MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 20292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017440	TTTG	2	8	286884	286891	0 %	75 %	25 %	0 %	385246151
5503	NC_017440	TCTTT	2	10	286892	286901	0 %	80 %	0 %	20 %	385246151
5504	NC_017440	TTTA	2	8	286912	286919	25 %	75 %	0 %	0 %	385246151
5505	NC_017440	A	8	8	287000	287007	100 %	0 %	0 %	0 %	385246151
5506	NC_017440	TTA	2	6	287206	287211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246152
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5508	NC_017440	TTC	2	6	287248	287253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246152
5509	NC_017440	GAG	2	6	287295	287300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246152
5510	NC_017440	CGA	2	6	287303	287308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246152
5511	NC_017440	CTT	2	6	287337	287342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246152
5512	NC_017440	AAG	2	6	287372	287377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246152
5513	NC_017440	AGTA	2	8	287395	287402	50 %	25 %	25 %	0 %	385246152
5514	NC_017440	TA	3	6	287482	287487	50 %	50 %	0 %	0 %	385246152
5515	NC_017440	TTC	2	6	287584	287589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246152
5516	NC_017440	TTC	2	6	287786	287791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246153
5517	NC_017440	GTTT	2	8	287834	287841	0 %	75 %	25 %	0 %	385246153
5518	NC_017440	CTT	2	6	287872	287877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246153
5519	NC_017440	A	6	6	287903	287908	100 %	0 %	0 %	0 %	385246153
5520	NC_017440	TCT	2	6	287971	287976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246153
5521	NC_017440	TAG	2	6	288022	288027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246153
5522	NC_017440	ATC	2	6	288153	288158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246153
5523	NC_017440	TCC	2	6	288283	288288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246153
5524	NC_017440	GTC	2	6	288328	288333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246153
5525	NC_017440	CTAT	2	8	288344	288351	25 %	50 %	0 %	25 %	385246153
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5530	NC_017440	GGT	2	6	288492	288497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246153
5531	NC_017440	CTT	2	6	288534	288539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246153
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5533	NC_017440	ATC	2	6	288637	288642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246153
5534	NC_017440	TAT	2	6	288668	288673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246153
5535	NC_017440	TGA	2	6	288677	288682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246153
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5537	NC_017440	TGT	2	6	288794	288799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246153
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5541	NC_017440	TA	3	6	288999	289004	50 %	50 %	0 %	0 %	385246153
5542	NC_017440	AACT	2	8	289020	289027	50 %	25 %	0 %	25 %	385246153
5543	NC_017440	CCT	2	6	289053	289058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246154
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5549	NC_017440	GTC	2	6	289321	289326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246154
5550	NC_017440	AATT	2	8	289337	289344	50 %	50 %	0 %	0 %	385246154
5551	NC_017440	TC	3	6	289355	289360	0 %	50 %	0 %	50 %	385246154
5552	NC_017440	A	6	6	289373	289378	100 %	0 %	0 %	0 %	385246154
5553	NC_017440	TCA	2	6	289545	289550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246154
5554	NC_017440	TCGT	2	8	289685	289692	0 %	50 %	25 %	25 %	385246154
5555	NC_017440	A	6	6	289761	289766	100 %	0 %	0 %	0 %	385246154
5556	NC_017440	TGT	2	6	289794	289799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246154
5557	NC_017440	TCAT	2	8	289844	289851	25 %	50 %	0 %	25 %	385246154
5558	NC_017440	ATA	2	6	289901	289906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246154
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5560	NC_017440	GAAC	2	8	290008	290015	50 %	0 %	25 %	25 %	385246154
5561	NC_017440	AC	3	6	290027	290032	50 %	0 %	0 %	50 %	385246154
5562	NC_017440	ATT	2	6	290062	290067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246154
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5602	NC_017440	CAA	2	6	292100	292105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246156
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5606	NC_017440	CT	3	6	292562	292567	0 %	50 %	0 %	50 %	385246157
5607	NC_017440	CAG	2	6	292630	292635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246157
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5609	NC_017440	ATT	2	6	292723	292728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246157
5610	NC_017440	TAC	2	6	292778	292783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246157
5611	NC_017440	CTT	2	6	292821	292826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246157
5612	NC_017440	AGCA	2	8	292880	292887	50 %	0 %	25 %	25 %	385246157
5613	NC_017440	T	6	6	292948	292953	0 %	100 %	0 %	0 %	385246158
5614	NC_017440	AGAT	2	8	292978	292985	50 %	25 %	25 %	0 %	385246158
5615	NC_017440	AGCT	2	8	293002	293009	25 %	25 %	25 %	25 %	385246158
5616	NC_017440	CGAG	2	8	293026	293033	25 %	0 %	50 %	25 %	385246158
5617	NC_017440	CTG	2	6	293071	293076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246158
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5619	NC_017440	A	7	7	293291	293297	100 %	0 %	0 %	0 %	385246158
5620	NC_017440	GAA	2	6	293355	293360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246158
5621	NC_017440	CTA	2	6	293454	293459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246158
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5993	NC_017440	TTC	2	6	311605	311610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246176
5994	NC_017440	CTAT	2	8	311638	311645	25 %	50 %	0 %	25 %	385246176
5995	NC_017440	CTT	2	6	311689	311694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246176
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5997	NC_017440	A	6	6	311769	311774	100 %	0 %	0 %	0 %	385246176
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