MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017436	AGA	2	6	181871	181876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244243
3502	NC_017436	GAA	2	6	181884	181889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244243
3503	NC_017436	AGA	3	9	181928	181936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244243
3504	NC_017436	TCG	2	6	182082	182087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244244
3505	NC_017436	TGT	2	6	182094	182099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244244
3506	NC_017436	T	6	6	182112	182117	0 %	100 %	0 %	0 %	385244244
3507	NC_017436	T	7	7	182119	182125	0 %	100 %	0 %	0 %	385244244
3508	NC_017436	AAG	2	6	182172	182177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244244
3509	NC_017436	GATG	2	8	182203	182210	25 %	25 %	50 %	0 %	385244244
3510	NC_017436	TCT	2	6	182220	182225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244244
3511	NC_017436	AGG	2	6	182274	182279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244244
3512	NC_017436	GGA	2	6	182308	182313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244244
3513	NC_017436	TTGAG	2	10	182353	182362	20 %	40 %	40 %	0 %	385244244
3514	NC_017436	GAATG	2	10	182378	182387	40 %	20 %	40 %	0 %	385244244
3515	NC_017436	CT	3	6	182428	182433	0 %	50 %	0 %	50 %	385244244
3516	NC_017436	TGA	2	6	182442	182447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244244
3517	NC_017436	GA	4	8	182470	182477	50 %	0 %	50 %	0 %	385244244
3518	NC_017436	AAC	2	6	182525	182530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244244
3519	NC_017436	TGA	2	6	182544	182549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244244
3520	NC_017436	TGC	2	6	182580	182585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244244
3521	NC_017436	CCAG	2	8	182600	182607	25 %	0 %	25 %	50 %	385244244
3522	NC_017436	TTG	2	6	182609	182614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244244
3523	NC_017436	ACT	2	6	182619	182624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244244
3524	NC_017436	GAT	2	6	182648	182653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244244
3525	NC_017436	GA	3	6	182674	182679	50 %	0 %	50 %	0 %	385244244
3526	NC_017436	GCG	2	6	182682	182687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244244
3527	NC_017436	ACT	2	6	182730	182735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244244
3528	NC_017436	TAG	2	6	182764	182769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244244
3529	NC_017436	TCGC	2	8	182862	182869	0 %	25 %	25 %	50 %	385244245
3530	NC_017436	AGA	2	6	182873	182878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
3531	NC_017436	GCA	2	6	182882	182887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244245
3532	NC_017436	TA	3	6	182917	182922	50 %	50 %	0 %	0 %	385244245
3533	NC_017436	GAA	2	6	182952	182957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
3534	NC_017436	AGA	2	6	182991	182996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
3535	NC_017436	GA	3	6	183030	183035	50 %	0 %	50 %	0 %	385244245
3536	NC_017436	GTT	2	6	183047	183052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244245
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3538	NC_017436	CTT	2	6	183090	183095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244245
3539	NC_017436	GA	3	6	183133	183138	50 %	0 %	50 %	0 %	385244245
3540	NC_017436	GTT	2	6	183144	183149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244245
3541	NC_017436	GAG	2	6	183165	183170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244245
3542	NC_017436	GAA	2	6	183185	183190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
3543	NC_017436	TTG	2	6	183196	183201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244245
3544	NC_017436	AGG	2	6	183235	183240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244245
3545	NC_017436	AGA	2	6	183331	183336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
3546	NC_017436	TGA	2	6	183353	183358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244245
3547	NC_017436	CAG	3	9	183426	183434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244245
3548	NC_017436	GTA	2	6	183469	183474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244245
3549	NC_017436	GTTG	2	8	183509	183516	0 %	50 %	50 %	0 %	385244245
3550	NC_017436	GGA	3	9	183524	183532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244245
3551	NC_017436	TC	3	6	183540	183545	0 %	50 %	0 %	50 %	385244245
3552	NC_017436	ATT	2	6	183559	183564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244245
3553	NC_017436	A	7	7	183589	183595	100 %	0 %	0 %	0 %	385244245
3554	NC_017436	T	8	8	183601	183608	0 %	100 %	0 %	0 %	385244245
3555	NC_017436	ATA	2	6	183651	183656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244245
3556	NC_017436	A	6	6	183656	183661	100 %	0 %	0 %	0 %	385244245
3557	NC_017436	AGA	2	6	183814	183819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244246
3558	NC_017436	TGT	2	6	183873	183878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244246
3559	NC_017436	TCT	3	9	183942	183950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244246
3560	NC_017436	TTTC	2	8	184015	184022	0 %	75 %	0 %	25 %	385244246
3561	NC_017436	CTG	2	6	184063	184068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244246
3562	NC_017436	GGA	2	6	184090	184095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244246
3563	NC_017436	TAG	2	6	184115	184120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244246
3564	NC_017436	AGT	2	6	184245	184250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244246
3565	NC_017436	ATCG	2	8	184272	184279	25 %	25 %	25 %	25 %	385244246
3566	NC_017436	TCA	2	6	184355	184360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244247
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3569	NC_017436	GCA	2	6	184559	184564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244247
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3574	NC_017436	TGC	2	6	185227	185232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244248
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3580	NC_017436	GTC	2	6	185844	185849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244249
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3587	NC_017436	TA	3	6	186171	186176	50 %	50 %	0 %	0 %	385244249
3588	NC_017436	CTT	2	6	186192	186197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244249
3589	NC_017436	TAG	2	6	186198	186203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244249
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3592	NC_017436	GCTT	2	8	186268	186275	0 %	50 %	25 %	25 %	385244249
3593	NC_017436	CAC	2	6	186300	186305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244249
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3597	NC_017436	ACGAT	2	10	186535	186544	40 %	20 %	20 %	20 %	385244249
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3599	NC_017436	AAG	2	6	186564	186569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244249
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3602	NC_017436	A	6	6	186704	186709	100 %	0 %	0 %	0 %	385244249
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3604	NC_017436	GCTT	2	8	186760	186767	0 %	50 %	25 %	25 %	385244249
3605	NC_017436	T	7	7	186766	186772	0 %	100 %	0 %	0 %	385244249
3606	NC_017436	A	6	6	186807	186812	100 %	0 %	0 %	0 %	385244249
3607	NC_017436	GCT	2	6	186896	186901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244249
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3609	NC_017436	GCTT	2	8	187201	187208	0 %	50 %	25 %	25 %	385244249
3610	NC_017436	TAG	2	6	187239	187244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244249
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3612	NC_017436	T	7	7	187282	187288	0 %	100 %	0 %	0 %	385244249
3613	NC_017436	TTA	2	6	187312	187317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244249
3614	NC_017436	TCC	2	6	187380	187385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244250
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3618	NC_017436	TGC	2	6	187495	187500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244250
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3620	NC_017436	AGT	2	6	187586	187591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244250
3621	NC_017436	TTG	2	6	187594	187599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244250
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3623	NC_017436	CAC	2	6	188197	188202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244251
3624	NC_017436	TAC	2	6	188278	188283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244251
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