MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 20292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017440	A	6	6	54725	54730	100 %	0 %	0 %	0 %	385245947
1002	NC_017440	G	6	6	54781	54786	0 %	0 %	100 %	0 %	385245947
1003	NC_017440	GGAA	2	8	54892	54899	50 %	0 %	50 %	0 %	385245947
1004	NC_017440	GATCTG	2	12	54915	54926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385245947
1005	NC_017440	GTGTAA	2	12	54963	54974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245947
1006	NC_017440	GCA	2	6	54977	54982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245947
1007	NC_017440	TGG	2	6	55029	55034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245947
1008	NC_017440	GGTTCA	2	12	55052	55063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385245947
1009	NC_017440	TTATC	2	10	55153	55162	20 %	60 %	0 %	20 %	385245947
1010	NC_017440	TGAGT	2	10	55174	55183	20 %	40 %	40 %	0 %	385245947
1011	NC_017440	TCA	3	9	55187	55195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245947
1012	NC_017440	GTT	2	6	55202	55207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245947
1013	NC_017440	CTG	2	6	55248	55253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245947
1014	NC_017440	GAG	2	6	55254	55259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245947
1015	NC_017440	TGC	2	6	55288	55293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245947
1016	NC_017440	AT	3	6	55498	55503	50 %	50 %	0 %	0 %	385245947
1017	NC_017440	TTA	2	6	55513	55518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245947
1018	NC_017440	CTGG	3	12	55791	55802	0 %	25 %	50 %	25 %	385245948
1019	NC_017440	ATT	2	6	55806	55811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245948
1020	NC_017440	GAT	2	6	55819	55824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245948
1021	NC_017440	TCT	2	6	55837	55842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245948
1022	NC_017440	TCC	2	6	55872	55877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245948
1023	NC_017440	TTA	2	6	55885	55890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245948
1024	NC_017440	TTGC	2	8	55928	55935	0 %	50 %	25 %	25 %	385245948
1025	NC_017440	AGCG	2	8	55968	55975	25 %	0 %	50 %	25 %	385245948
1026	NC_017440	T	6	6	55980	55985	0 %	100 %	0 %	0 %	385245948
1027	NC_017440	GTA	2	6	56011	56016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245948
1028	NC_017440	GTT	2	6	56122	56127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245948
1029	NC_017440	TGG	2	6	56142	56147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245948
1030	NC_017440	GTTGT	2	10	56221	56230	0 %	60 %	40 %	0 %	385245948
1031	NC_017440	T	6	6	56276	56281	0 %	100 %	0 %	0 %	385245948
1032	NC_017440	TGA	2	6	57916	57921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245949
1033	NC_017440	TGAAAA	2	12	59048	59059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385245950
1034	NC_017440	AGA	2	6	59060	59065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245950
1035	NC_017440	TCT	2	6	59076	59081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245950
1036	NC_017440	T	6	6	59108	59113	0 %	100 %	0 %	0 %	385245950
1037	NC_017440	CGTT	2	8	59259	59266	0 %	50 %	25 %	25 %	385245950
1038	NC_017440	GGAG	2	8	59268	59275	25 %	0 %	75 %	0 %	385245950
1039	NC_017440	GTAA	2	8	59320	59327	50 %	25 %	25 %	0 %	385245950
1040	NC_017440	TCCTAA	2	12	59387	59398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245950
1041	NC_017440	AGT	2	6	59416	59421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245950
1042	NC_017440	T	6	6	59448	59453	0 %	100 %	0 %	0 %	385245950
1043	NC_017440	TAG	2	6	59495	59500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245950
1044	NC_017440	GCT	2	6	59508	59513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245950
1045	NC_017440	GTC	2	6	59534	59539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245950
1046	NC_017440	ATGG	2	8	59547	59554	25 %	25 %	50 %	0 %	385245950
1047	NC_017440	AGG	2	6	59581	59586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245950
1048	NC_017440	GA	3	6	59633	59638	50 %	0 %	50 %	0 %	385245950
1049	NC_017440	CAA	2	6	59656	59661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245950
1050	NC_017440	ATAA	2	8	59693	59700	75 %	25 %	0 %	0 %	385245950
1051	NC_017440	GAGCA	2	10	59733	59742	40 %	0 %	40 %	20 %	385245950
1052	NC_017440	GT	3	6	59771	59776	0 %	50 %	50 %	0 %	385245950
1053	NC_017440	TAG	2	6	59783	59788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245950
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1055	NC_017440	CTC	2	6	59980	59985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245950
1056	NC_017440	AAC	2	6	60013	60018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245950
1057	NC_017440	T	7	7	60032	60038	0 %	100 %	0 %	0 %	385245950
1058	NC_017440	CTT	2	6	60082	60087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245950
1059	NC_017440	AAT	2	6	60112	60117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245950
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1061	NC_017440	ATGT	2	8	60143	60150	25 %	50 %	25 %	0 %	385245950
1062	NC_017440	CATT	2	8	60172	60179	25 %	50 %	0 %	25 %	385245950
1063	NC_017440	ATG	2	6	60193	60198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245951
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1065	NC_017440	TCT	2	6	60277	60282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245951
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1073	NC_017440	T	7	7	60591	60597	0 %	100 %	0 %	0 %	385245951
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1096	NC_017440	ATG	2	6	62086	62091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245952
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1103	NC_017440	A	6	6	62440	62445	100 %	0 %	0 %	0 %	385245952
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1108	NC_017440	AAG	2	6	62681	62686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245952
1109	NC_017440	TC	3	6	62780	62785	0 %	50 %	0 %	50 %	385245952
1110	NC_017440	CAA	2	6	62881	62886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245952
1111	NC_017440	AT	3	6	62961	62966	50 %	50 %	0 %	0 %	385245952
1112	NC_017440	TTC	2	6	62967	62972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245952
1113	NC_017440	GTT	2	6	63106	63111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245952
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1115	NC_017440	AG	3	6	63161	63166	50 %	0 %	50 %	0 %	385245952
1116	NC_017440	CT	4	8	63169	63176	0 %	50 %	0 %	50 %	385245952
1117	NC_017440	T	6	6	63188	63193	0 %	100 %	0 %	0 %	385245952
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1121	NC_017440	AGA	2	6	63420	63425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245952
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1125	NC_017440	AG	3	6	63655	63660	50 %	0 %	50 %	0 %	385245952
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