
1515	NC_017440	TCA	2	6	83147	83152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245969
1516	NC_017440	TCAT	2	8	83155	83162	25 %	50 %	0 %	25 %	385245969
1517	NC_017440	CAA	2	6	83197	83202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245969
1518	NC_017440	ACTG	2	8	83207	83214	25 %	25 %	25 %	25 %	385245969
1519	NC_017440	CATT	2	8	83222	83229	25 %	50 %	0 %	25 %	385245969
1520	NC_017440	AGA	2	6	83255	83260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245969
1521	NC_017440	AGCA	2	8	83261	83268	50 %	0 %	25 %	25 %	385245969
1522	NC_017440	TC	3	6	83283	83288	0 %	50 %	0 %	50 %	385245969
1523	NC_017440	TTA	2	6	83304	83309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245969
1524	NC_017440	ATTA	2	8	83414	83421	50 %	50 %	0 %	0 %	385245969
1525	NC_017440	TTTG	2	8	83454	83461	0 %	75 %	25 %	0 %	385245969
1526	NC_017440	TTG	2	6	83551	83556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245969
1527	NC_017440	GAT	2	6	83648	83653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245969
1528	NC_017440	TCTA	2	8	83738	83745	25 %	50 %	0 %	25 %	385245969
1529	NC_017440	CTA	2	6	83766	83771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245969
1530	NC_017440	TAT	2	6	83819	83824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245969
1531	NC_017440	TAAG	2	8	83843	83850	50 %	25 %	25 %	0 %	385245969
1532	NC_017440	AGT	2	6	83932	83937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245970
1533	NC_017440	TAT	2	6	83959	83964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245970
1534	NC_017440	TGC	2	6	83974	83979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245970
1535	NC_017440	AAG	2	6	83994	83999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245970
1536	NC_017440	TC	3	6	84006	84011	0 %	50 %	0 %	50 %	385245970
1537	NC_017440	AG	3	6	84017	84022	50 %	0 %	50 %	0 %	385245970
1538	NC_017440	GAA	2	6	84050	84055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245970
1539	NC_017440	CAG	2	6	84189	84194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245970
1540	NC_017440	TAA	2	6	84235	84240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245970
1541	NC_017440	AG	3	6	84284	84289	50 %	0 %	50 %	0 %	385245970
1542	NC_017440	TTC	2	6	84303	84308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245970
1543	NC_017440	GAAG	2	8	84347	84354	50 %	0 %	50 %	0 %	385245970
1544	NC_017440	A	6	6	84371	84376	100 %	0 %	0 %	0 %	385245970
1545	NC_017440	AGA	2	6	84421	84426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245970
1546	NC_017440	TTC	2	6	84499	84504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245970
1547	NC_017440	TAAA	2	8	84513	84520	75 %	25 %	0 %	0 %	385245970
1548	NC_017440	ATCC	2	8	84584	84591	25 %	25 %	0 %	50 %	385245970
1549	NC_017440	TGG	2	6	84612	84617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245970
1550	NC_017440	TGA	2	6	84645	84650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245970
1551	NC_017440	TCC	2	6	84652	84657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245970
1552	NC_017440	ACA	2	6	84676	84681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245970
1553	NC_017440	TTTC	2	8	84731	84738	0 %	75 %	0 %	25 %	385245970
1554	NC_017440	AGAT	2	8	84772	84779	50 %	25 %	25 %	0 %	385245970
1555	NC_017440	CTT	2	6	84809	84814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245970
1556	NC_017440	T	6	6	84835	84840	0 %	100 %	0 %	0 %	385245970
1557	NC_017440	GAA	2	6	84962	84967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245970
1558	NC_017440	AAT	2	6	85216	85221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245971
1559	NC_017440	AT	3	6	85220	85225	50 %	50 %	0 %	0 %	385245971
1560	NC_017440	AGC	2	6	85288	85293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245971
1561	NC_017440	AG	3	6	85315	85320	50 %	0 %	50 %	0 %	385245971
1562	NC_017440	GAAA	2	8	85353	85360	75 %	0 %	25 %	0 %	385245971
1563	NC_017440	T	6	6	85490	85495	0 %	100 %	0 %	0 %	385245971
1564	NC_017440	TGG	2	6	85591	85596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245971
1565	NC_017440	CTT	2	6	85647	85652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245971
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1568	NC_017440	CTT	2	6	85742	85747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245971
1569	NC_017440	GAAA	2	8	85748	85755	75 %	0 %	25 %	0 %	385245971
1570	NC_017440	GCA	2	6	85771	85776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245971
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1573	NC_017440	TAG	2	6	85911	85916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245971
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1582	NC_017440	TATT	2	8	86536	86543	25 %	75 %	0 %	0 %	385245971
1583	NC_017440	AG	3	6	86599	86604	50 %	0 %	50 %	0 %	385245971
1584	NC_017440	TTA	2	6	86608	86613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245971
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1593	NC_017440	ATG	2	6	87306	87311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245972
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1607	NC_017440	A	6	6	87981	87986	100 %	0 %	0 %	0 %	385245972
1608	NC_017440	TTC	2	6	87987	87992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245972
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1611	NC_017440	TAG	2	6	88238	88243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245973
1612	NC_017440	AGA	2	6	88336	88341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245973
1613	NC_017440	GGAT	2	8	88342	88349	25 %	25 %	50 %	0 %	385245973
1614	NC_017440	CTT	2	6	88358	88363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245973
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1616	NC_017440	GTT	2	6	88532	88537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245973
1617	NC_017440	GTA	2	6	88539	88544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245973
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1619	NC_017440	TAT	2	6	88628	88633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245973
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1621	NC_017440	AAG	2	6	88684	88689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245973
1622	NC_017440	CAAT	2	8	88709	88716	50 %	25 %	0 %	25 %	385245973
1623	NC_017440	TTCTGA	2	12	88741	88752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385245973
1624	NC_017440	AG	3	6	88793	88798	50 %	0 %	50 %	0 %	385245973
1625	NC_017440	A	6	6	88846	88851	100 %	0 %	0 %	0 %	385245973
1626	NC_017440	CGA	2	6	88852	88857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245973
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