MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 20238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017439	TTC	2	6	28678	28683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244992
502	NC_017439	GC	4	8	28849	28856	0 %	0 %	50 %	50 %	385244992
503	NC_017439	AAG	2	6	28857	28862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244992
504	NC_017439	TA	3	6	28971	28976	50 %	50 %	0 %	0 %	385244992
505	NC_017439	GAA	2	6	29060	29065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244992
506	NC_017439	TGT	2	6	29092	29097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244993
507	NC_017439	TCT	2	6	29160	29165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244993
508	NC_017439	ACA	2	6	29388	29393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244993
509	NC_017439	ATG	2	6	29398	29403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244993
510	NC_017439	CTTT	2	8	29540	29547	0 %	75 %	0 %	25 %	385244993
511	NC_017439	TTTG	2	8	29555	29562	0 %	75 %	25 %	0 %	385244993
512	NC_017439	TTGT	2	8	29590	29597	0 %	75 %	25 %	0 %	385244993
513	NC_017439	CCTAT	2	10	29609	29618	20 %	40 %	0 %	40 %	385244993
514	NC_017439	T	6	6	29625	29630	0 %	100 %	0 %	0 %	385244993
515	NC_017439	ATC	2	6	29704	29709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244993
516	NC_017439	TGGC	2	8	29753	29760	0 %	25 %	50 %	25 %	385244993
517	NC_017439	T	8	8	29859	29866	0 %	100 %	0 %	0 %	385244993
518	NC_017439	ATG	2	6	29884	29889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244993
519	NC_017439	GA	3	6	29922	29927	50 %	0 %	50 %	0 %	385244993
520	NC_017439	AG	3	6	30020	30025	50 %	0 %	50 %	0 %	385244994
521	NC_017439	GTT	2	6	30101	30106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244994
522	NC_017439	GAA	2	6	30110	30115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244994
523	NC_017439	TC	3	6	30129	30134	0 %	50 %	0 %	50 %	385244994
524	NC_017439	TCT	2	6	30176	30181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244994
525	NC_017439	ACT	2	6	30266	30271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244994
526	NC_017439	TTC	2	6	30294	30299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244994
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529	NC_017439	AAAC	2	8	30383	30390	75 %	0 %	0 %	25 %	385244994
530	NC_017439	T	6	6	30400	30405	0 %	100 %	0 %	0 %	385244994
531	NC_017439	AAGGA	2	10	30409	30418	60 %	0 %	40 %	0 %	385244994
532	NC_017439	GGC	2	6	30436	30441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244994
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535	NC_017439	TAG	2	6	30537	30542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244994
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537	NC_017439	TAA	2	6	30721	30726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244994
538	NC_017439	GA	3	6	30750	30755	50 %	0 %	50 %	0 %	385244994
539	NC_017439	AGA	2	6	30880	30885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244994
540	NC_017439	TCG	2	6	30943	30948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244994
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543	NC_017439	GAA	2	6	31022	31027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244994
544	NC_017439	ATT	2	6	31058	31063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244994
545	NC_017439	ATG	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244994
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547	NC_017439	T	6	6	31199	31204	0 %	100 %	0 %	0 %	385244994
548	NC_017439	GA	3	6	31218	31223	50 %	0 %	50 %	0 %	385244994
549	NC_017439	A	7	7	31241	31247	100 %	0 %	0 %	0 %	385244994
550	NC_017439	ACA	2	6	31287	31292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244995
551	NC_017439	TGT	2	6	31308	31313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244995
552	NC_017439	T	6	6	31427	31432	0 %	100 %	0 %	0 %	385244995
553	NC_017439	GAGCT	2	10	31448	31457	20 %	20 %	40 %	20 %	385244995
554	NC_017439	A	6	6	31522	31527	100 %	0 %	0 %	0 %	385244995
555	NC_017439	A	6	6	31553	31558	100 %	0 %	0 %	0 %	385244995
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561	NC_017439	AAG	2	6	31855	31860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244996
562	NC_017439	CTT	2	6	31894	31899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244996
563	NC_017439	CGT	2	6	31925	31930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244996
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612	NC_017439	GA	4	8	34620	34627	50 %	0 %	50 %	0 %	385245000
613	NC_017439	AGA	2	6	34655	34660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245000
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625	NC_017439	TG	3	6	35445	35450	0 %	50 %	50 %	0 %	385245001
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