MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 20238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017439	TAA	2	6	82847	82852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245042
1502	NC_017439	CAT	2	6	82863	82868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245042
1503	NC_017439	GAA	2	6	82875	82880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245042
1504	NC_017439	GA	3	6	82960	82965	50 %	0 %	50 %	0 %	385245042
1505	NC_017439	TAC	2	6	83011	83016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245043
1506	NC_017439	T	6	6	83035	83040	0 %	100 %	0 %	0 %	385245043
1507	NC_017439	T	7	7	83047	83053	0 %	100 %	0 %	0 %	385245043
1508	NC_017439	T	6	6	83060	83065	0 %	100 %	0 %	0 %	385245043
1509	NC_017439	GTA	2	6	83146	83151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245043
1510	NC_017439	T	6	6	83157	83162	0 %	100 %	0 %	0 %	385245043
1511	NC_017439	TATG	2	8	83181	83188	25 %	50 %	25 %	0 %	385245043
1512	NC_017439	TAT	2	6	83210	83215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245043
1513	NC_017439	GTCTGT	2	12	83224	83235	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385245043
1514	NC_017439	TCA	2	6	83244	83249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245043
1515	NC_017439	TCAT	2	8	83252	83259	25 %	50 %	0 %	25 %	385245043
1516	NC_017439	CAA	2	6	83294	83299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245043
1517	NC_017439	ACTG	2	8	83304	83311	25 %	25 %	25 %	25 %	385245043
1518	NC_017439	CATT	2	8	83319	83326	25 %	50 %	0 %	25 %	385245043
1519	NC_017439	AGA	2	6	83352	83357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245043
1520	NC_017439	AGCA	2	8	83358	83365	50 %	0 %	25 %	25 %	385245043
1521	NC_017439	TC	3	6	83380	83385	0 %	50 %	0 %	50 %	385245043
1522	NC_017439	ATTA	2	8	83511	83518	50 %	50 %	0 %	0 %	385245043
1523	NC_017439	TTTG	2	8	83551	83558	0 %	75 %	25 %	0 %	385245043
1524	NC_017439	TTG	2	6	83648	83653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245043
1525	NC_017439	GAT	2	6	83745	83750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245043
1526	NC_017439	TCTA	2	8	83835	83842	25 %	50 %	0 %	25 %	385245043
1527	NC_017439	CTA	2	6	83863	83868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245043
1528	NC_017439	TAT	2	6	83916	83921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245043
1529	NC_017439	TAAG	2	8	83940	83947	50 %	25 %	25 %	0 %	385245043
1530	NC_017439	AGT	2	6	84029	84034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245044
1531	NC_017439	TAT	2	6	84056	84061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245044
1532	NC_017439	TGC	2	6	84071	84076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245044
1533	NC_017439	AAG	2	6	84091	84096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245044
1534	NC_017439	TC	3	6	84103	84108	0 %	50 %	0 %	50 %	385245044
1535	NC_017439	AG	3	6	84114	84119	50 %	0 %	50 %	0 %	385245044
1536	NC_017439	GAA	2	6	84147	84152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245044
1537	NC_017439	CAG	2	6	84286	84291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245044
1538	NC_017439	TAA	2	6	84332	84337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245044
1539	NC_017439	AG	3	6	84381	84386	50 %	0 %	50 %	0 %	385245044
1540	NC_017439	TTC	2	6	84400	84405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245044
1541	NC_017439	GAAG	2	8	84444	84451	50 %	0 %	50 %	0 %	385245044
1542	NC_017439	A	6	6	84468	84473	100 %	0 %	0 %	0 %	385245044
1543	NC_017439	AGA	2	6	84518	84523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245044
1544	NC_017439	TTC	2	6	84596	84601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245044
1545	NC_017439	TAAA	2	8	84610	84617	75 %	25 %	0 %	0 %	385245044
1546	NC_017439	ATCC	2	8	84681	84688	25 %	25 %	0 %	50 %	385245044
1547	NC_017439	TGG	2	6	84709	84714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245044
1548	NC_017439	TGA	2	6	84742	84747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245044
1549	NC_017439	TCC	2	6	84749	84754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245044
1550	NC_017439	ACA	2	6	84773	84778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245044
1551	NC_017439	TTTC	2	8	84828	84835	0 %	75 %	0 %	25 %	385245044
1552	NC_017439	AGAT	2	8	84869	84876	50 %	25 %	25 %	0 %	385245044
1553	NC_017439	AGCGA	2	10	84893	84902	40 %	0 %	40 %	20 %	385245044
1554	NC_017439	CTT	2	6	84906	84911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245044
1555	NC_017439	T	6	6	84932	84937	0 %	100 %	0 %	0 %	385245044
1556	NC_017439	GAA	2	6	85059	85064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245044
1557	NC_017439	AAT	2	6	85313	85318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245045
1558	NC_017439	AT	3	6	85317	85322	50 %	50 %	0 %	0 %	385245045
1559	NC_017439	AGC	2	6	85385	85390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245045
1560	NC_017439	AG	3	6	85412	85417	50 %	0 %	50 %	0 %	385245045
1561	NC_017439	GAAA	2	8	85450	85457	75 %	0 %	25 %	0 %	385245045
1562	NC_017439	T	6	6	85587	85592	0 %	100 %	0 %	0 %	385245045
1563	NC_017439	TGG	2	6	85688	85693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245045
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1565	NC_017439	CTT	2	6	85744	85749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245045
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1567	NC_017439	TCT	2	6	85833	85838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245045
1568	NC_017439	CTT	2	6	85839	85844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245045
1569	NC_017439	GAAA	2	8	85845	85852	75 %	0 %	25 %	0 %	385245045
1570	NC_017439	GCA	2	6	85868	85873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245045
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1587	NC_017439	T	6	6	87117	87122	0 %	100 %	0 %	0 %	385245045
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1593	NC_017439	ATG	2	6	87403	87408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245046
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1599	NC_017439	AGG	2	6	87666	87671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245046
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1608	NC_017439	TTC	2	6	88084	88089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245046
1609	NC_017439	GAG	2	6	88260	88265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245047
1610	NC_017439	TGT	2	6	88309	88314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245047
1611	NC_017439	TAG	2	6	88335	88340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245047
1612	NC_017439	GGAT	2	8	88439	88446	25 %	25 %	50 %	0 %	385245047
1613	NC_017439	CTT	2	6	88455	88460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245047
1614	NC_017439	GAA	2	6	88485	88490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245047
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1620	NC_017439	AAG	2	6	88781	88786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245047
1621	NC_017439	CAAT	2	8	88806	88813	50 %	25 %	0 %	25 %	385245047
1622	NC_017439	TTCTGA	2	12	88838	88849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385245047
1623	NC_017439	AG	3	6	88890	88895	50 %	0 %	50 %	0 %	385245047
1624	NC_017439	A	6	6	88943	88948	100 %	0 %	0 %	0 %	385245047
1625	NC_017439	CGA	2	6	88949	88954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245047
1626	NC_017439	AAT	2	6	88975	88980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245047
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