MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 20292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017440	TAAACA	2	12	638774	638785	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385246482
12502	NC_017440	AGG	2	6	638883	638888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246483
12503	NC_017440	ACAT	2	8	638940	638947	50 %	25 %	0 %	25 %	385246483
12504	NC_017440	CAA	2	6	638950	638955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246483
12505	NC_017440	GA	3	6	638976	638981	50 %	0 %	50 %	0 %	385246483
12506	NC_017440	TCC	2	6	639012	639017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246483
12507	NC_017440	A	7	7	639023	639029	100 %	0 %	0 %	0 %	385246483
12508	NC_017440	ATGC	2	8	639039	639046	25 %	25 %	25 %	25 %	385246483
12509	NC_017440	ACGA	2	8	639079	639086	50 %	0 %	25 %	25 %	385246483
12510	NC_017440	GA	4	8	639138	639145	50 %	0 %	50 %	0 %	385246483
12511	NC_017440	AAG	2	6	639146	639151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246483
12512	NC_017440	CTA	2	6	639157	639162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246483
12513	NC_017440	A	6	6	639165	639170	100 %	0 %	0 %	0 %	385246483
12514	NC_017440	ACA	2	6	639241	639246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246484
12515	NC_017440	TCAT	2	8	639262	639269	25 %	50 %	0 %	25 %	385246484
12516	NC_017440	AAG	2	6	639276	639281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246484
12517	NC_017440	TCT	2	6	639283	639288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246484
12518	NC_017440	AAG	2	6	639303	639308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246484
12519	NC_017440	TTTC	2	8	639309	639316	0 %	75 %	0 %	25 %	385246484
12520	NC_017440	CAC	2	6	639325	639330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246484
12521	NC_017440	TCT	2	6	639337	639342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246484
12522	NC_017440	CAT	2	6	639402	639407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246484
12523	NC_017440	CCA	2	6	639496	639501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246484
12524	NC_017440	ATA	2	6	639502	639507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246484
12525	NC_017440	CAT	2	6	639528	639533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246484
12526	NC_017440	GAA	2	6	639624	639629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246485
12527	NC_017440	AATC	2	8	639643	639650	50 %	25 %	0 %	25 %	385246485
12528	NC_017440	ACC	2	6	639758	639763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246485
12529	NC_017440	TTC	2	6	639778	639783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246485
12530	NC_017440	TCC	2	6	639853	639858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246485
12531	NC_017440	AAC	2	6	639862	639867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246485
12532	NC_017440	CTT	2	6	639879	639884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246485
12533	NC_017440	CCT	2	6	639956	639961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246485
12534	NC_017440	CAG	2	6	639969	639974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246485
12535	NC_017440	TCT	2	6	640035	640040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246485
12536	NC_017440	T	6	6	640075	640080	0 %	100 %	0 %	0 %	385246485
12537	NC_017440	TCC	2	6	640114	640119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246485
12538	NC_017440	TTTC	2	8	640209	640216	0 %	75 %	0 %	25 %	385246485
12539	NC_017440	AGAA	2	8	640238	640245	75 %	0 %	25 %	0 %	385246485
12540	NC_017440	CAC	2	6	640246	640251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246485
12541	NC_017440	TGC	2	6	640294	640299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246485
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12543	NC_017440	CT	3	6	640379	640384	0 %	50 %	0 %	50 %	385246485
12544	NC_017440	AAG	2	6	640482	640487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246485
12545	NC_017440	CAGC	2	8	640497	640504	25 %	0 %	25 %	50 %	385246485
12546	NC_017440	TAA	3	9	640567	640575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246485
12547	NC_017440	TC	4	8	640627	640634	0 %	50 %	0 %	50 %	385246485
12548	NC_017440	AGC	2	6	640669	640674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246485
12549	NC_017440	AAG	2	6	640675	640680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246485
12550	NC_017440	CT	3	6	640681	640686	0 %	50 %	0 %	50 %	385246485
12551	NC_017440	CGT	2	6	640721	640726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246485
12552	NC_017440	T	6	6	640726	640731	0 %	100 %	0 %	0 %	385246485
12553	NC_017440	CGGAA	2	10	640991	641000	40 %	0 %	40 %	20 %	385246486
12554	NC_017440	TAA	2	6	641061	641066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246486
12555	NC_017440	CA	3	6	641088	641093	50 %	0 %	0 %	50 %	385246486
12556	NC_017440	TTG	2	6	641153	641158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246486
12557	NC_017440	ATA	2	6	641162	641167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246486
12558	NC_017440	CAT	2	6	641216	641221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246486
12559	NC_017440	GGA	2	6	641419	641424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246486
12560	NC_017440	TCT	2	6	641425	641430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246486
12561	NC_017440	TA	3	6	641477	641482	50 %	50 %	0 %	0 %	385246486
12562	NC_017440	GTC	2	6	641488	641493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246486
12563	NC_017440	AGG	2	6	641558	641563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246486
12564	NC_017440	AGG	2	6	641574	641579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246486
12565	NC_017440	ACC	2	6	641635	641640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246486
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12567	NC_017440	TCC	2	6	641691	641696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246486
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12569	NC_017440	GCTC	2	8	641887	641894	0 %	25 %	25 %	50 %	385246486
12570	NC_017440	AAG	2	6	641961	641966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246486
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12572	NC_017440	AAT	2	6	642072	642077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246486
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12578	NC_017440	CAT	2	6	642282	642287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246486
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12581	NC_017440	TTTC	2	8	642341	642348	0 %	75 %	0 %	25 %	385246487
12582	NC_017440	AGC	2	6	642361	642366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246487
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12587	NC_017440	TCT	2	6	642446	642451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246487
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12591	NC_017440	AAT	2	6	642616	642621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246487
12592	NC_017440	TAA	2	6	642735	642740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246487
12593	NC_017440	TAA	2	6	642768	642773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246487
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12599	NC_017440	T	7	7	643146	643152	0 %	100 %	0 %	0 %	385246487
12600	NC_017440	CAA	2	6	643171	643176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246487
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12602	NC_017440	CTT	2	6	643197	643202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246487
12603	NC_017440	CTT	2	6	643269	643274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246487
12604	NC_017440	ACT	2	6	643363	643368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246487
12605	NC_017440	AAG	2	6	643414	643419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246487
12606	NC_017440	CT	3	6	643484	643489	0 %	50 %	0 %	50 %	385246487
12607	NC_017440	AGCG	2	8	643559	643566	25 %	0 %	50 %	25 %	385246487
12608	NC_017440	AGA	2	6	643606	643611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246487
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12611	NC_017440	GCT	2	6	643646	643651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246487
12612	NC_017440	TGT	2	6	643719	643724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246487
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12617	NC_017440	C	9	9	644217	644225	0 %	0 %	0 %	100 %	385246487
12618	NC_017440	GTT	2	6	644271	644276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246487
12619	NC_017440	TC	3	6	644325	644330	0 %	50 %	0 %	50 %	385246487
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