MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 20292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017440	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245920
502	NC_017440	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245920
503	NC_017440	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245920
504	NC_017440	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385245920
505	NC_017440	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245920
506	NC_017440	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385245920
507	NC_017440	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245920
508	NC_017440	TGT	2	6	29103	29108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245921
509	NC_017440	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245921
510	NC_017440	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245921
511	NC_017440	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245921
512	NC_017440	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385245921
513	NC_017440	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385245921
514	NC_017440	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385245921
515	NC_017440	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385245921
516	NC_017440	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	385245921
517	NC_017440	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245921
518	NC_017440	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385245921
519	NC_017440	T	8	8	29870	29877	0 %	100 %	0 %	0 %	385245921
520	NC_017440	ATG	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245921
521	NC_017440	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385245921
522	NC_017440	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385245922
523	NC_017440	GTT	2	6	30112	30117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245922
524	NC_017440	GAA	2	6	30121	30126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245922
525	NC_017440	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385245922
526	NC_017440	TCT	2	6	30187	30192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245922
527	NC_017440	ACT	2	6	30277	30282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245922
528	NC_017440	TTC	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245922
529	NC_017440	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385245922
530	NC_017440	CCT	2	6	30341	30346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245922
531	NC_017440	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385245922
532	NC_017440	T	6	6	30411	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	385245922
533	NC_017440	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385245922
534	NC_017440	GGC	2	6	30447	30452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385245922
535	NC_017440	GAT	2	6	30526	30531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245922
536	NC_017440	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385245922
537	NC_017440	TAG	2	6	30548	30553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245922
538	NC_017440	GTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245922
539	NC_017440	TAA	2	6	30732	30737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245922
540	NC_017440	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385245922
541	NC_017440	GAA	2	6	30871	30876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245922
542	NC_017440	AGA	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245922
543	NC_017440	TCG	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245922
544	NC_017440	ATG	2	6	30988	30993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245922
545	NC_017440	TGG	2	6	31002	31007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245922
546	NC_017440	GAA	2	6	31033	31038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245922
547	NC_017440	ATT	2	6	31069	31074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245922
548	NC_017440	ATG	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245922
549	NC_017440	AAG	2	6	31204	31209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245922
550	NC_017440	T	6	6	31210	31215	0 %	100 %	0 %	0 %	385245922
551	NC_017440	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385245922
552	NC_017440	A	7	7	31252	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	385245922
553	NC_017440	ACA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245923
554	NC_017440	TGT	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245923
555	NC_017440	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385245923
556	NC_017440	T	6	6	31438	31443	0 %	100 %	0 %	0 %	385245923
557	NC_017440	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385245923
558	NC_017440	A	6	6	31533	31538	100 %	0 %	0 %	0 %	385245923
559	NC_017440	A	6	6	31564	31569	100 %	0 %	0 %	0 %	385245923
560	NC_017440	TGC	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245923
561	NC_017440	AGC	2	6	31610	31615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245923
562	NC_017440	GATA	2	8	31646	31653	50 %	25 %	25 %	0 %	385245924
563	NC_017440	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385245924
564	NC_017440	AAG	2	6	31859	31864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245924
565	NC_017440	AAG	2	6	31866	31871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245924
566	NC_017440	CTT	2	6	31905	31910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245924
567	NC_017440	CGT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245924
568	NC_017440	TGA	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245924
569	NC_017440	GAG	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245924
570	NC_017440	GCG	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385245924
571	NC_017440	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385245924
572	NC_017440	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385245924
573	NC_017440	AGA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245924
574	NC_017440	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385245924
575	NC_017440	AAG	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245924
576	NC_017440	ATT	2	6	32471	32476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245924
577	NC_017440	T	6	6	32576	32581	0 %	100 %	0 %	0 %	385245924
578	NC_017440	AGG	2	6	32826	32831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245925
579	NC_017440	GGT	2	6	32881	32886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245925
580	NC_017440	GCT	2	6	33043	33048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245925
581	NC_017440	GCT	2	6	33076	33081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245925
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583	NC_017440	A	6	6	33191	33196	100 %	0 %	0 %	0 %	385245926
584	NC_017440	TGT	2	6	33282	33287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245926
585	NC_017440	TGA	2	6	33333	33338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245926
586	NC_017440	GTT	2	6	33421	33426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245926
587	NC_017440	AGG	2	6	33470	33475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245926
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589	NC_017440	T	6	6	33516	33521	0 %	100 %	0 %	0 %	385245926
590	NC_017440	GTT	2	6	33534	33539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245926
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593	NC_017440	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385245926
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596	NC_017440	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385245927
597	NC_017440	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245927
598	NC_017440	ATT	2	6	33994	33999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245927
599	NC_017440	T	6	6	34046	34051	0 %	100 %	0 %	0 %	385245927
600	NC_017440	TTA	2	6	34076	34081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245927
601	NC_017440	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	385245927
602	NC_017440	GAA	2	6	34169	34174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245927
603	NC_017440	AAG	2	6	34216	34221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245927
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611	NC_017440	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	385245928
612	NC_017440	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	385245928
613	NC_017440	GAT	2	6	34600	34605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245928
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615	NC_017440	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385245928
616	NC_017440	AGA	2	6	34666	34671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245928
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618	NC_017440	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245929
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624	NC_017440	GAG	2	6	35170	35175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245929
625	NC_017440	CAG	2	6	35184	35189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245929
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628	NC_017440	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	385245929
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