MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 2508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385244969
2	NC_017439	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385244970
3	NC_017439	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385244970
4	NC_017439	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385244971
5	NC_017439	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385244971
6	NC_017439	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385244971
7	NC_017439	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385244972
8	NC_017439	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385244972
9	NC_017439	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385244972
10	NC_017439	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385244972
11	NC_017439	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	385244973
12	NC_017439	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	385244973
13	NC_017439	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	385244973
14	NC_017439	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	385244974
15	NC_017439	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	385244974
16	NC_017439	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	385244975
17	NC_017439	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	385244976
18	NC_017439	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	385244976
19	NC_017439	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	385244976
20	NC_017439	CTTT	2	8	9047	9054	0 %	75 %	0 %	25 %	385244976
21	NC_017439	TTCG	2	8	9419	9426	0 %	50 %	25 %	25 %	385244977
22	NC_017439	AATT	2	8	9524	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	385244977
23	NC_017439	ATGG	2	8	9583	9590	25 %	25 %	50 %	0 %	385244977
24	NC_017439	CTTT	2	8	10208	10215	0 %	75 %	0 %	25 %	385244978
25	NC_017439	GCAA	2	8	10425	10432	50 %	0 %	25 %	25 %	385244978
26	NC_017439	AGCC	2	8	10655	10662	25 %	0 %	25 %	50 %	385244978
27	NC_017439	GAAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	385244978
28	NC_017439	AATG	2	8	11531	11538	50 %	25 %	25 %	0 %	385244979
29	NC_017439	ATTT	2	8	12308	12315	25 %	75 %	0 %	0 %	385244979
30	NC_017439	GTTT	2	8	12563	12570	0 %	75 %	25 %	0 %	385244980
31	NC_017439	ATGC	2	8	12993	13000	25 %	25 %	25 %	25 %	385244980
32	NC_017439	TTGT	2	8	14029	14036	0 %	75 %	25 %	0 %	385244981
33	NC_017439	TTCT	2	8	14200	14207	0 %	75 %	0 %	25 %	385244981
34	NC_017439	ATTT	2	8	14406	14413	25 %	75 %	0 %	0 %	385244981
35	NC_017439	TTTC	2	8	15068	15075	0 %	75 %	0 %	25 %	385244982
36	NC_017439	AAAT	2	8	15550	15557	75 %	25 %	0 %	0 %	385244982
37	NC_017439	GTAA	2	8	16392	16399	50 %	25 %	25 %	0 %	385244983
38	NC_017439	CTAA	2	8	16585	16592	50 %	25 %	0 %	25 %	385244983
39	NC_017439	AGAA	2	8	16848	16855	75 %	0 %	25 %	0 %	385244983
40	NC_017439	ATTT	2	8	16994	17001	25 %	75 %	0 %	0 %	385244983
41	NC_017439	CTTT	2	8	18555	18562	0 %	75 %	0 %	25 %	385244985
42	NC_017439	GAAG	2	8	19500	19507	50 %	0 %	50 %	0 %	385244985
43	NC_017439	TTTG	2	8	19526	19533	0 %	75 %	25 %	0 %	385244985
44	NC_017439	TGTA	2	8	20218	20225	25 %	50 %	25 %	0 %	385244986
45	NC_017439	GATG	2	8	21633	21640	25 %	25 %	50 %	0 %	385244988
46	NC_017439	CATT	2	8	22692	22699	25 %	50 %	0 %	25 %	385244988
47	NC_017439	GCTT	2	8	23035	23042	0 %	50 %	25 %	25 %	385244988
48	NC_017439	GGTT	2	8	23083	23090	0 %	50 %	50 %	0 %	385244988
49	NC_017439	TTCT	2	8	23453	23460	0 %	75 %	0 %	25 %	385244988
50	NC_017439	TAAC	2	8	23555	23562	50 %	25 %	0 %	25 %	385244988
51	NC_017439	CATT	2	8	23678	23685	25 %	50 %	0 %	25 %	385244988
52	NC_017439	GGTA	2	8	24048	24055	25 %	25 %	50 %	0 %	385244988
53	NC_017439	TTGA	2	8	25043	25050	25 %	50 %	25 %	0 %	385244989
54	NC_017439	TTCG	2	8	25188	25195	0 %	50 %	25 %	25 %	385244989
55	NC_017439	TAGG	2	8	25267	25274	25 %	25 %	50 %	0 %	385244989
56	NC_017439	TTCC	2	8	25391	25398	0 %	50 %	0 %	50 %	385244989
57	NC_017439	TAGG	2	8	25505	25512	25 %	25 %	50 %	0 %	385244989
58	NC_017439	TTTC	2	8	25940	25947	0 %	75 %	0 %	25 %	385244989
59	NC_017439	GCTT	2	8	26277	26284	0 %	50 %	25 %	25 %	385244989
60	NC_017439	GGAA	2	8	26860	26867	50 %	0 %	50 %	0 %	385244990
61	NC_017439	TTAA	2	8	26933	26940	50 %	50 %	0 %	0 %	385244990
62	NC_017439	AAAG	2	8	26983	26990	75 %	0 %	25 %	0 %	385244990
63	NC_017439	GGGC	2	8	27263	27270	0 %	0 %	75 %	25 %	385244990
64	NC_017439	GTTT	2	8	27546	27553	0 %	75 %	25 %	0 %	385244991
65	NC_017439	CAGA	2	8	27568	27575	50 %	0 %	25 %	25 %	385244991
66	NC_017439	CTTT	2	8	29540	29547	0 %	75 %	0 %	25 %	385244993
67	NC_017439	TTTG	2	8	29555	29562	0 %	75 %	25 %	0 %	385244993
68	NC_017439	TTGT	2	8	29590	29597	0 %	75 %	25 %	0 %	385244993
69	NC_017439	TGGC	2	8	29753	29760	0 %	25 %	50 %	25 %	385244993
70	NC_017439	AAAG	2	8	30313	30320	75 %	0 %	25 %	0 %	385244994
71	NC_017439	AAAC	2	8	30383	30390	75 %	0 %	0 %	25 %	385244994
72	NC_017439	GATG	2	8	30526	30533	25 %	25 %	50 %	0 %	385244994
73	NC_017439	GATA	2	8	31635	31642	50 %	25 %	25 %	0 %	385244996
74	NC_017439	TGAT	2	8	34130	34137	25 %	50 %	25 %	0 %	385244999
75	NC_017439	AAGA	3	12	34258	34269	75 %	0 %	25 %	0 %	385244999
76	NC_017439	AAGC	2	8	34478	34485	50 %	0 %	25 %	25 %	385245000
77	NC_017439	GTTC	2	8	34511	34518	0 %	50 %	25 %	25 %	385245000
78	NC_017439	GGCA	2	8	34890	34897	25 %	0 %	50 %	25 %	385245001
79	NC_017439	TCGA	2	8	35147	35154	25 %	25 %	25 %	25 %	385245001
80	NC_017439	TGCT	2	8	35300	35307	0 %	50 %	25 %	25 %	385245001
81	NC_017439	TTGG	2	8	35532	35539	0 %	50 %	50 %	0 %	385245001
82	NC_017439	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	385245001
83	NC_017439	CTTT	2	8	36625	36632	0 %	75 %	0 %	25 %	385245002
84	NC_017439	ATGA	2	8	37115	37122	50 %	25 %	25 %	0 %	385245002
85	NC_017439	TAGG	2	8	37274	37281	25 %	25 %	50 %	0 %	385245002
86	NC_017439	CAAT	2	8	37458	37465	50 %	25 %	0 %	25 %	385245002
87	NC_017439	AATG	2	8	38245	38252	50 %	25 %	25 %	0 %	385245002
88	NC_017439	AGAA	2	8	39082	39089	75 %	0 %	25 %	0 %	385245003
89	NC_017439	AAGA	2	8	39134	39141	75 %	0 %	25 %	0 %	385245003
90	NC_017439	ATCC	2	8	39142	39149	25 %	25 %	0 %	50 %	385245003
91	NC_017439	TAAT	2	8	39353	39360	50 %	50 %	0 %	0 %	385245003
92	NC_017439	GTGC	2	8	41441	41448	0 %	25 %	50 %	25 %	385245005
93	NC_017439	AGAA	2	8	41860	41867	75 %	0 %	25 %	0 %	385245005
94	NC_017439	GGAT	2	8	42012	42019	25 %	25 %	50 %	0 %	385245005
95	NC_017439	AAAC	2	8	43220	43227	75 %	0 %	0 %	25 %	385245008
96	NC_017439	CAAT	2	8	43424	43431	50 %	25 %	0 %	25 %	385245008
97	NC_017439	ATTT	2	8	44181	44188	25 %	75 %	0 %	0 %	385245010
98	NC_017439	GCTC	2	8	44489	44496	0 %	25 %	25 %	50 %	385245010
99	NC_017439	TTCT	2	8	44631	44638	0 %	75 %	0 %	25 %	385245010
100	NC_017439	TTGA	2	8	45231	45238	25 %	50 %	25 %	0 %	385245011
101	NC_017439	TGTT	2	8	45403	45410	0 %	75 %	25 %	0 %	385245011
102	NC_017439	CTAT	2	8	45433	45440	25 %	50 %	0 %	25 %	385245011
103	NC_017439	TGTT	2	8	45462	45469	0 %	75 %	25 %	0 %	385245011
104	NC_017439	CTAT	2	8	45758	45765	25 %	50 %	0 %	25 %	385245011
105	NC_017439	AAGA	2	8	46254	46261	75 %	0 %	25 %	0 %	385245012
106	NC_017439	AAGA	2	8	46311	46318	75 %	0 %	25 %	0 %	385245012
107	NC_017439	AAAG	2	8	46351	46358	75 %	0 %	25 %	0 %	385245012
108	NC_017439	AAGA	2	8	46466	46473	75 %	0 %	25 %	0 %	385245012
109	NC_017439	ACTT	2	8	46727	46734	25 %	50 %	0 %	25 %	385245012
110	NC_017439	ATGG	2	8	47353	47360	25 %	25 %	50 %	0 %	385245012
111	NC_017439	AGGA	2	8	47384	47391	50 %	0 %	50 %	0 %	385245012
112	NC_017439	GAAC	2	8	47931	47938	50 %	0 %	25 %	25 %	385245012
113	NC_017439	AACA	2	8	48175	48182	75 %	0 %	0 %	25 %	385245013
114	NC_017439	CTTT	2	8	48371	48378	0 %	75 %	0 %	25 %	385245013
115	NC_017439	CTTT	2	8	49256	49263	0 %	75 %	0 %	25 %	385245014
116	NC_017439	GTAG	2	8	49274	49281	25 %	25 %	50 %	0 %	385245014
117	NC_017439	GAAG	2	8	50702	50709	50 %	0 %	50 %	0 %	385245015
118	NC_017439	TTCA	2	8	51124	51131	25 %	50 %	0 %	25 %	385245015
119	NC_017439	TCTA	2	8	51341	51348	25 %	50 %	0 %	25 %	385245015
120	NC_017439	GGAA	2	8	52506	52513	50 %	0 %	50 %	0 %	385245017
121	NC_017439	TTAA	2	8	53247	53254	50 %	50 %	0 %	0 %	385245017
122	NC_017439	CCTT	2	8	53454	53461	0 %	50 %	0 %	50 %	385245018
123	NC_017439	TTTA	2	8	53621	53628	25 %	75 %	0 %	0 %	385245018
124	NC_017439	AAAG	2	8	53845	53852	75 %	0 %	25 %	0 %	385245018
125	NC_017439	GATT	2	8	53982	53989	25 %	50 %	25 %	0 %	385245018
126	NC_017439	AATC	2	8	54037	54044	50 %	25 %	0 %	25 %	385245018
127	NC_017439	GGAT	2	8	54330	54337	25 %	25 %	50 %	0 %	385245019
128	NC_017439	TCGA	2	8	54492	54499	25 %	25 %	25 %	25 %	385245019
129	NC_017439	CTTC	2	8	54586	54593	0 %	50 %	0 %	50 %	385245019
130	NC_017439	GAAT	2	8	54621	54628	50 %	25 %	25 %	0 %	385245019
131	NC_017439	TTGA	2	8	54691	54698	25 %	50 %	25 %	0 %	385245019
132	NC_017439	GGAA	2	8	55047	55054	50 %	0 %	50 %	0 %	385245019
133	NC_017439	CTGG	3	12	55958	55969	0 %	25 %	50 %	25 %	385245020
134	NC_017439	TTGC	2	8	56095	56102	0 %	50 %	25 %	25 %	385245020
135	NC_017439	CGTT	2	8	59362	59369	0 %	50 %	25 %	25 %	385245022
136	NC_017439	GGAG	2	8	59371	59378	25 %	0 %	75 %	0 %	385245022
137	NC_017439	GTAA	2	8	59423	59430	50 %	25 %	25 %	0 %	385245022
138	NC_017439	ATGG	2	8	59650	59657	25 %	25 %	50 %	0 %	385245022
139	NC_017439	ATAA	2	8	59796	59803	75 %	25 %	0 %	0 %	385245022
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