MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 20238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017439	GCT	2	6	214317	214322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245160
4002	NC_017439	GAA	2	6	214402	214407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245160
4003	NC_017439	ACG	2	6	214418	214423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245160
4004	NC_017439	AGCG	2	8	214528	214535	25 %	0 %	50 %	25 %	385245160
4005	NC_017439	CT	3	6	214565	214570	0 %	50 %	0 %	50 %	385245160
4006	NC_017439	CT	3	6	214573	214578	0 %	50 %	0 %	50 %	385245160
4007	NC_017439	AGC	2	6	214580	214585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245160
4008	NC_017439	A	6	6	214652	214657	100 %	0 %	0 %	0 %	385245160
4009	NC_017439	CAC	2	6	214672	214677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385245160
4010	NC_017439	TGTTT	2	10	214722	214731	0 %	80 %	20 %	0 %	385245160
4011	NC_017439	CTA	2	6	214774	214779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245160
4012	NC_017439	TCT	2	6	214794	214799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245160
4013	NC_017439	TAGA	2	8	214825	214832	50 %	25 %	25 %	0 %	385245160
4014	NC_017439	CTTGT	2	10	214903	214912	0 %	60 %	20 %	20 %	385245160
4015	NC_017439	ATT	2	6	214919	214924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245160
4016	NC_017439	CAT	2	6	214993	214998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245160
4017	NC_017439	AGA	2	6	215095	215100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245160
4018	NC_017439	CG	3	6	215198	215203	0 %	0 %	50 %	50 %	385245160
4019	NC_017439	CTGGAT	2	12	215230	215241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385245160
4020	NC_017439	GTA	2	6	215455	215460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245160
4021	NC_017439	ACC	2	6	215469	215474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385245160
4022	NC_017439	CTTG	2	8	215497	215504	0 %	50 %	25 %	25 %	385245160
4023	NC_017439	GAAATA	2	12	215553	215564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385245160
4024	NC_017439	AAC	2	6	215585	215590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245160
4025	NC_017439	CCA	2	6	215635	215640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385245160
4026	NC_017439	CGT	2	6	215746	215751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245160
4027	NC_017439	TTTCT	2	10	215753	215762	0 %	80 %	0 %	20 %	385245160
4028	NC_017439	TAA	2	6	215782	215787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245161
4029	NC_017439	CTG	2	6	215820	215825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245161
4030	NC_017439	CTT	2	6	215950	215955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245161
4031	NC_017439	ACG	2	6	216088	216093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245161
4032	NC_017439	ACA	2	6	216323	216328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245162
4033	NC_017439	AATA	2	8	216368	216375	75 %	25 %	0 %	0 %	385245162
4034	NC_017439	CTT	2	6	216418	216423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245162
4035	NC_017439	TTG	2	6	216551	216556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245162
4036	NC_017439	TCC	2	6	216561	216566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245162
4037	NC_017439	AAG	2	6	216601	216606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245162
4038	NC_017439	CTT	2	6	216607	216612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245162
4039	NC_017439	CTT	2	6	216634	216639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245162
4040	NC_017439	TGC	2	6	216694	216699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245162
4041	NC_017439	CCA	2	6	216756	216761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385245162
4042	NC_017439	CAAA	2	8	216776	216783	75 %	0 %	0 %	25 %	385245162
4043	NC_017439	CCA	2	6	216795	216800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385245162
4044	NC_017439	TAC	2	6	216847	216852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245162
4045	NC_017439	CTT	2	6	216910	216915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245162
4046	NC_017439	CTC	2	6	216935	216940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245162
4047	NC_017439	T	8	8	216949	216956	0 %	100 %	0 %	0 %	385245162
4048	NC_017439	CTA	2	6	216988	216993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245162
4049	NC_017439	TA	3	6	217037	217042	50 %	50 %	0 %	0 %	385245163
4050	NC_017439	ATG	2	6	217090	217095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245163
4051	NC_017439	TGT	2	6	217098	217103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245163
4052	NC_017439	GC	3	6	217163	217168	0 %	0 %	50 %	50 %	385245163
4053	NC_017439	AGA	2	6	217225	217230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245163
4054	NC_017439	ATT	2	6	217240	217245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245163
4055	NC_017439	CTG	2	6	217392	217397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245163
4056	NC_017439	CAC	2	6	217420	217425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385245163
4057	NC_017439	TCT	2	6	217490	217495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245163
4058	NC_017439	C	6	6	217534	217539	0 %	0 %	0 %	100 %	385245163
4059	NC_017439	ATGA	2	8	217540	217547	50 %	25 %	25 %	0 %	385245163
4060	NC_017439	T	6	6	217574	217579	0 %	100 %	0 %	0 %	385245163
4061	NC_017439	GCA	2	6	217662	217667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245163
4062	NC_017439	GAA	2	6	217680	217685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245163
4063	NC_017439	GAAA	2	8	217733	217740	75 %	0 %	25 %	0 %	385245163
4064	NC_017439	TCA	2	6	217781	217786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245163
4065	NC_017439	ATG	2	6	217796	217801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245163
4066	NC_017439	TCC	2	6	217807	217812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245163
4067	NC_017439	T	6	6	217813	217818	0 %	100 %	0 %	0 %	385245163
4068	NC_017439	TAA	2	6	217893	217898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245163
4069	NC_017439	CCAC	2	8	217931	217938	25 %	0 %	0 %	75 %	385245163
4070	NC_017439	AGC	2	6	217939	217944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245163
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4072	NC_017439	T	7	7	218116	218122	0 %	100 %	0 %	0 %	385245163
4073	NC_017439	AGA	2	6	218406	218411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245164
4074	NC_017439	AGT	2	6	218431	218436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245164
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4078	NC_017439	TC	3	6	218607	218612	0 %	50 %	0 %	50 %	385245164
4079	NC_017439	TTC	2	6	218613	218618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245164
4080	NC_017439	AAAG	2	8	218624	218631	75 %	0 %	25 %	0 %	385245164
4081	NC_017439	TAC	2	6	218646	218651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245164
4082	NC_017439	TGC	2	6	218664	218669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245164
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4084	NC_017439	T	6	6	218748	218753	0 %	100 %	0 %	0 %	385245164
4085	NC_017439	TAA	2	6	218799	218804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245164
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4087	NC_017439	TCT	2	6	218909	218914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245164
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4089	NC_017439	CTT	2	6	219018	219023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245164
4090	NC_017439	AAT	2	6	219097	219102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245164
4091	NC_017439	ATT	2	6	219184	219189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245164
4092	NC_017439	CTT	2	6	219207	219212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245164
4093	NC_017439	GTT	2	6	219218	219223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245164
4094	NC_017439	A	6	6	219238	219243	100 %	0 %	0 %	0 %	385245164
4095	NC_017439	TTCC	2	8	219272	219279	0 %	50 %	0 %	50 %	385245164
4096	NC_017439	TTC	2	6	219336	219341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245164
4097	NC_017439	ATC	2	6	219361	219366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245164
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4099	NC_017439	TA	3	6	219576	219581	50 %	50 %	0 %	0 %	385245164
4100	NC_017439	CTG	2	6	219618	219623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245164
4101	NC_017439	CTT	2	6	219639	219644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245164
4102	NC_017439	TCA	2	6	219662	219667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245164
4103	NC_017439	ATG	2	6	220173	220178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245165
4104	NC_017439	GAT	2	6	220231	220236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245165
4105	NC_017439	AGA	2	6	220250	220255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245165
4106	NC_017439	AAC	2	6	220275	220280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245165
4107	NC_017439	CTC	2	6	220323	220328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245165
4108	NC_017439	T	7	7	220343	220349	0 %	100 %	0 %	0 %	385245165
4109	NC_017439	A	6	6	220353	220358	100 %	0 %	0 %	0 %	385245165
4110	NC_017439	CTC	2	6	220368	220373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245165
4111	NC_017439	CGAA	2	8	220375	220382	50 %	0 %	25 %	25 %	385245165
4112	NC_017439	ATT	2	6	220390	220395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245165
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4115	NC_017439	AACA	2	8	220542	220549	75 %	0 %	0 %	25 %	385245165
4116	NC_017439	TGTC	2	8	220569	220576	0 %	50 %	25 %	25 %	385245165
4117	NC_017439	ACG	2	6	220688	220693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245165
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4119	NC_017439	TCTA	2	8	220756	220763	25 %	50 %	0 %	25 %	385245165
4120	NC_017439	CTT	2	6	220818	220823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245165
4121	NC_017439	CA	3	6	220827	220832	50 %	0 %	0 %	50 %	385245165
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4247	NC_017439	CATT	2	8	226226	226233	25 %	50 %	0 %	25 %	385245170
4248	NC_017439	CTT	2	6	226256	226261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245170
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4250	NC_017439	TTA	2	6	226363	226368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245171
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4364	NC_017439	A	6	6	232271	232276	100 %	0 %	0 %	0 %	385245176
4365	NC_017439	AAG	2	6	232367	232372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245176
4366	NC_017439	A	6	6	232466	232471	100 %	0 %	0 %	0 %	385245176
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4492	NC_017439	GTC	2	6	240272	240277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245181
4493	NC_017439	TCC	2	6	240317	240322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245181
4494	NC_017439	ACGG	2	8	240330	240337	25 %	0 %	50 %	25 %	385245181
4495	NC_017439	AGA	2	6	240350	240355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245181
4496	NC_017439	CAA	2	6	240380	240385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245181
4497	NC_017439	TCA	2	6	240438	240443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245181
4498	NC_017439	TCT	2	6	240465	240470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245181
4499	NC_017439	AAACCA	2	12	240535	240546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245181
4500	NC_017439	A	6	6	240556	240561	100 %	0 %	0 %	0 %	385245181

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