MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 2535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017436	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385244089
2	NC_017436	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385244090
3	NC_017436	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385244090
4	NC_017436	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385244091
5	NC_017436	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385244091
6	NC_017436	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385244091
7	NC_017436	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385244092
8	NC_017436	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385244092
9	NC_017436	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385244092
10	NC_017436	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385244092
11	NC_017436	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	385244093
12	NC_017436	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	385244093
13	NC_017436	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	385244093
14	NC_017436	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	385244094
15	NC_017436	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	385244094
16	NC_017436	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	385244095
17	NC_017436	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	385244096
18	NC_017436	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	385244096
19	NC_017436	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	385244096
20	NC_017436	CTTT	2	8	9047	9054	0 %	75 %	0 %	25 %	385244096
21	NC_017436	TTCG	2	8	9419	9426	0 %	50 %	25 %	25 %	385244097
22	NC_017436	AATT	2	8	9524	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	385244097
23	NC_017436	ATGG	2	8	9583	9590	25 %	25 %	50 %	0 %	385244097
24	NC_017436	CTTT	2	8	10208	10215	0 %	75 %	0 %	25 %	385244098
25	NC_017436	GCAA	2	8	10425	10432	50 %	0 %	25 %	25 %	385244098
26	NC_017436	AGCC	2	8	10655	10662	25 %	0 %	25 %	50 %	385244098
27	NC_017436	GAAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	385244098
28	NC_017436	AATG	2	8	11541	11548	50 %	25 %	25 %	0 %	385244099
29	NC_017436	ATTT	2	8	12318	12325	25 %	75 %	0 %	0 %	385244099
30	NC_017436	GTTT	2	8	12573	12580	0 %	75 %	25 %	0 %	385244100
31	NC_017436	ATGC	2	8	13003	13010	25 %	25 %	25 %	25 %	385244100
32	NC_017436	TTGT	2	8	14039	14046	0 %	75 %	25 %	0 %	385244101
33	NC_017436	ATTT	2	8	14416	14423	25 %	75 %	0 %	0 %	385244101
34	NC_017436	TTTC	2	8	15078	15085	0 %	75 %	0 %	25 %	385244102
35	NC_017436	AAAT	2	8	15560	15567	75 %	25 %	0 %	0 %	385244102
36	NC_017436	GTAA	2	8	16402	16409	50 %	25 %	25 %	0 %	385244103
37	NC_017436	CTAA	2	8	16595	16602	50 %	25 %	0 %	25 %	385244103
38	NC_017436	AGAA	2	8	16858	16865	75 %	0 %	25 %	0 %	385244103
39	NC_017436	ATTT	2	8	17004	17011	25 %	75 %	0 %	0 %	385244103
40	NC_017436	TGCG	2	8	18526	18533	0 %	25 %	50 %	25 %	385244105
41	NC_017436	CTTT	2	8	18565	18572	0 %	75 %	0 %	25 %	385244105
42	NC_017436	GAAG	2	8	19510	19517	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
43	NC_017436	TTTG	2	8	19536	19543	0 %	75 %	25 %	0 %	385244105
44	NC_017436	TGTA	2	8	20228	20235	25 %	50 %	25 %	0 %	385244106
45	NC_017436	GATG	2	8	21644	21651	25 %	25 %	50 %	0 %	385244107
46	NC_017436	CATT	2	8	22703	22710	25 %	50 %	0 %	25 %	385244107
47	NC_017436	GCTT	2	8	23046	23053	0 %	50 %	25 %	25 %	385244107
48	NC_017436	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	385244107
49	NC_017436	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	385244107
50	NC_017436	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	385244107
51	NC_017436	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	385244107
52	NC_017436	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	385244107
53	NC_017436	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	385244108
54	NC_017436	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	385244108
55	NC_017436	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	385244108
56	NC_017436	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	385244108
57	NC_017436	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	385244108
58	NC_017436	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	385244109
59	NC_017436	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	385244109
60	NC_017436	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	385244109
61	NC_017436	GGGC	2	8	27274	27281	0 %	0 %	75 %	25 %	385244109
62	NC_017436	GTTT	2	8	27557	27564	0 %	75 %	25 %	0 %	385244110
63	NC_017436	CAGA	2	8	27579	27586	50 %	0 %	25 %	25 %	385244110
64	NC_017436	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385244112
65	NC_017436	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385244112
66	NC_017436	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385244112
67	NC_017436	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385244112
68	NC_017436	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385244113
69	NC_017436	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385244113
70	NC_017436	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385244113
71	NC_017436	GATA	2	8	31646	31653	50 %	25 %	25 %	0 %	385244115
72	NC_017436	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	385244118
73	NC_017436	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	385244118
74	NC_017436	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	385244119
75	NC_017436	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	385244119
76	NC_017436	GGCA	2	8	34901	34908	25 %	0 %	50 %	25 %	385244120
77	NC_017436	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	385244120
78	NC_017436	TGCT	2	8	35311	35318	0 %	50 %	25 %	25 %	385244120
79	NC_017436	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	385244120
80	NC_017436	TTGG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	50 %	0 %	385244120
81	NC_017436	AGAT	2	8	36263	36270	50 %	25 %	25 %	0 %	385244120
82	NC_017436	CTTT	2	8	36636	36643	0 %	75 %	0 %	25 %	385244121
83	NC_017436	ATGA	2	8	37126	37133	50 %	25 %	25 %	0 %	385244121
84	NC_017436	TAGG	2	8	37285	37292	25 %	25 %	50 %	0 %	385244121
85	NC_017436	CAAT	2	8	37469	37476	50 %	25 %	0 %	25 %	385244121
86	NC_017436	AATG	2	8	38256	38263	50 %	25 %	25 %	0 %	385244121
87	NC_017436	AGAA	2	8	39093	39100	75 %	0 %	25 %	0 %	385244122
88	NC_017436	AAGA	2	8	39145	39152	75 %	0 %	25 %	0 %	385244122
89	NC_017436	ATCC	2	8	39153	39160	25 %	25 %	0 %	50 %	385244122
90	NC_017436	TAAT	2	8	39364	39371	50 %	50 %	0 %	0 %	385244122
91	NC_017436	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	385244123
92	NC_017436	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	385244123
93	NC_017436	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	385244123
94	NC_017436	AAAC	2	8	43233	43240	75 %	0 %	0 %	25 %	385244125
95	NC_017436	CAAT	2	8	43437	43444	50 %	25 %	0 %	25 %	385244125
96	NC_017436	ATTT	2	8	44194	44201	25 %	75 %	0 %	0 %	385244127
97	NC_017436	GCTC	2	8	44502	44509	0 %	25 %	25 %	50 %	385244127
98	NC_017436	TTCT	2	8	44644	44651	0 %	75 %	0 %	25 %	385244127
99	NC_017436	TTGA	2	8	45244	45251	25 %	50 %	25 %	0 %	385244128
100	NC_017436	TGTT	2	8	45416	45423	0 %	75 %	25 %	0 %	385244128
101	NC_017436	CTAT	2	8	45446	45453	25 %	50 %	0 %	25 %	385244128
102	NC_017436	TGTT	2	8	45475	45482	0 %	75 %	25 %	0 %	385244128
103	NC_017436	CTAT	2	8	45771	45778	25 %	50 %	0 %	25 %	385244128
104	NC_017436	AAGA	2	8	46266	46273	75 %	0 %	25 %	0 %	385244129
105	NC_017436	AAGA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	385244129
106	NC_017436	AAAG	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	385244129
107	NC_017436	AAGA	2	8	46478	46485	75 %	0 %	25 %	0 %	385244129
108	NC_017436	ACTT	2	8	46739	46746	25 %	50 %	0 %	25 %	385244129
109	NC_017436	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	385244129
110	NC_017436	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	385244129
111	NC_017436	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	385244129
112	NC_017436	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	385244129
113	NC_017436	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	385244130
114	NC_017436	CTTT	2	8	49268	49275	0 %	75 %	0 %	25 %	385244131
115	NC_017436	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	385244131
116	NC_017436	GAAG	2	8	50714	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	385244132
117	NC_017436	TTCA	2	8	51136	51143	25 %	50 %	0 %	25 %	385244132
118	NC_017436	TATT	2	8	52180	52187	25 %	75 %	0 %	0 %	385244134
119	NC_017436	GGAA	2	8	52411	52418	50 %	0 %	50 %	0 %	385244134
120	NC_017436	TTAA	2	8	53152	53159	50 %	50 %	0 %	0 %	385244134
121	NC_017436	CCTT	2	8	53359	53366	0 %	50 %	0 %	50 %	385244135
122	NC_017436	TTTA	2	8	53526	53533	25 %	75 %	0 %	0 %	385244135
123	NC_017436	AAAG	2	8	53750	53757	75 %	0 %	25 %	0 %	385244135
124	NC_017436	GATT	2	8	53887	53894	25 %	50 %	25 %	0 %	385244135
125	NC_017436	AATC	2	8	53942	53949	50 %	25 %	0 %	25 %	385244135
126	NC_017436	TATT	2	8	54003	54010	25 %	75 %	0 %	0 %	385244135
127	NC_017436	TCGA	2	8	54391	54398	25 %	25 %	25 %	25 %	385244136
128	NC_017436	CTTC	2	8	54485	54492	0 %	50 %	0 %	50 %	385244136
129	NC_017436	GAAT	2	8	54520	54527	50 %	25 %	25 %	0 %	385244136
130	NC_017436	TTGA	2	8	54590	54597	25 %	50 %	25 %	0 %	385244136
131	NC_017436	GGAA	2	8	54946	54953	50 %	0 %	50 %	0 %	385244136
132	NC_017436	ACAT	2	8	55468	55475	50 %	25 %	0 %	25 %	385244136
133	NC_017436	TTGC	2	8	55841	55848	0 %	50 %	25 %	25 %	385244137
134	NC_017436	AGCT	2	8	56340	56347	25 %	25 %	25 %	25 %	385244137
135	NC_017436	GTTG	2	8	57128	57135	0 %	50 %	50 %	0 %	385244137
136	NC_017436	AGAA	2	8	57988	57995	75 %	0 %	25 %	0 %	385244138
137	NC_017436	AGGT	2	8	58028	58035	25 %	25 %	50 %	0 %	385244138
138	NC_017436	GGAA	2	8	58582	58589	50 %	0 %	50 %	0 %	385244138
139	NC_017436	TAGA	2	8	58707	58714	50 %	25 %	25 %	0 %	385244138
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