MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017436	AGG	2	6	155710	155715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244225
3003	NC_017436	AAAG	2	8	155792	155799	75 %	0 %	25 %	0 %	385244225
3004	NC_017436	ATT	2	6	156134	156139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244226
3005	NC_017436	AT	3	6	156143	156148	50 %	50 %	0 %	0 %	385244226
3006	NC_017436	CTT	2	6	156181	156186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244226
3007	NC_017436	TGGAGA	2	12	156206	156217	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385244226
3008	NC_017436	GCTT	2	8	156249	156256	0 %	50 %	25 %	25 %	385244226
3009	NC_017436	GCA	2	6	156279	156284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244226
3010	NC_017436	TAGA	2	8	156301	156308	50 %	25 %	25 %	0 %	385244226
3011	NC_017436	AG	3	6	156376	156381	50 %	0 %	50 %	0 %	385244226
3012	NC_017436	CCCA	2	8	156429	156436	25 %	0 %	0 %	75 %	385244226
3013	NC_017436	CTT	2	6	156450	156455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244226
3014	NC_017436	ATG	2	6	156486	156491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244226
3015	NC_017436	TAA	2	6	156534	156539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244226
3016	NC_017436	T	7	7	156543	156549	0 %	100 %	0 %	0 %	385244226
3017	NC_017436	AGA	2	6	156599	156604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244226
3018	NC_017436	A	6	6	156635	156640	100 %	0 %	0 %	0 %	385244226
3019	NC_017436	GAA	3	9	156702	156710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244226
3020	NC_017436	GT	3	6	156765	156770	0 %	50 %	50 %	0 %	385244226
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3022	NC_017436	TCT	2	6	156789	156794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244226
3023	NC_017436	AG	3	6	156804	156809	50 %	0 %	50 %	0 %	385244226
3024	NC_017436	AGG	2	6	156877	156882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244226
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3026	NC_017436	AG	3	6	156922	156927	50 %	0 %	50 %	0 %	385244226
3027	NC_017436	AG	3	6	156987	156992	50 %	0 %	50 %	0 %	385244226
3028	NC_017436	ATC	2	6	156998	157003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244226
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3031	NC_017436	A	6	6	157076	157081	100 %	0 %	0 %	0 %	385244226
3032	NC_017436	ACAT	2	8	157092	157099	50 %	25 %	0 %	25 %	385244226
3033	NC_017436	ATT	2	6	157290	157295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244227
3034	NC_017436	T	7	7	157332	157338	0 %	100 %	0 %	0 %	385244227
3035	NC_017436	CTTG	2	8	157475	157482	0 %	50 %	25 %	25 %	385244227
3036	NC_017436	GA	3	6	157491	157496	50 %	0 %	50 %	0 %	385244227
3037	NC_017436	GCA	2	6	157544	157549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244227
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3039	NC_017436	CTCCAT	2	12	157576	157587	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385244227
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3045	NC_017436	ATG	2	6	157852	157857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244227
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3047	NC_017436	T	6	6	157922	157927	0 %	100 %	0 %	0 %	385244227
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3049	NC_017436	TCCTTG	2	12	158172	158183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385244228
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3052	NC_017436	AAGTTT	2	12	158257	158268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385244228
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3055	NC_017436	AGA	2	6	158439	158444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244228
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3059	NC_017436	ATT	2	6	159010	159015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244229
3060	NC_017436	CAT	2	6	159162	159167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244229
3061	NC_017436	TCAA	2	8	159223	159230	50 %	25 %	0 %	25 %	385244229
3062	NC_017436	TGA	2	6	159420	159425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244229
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3108	NC_017436	GGAA	2	8	162048	162055	50 %	0 %	50 %	0 %	385244232
3109	NC_017436	GAA	3	9	162063	162071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244232
3110	NC_017436	TTTC	2	8	162166	162173	0 %	75 %	0 %	25 %	385244232
3111	NC_017436	ATCT	2	8	162192	162199	25 %	50 %	0 %	25 %	385244232
3112	NC_017436	CTT	2	6	162217	162222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244232
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3115	NC_017436	TTG	2	6	162297	162302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244232
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3122	NC_017436	TG	3	6	162658	162663	0 %	50 %	50 %	0 %	385244232
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3493	NC_017436	ATT	2	6	181527	181532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244243
3494	NC_017436	GTTT	2	8	181583	181590	0 %	75 %	25 %	0 %	385244243
3495	NC_017436	CTT	2	6	181671	181676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244243
3496	NC_017436	AGA	2	6	181751	181756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244243
3497	NC_017436	TG	3	6	181784	181789	0 %	50 %	50 %	0 %	385244243
3498	NC_017436	AGGGG	2	10	181790	181799	20 %	0 %	80 %	0 %	385244243
3499	NC_017436	GA	3	6	181831	181836	50 %	0 %	50 %	0 %	385244243
3500	NC_017436	AGG	2	6	181859	181864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244243

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