MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 2021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017436	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385244091
2	NC_017436	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385244091
3	NC_017436	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385244092
4	NC_017436	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385244093
5	NC_017436	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385244093
6	NC_017436	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385244093
7	NC_017436	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385244093
8	NC_017436	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385244093
9	NC_017436	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385244095
10	NC_017436	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385244096
11	NC_017436	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385244096
12	NC_017436	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385244096
13	NC_017436	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	385244098
14	NC_017436	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	385244098
15	NC_017436	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	385244099
16	NC_017436	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	385244099
17	NC_017436	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	385244100
18	NC_017436	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	385244100
19	NC_017436	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	385244100
20	NC_017436	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	385244101
21	NC_017436	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	385244102
22	NC_017436	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	385244102
23	NC_017436	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	385244103
24	NC_017436	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	385244103
25	NC_017436	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	385244103
26	NC_017436	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	385244104
27	NC_017436	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	385244104
28	NC_017436	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	385244105
29	NC_017436	TC	3	6	18650	18655	0 %	50 %	0 %	50 %	385244105
30	NC_017436	GA	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
31	NC_017436	GA	3	6	18764	18769	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
32	NC_017436	AG	3	6	19230	19235	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
33	NC_017436	AG	4	8	19516	19523	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
34	NC_017436	GT	3	6	19779	19784	0 %	50 %	50 %	0 %	385244105
35	NC_017436	AG	3	6	20007	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	385244106
36	NC_017436	TG	3	6	20120	20125	0 %	50 %	50 %	0 %	385244106
37	NC_017436	CT	4	8	21917	21924	0 %	50 %	0 %	50 %	385244107
38	NC_017436	AT	3	6	22187	22192	50 %	50 %	0 %	0 %	385244107
39	NC_017436	AT	3	6	22511	22516	50 %	50 %	0 %	0 %	385244107
40	NC_017436	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
41	NC_017436	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
42	NC_017436	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
43	NC_017436	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385244108
44	NC_017436	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385244108
45	NC_017436	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385244108
46	NC_017436	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385244108
47	NC_017436	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	385244109
48	NC_017436	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385244109
49	NC_017436	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	385244111
50	NC_017436	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385244111
51	NC_017436	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385244111
52	NC_017436	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385244111
53	NC_017436	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385244112
54	NC_017436	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
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57	NC_017436	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
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62	NC_017436	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385244115
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64	NC_017436	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385244117
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68	NC_017436	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
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70	NC_017436	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
71	NC_017436	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
72	NC_017436	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
73	NC_017436	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	385244122
74	NC_017436	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	385244122
75	NC_017436	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	385244122
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108	NC_017436	GA	3	6	62291	62296	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
109	NC_017436	GA	3	6	62556	62561	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
110	NC_017436	TC	3	6	62712	62717	0 %	50 %	0 %	50 %	385244141
111	NC_017436	AT	3	6	62893	62898	50 %	50 %	0 %	0 %	385244141
112	NC_017436	AG	3	6	63093	63098	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
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115	NC_017436	AG	3	6	63587	63592	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
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118	NC_017436	GA	3	6	65197	65202	50 %	0 %	50 %	0 %	385244143
119	NC_017436	CT	3	6	65237	65242	0 %	50 %	0 %	50 %	385244143
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123	NC_017436	AG	3	6	66459	66464	50 %	0 %	50 %	0 %	385244144
124	NC_017436	GA	3	6	66832	66837	50 %	0 %	50 %	0 %	385244144
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133	NC_017436	GA	3	6	70636	70641	50 %	0 %	50 %	0 %	385244147
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139	NC_017436	GA	3	6	75450	75455	50 %	0 %	50 %	0 %	385244151
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142	NC_017436	AG	3	6	77002	77007	50 %	0 %	50 %	0 %	385244152
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