MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2123	NC_017436	CTGA	2	8	112855	112862	25 %	25 %	25 %	25 %	385244183
2124	NC_017436	AAT	2	6	112921	112926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244183
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2128	NC_017436	CTT	2	6	113190	113195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244183
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2153	NC_017436	CTTT	2	8	114314	114321	0 %	75 %	0 %	25 %	385244184
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2156	NC_017436	T	6	6	114388	114393	0 %	100 %	0 %	0 %	385244184
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2230	NC_017436	T	6	6	117965	117970	0 %	100 %	0 %	0 %	385244188
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2233	NC_017436	GTAG	2	8	118053	118060	25 %	25 %	50 %	0 %	385244188
2234	NC_017436	G	6	6	118101	118106	0 %	0 %	100 %	0 %	385244188
2235	NC_017436	T	6	6	118124	118129	0 %	100 %	0 %	0 %	385244188
2236	NC_017436	GTT	2	6	118242	118247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244188
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2238	NC_017436	TTA	2	6	118272	118277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244188
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2240	NC_017436	A	8	8	118327	118334	100 %	0 %	0 %	0 %	385244188
2241	NC_017436	CTC	2	6	118342	118347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244188
2242	NC_017436	AAAGA	2	10	118383	118392	80 %	0 %	20 %	0 %	385244188
2243	NC_017436	AAT	2	6	118393	118398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244188
2244	NC_017436	TTA	2	6	118447	118452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244189
2245	NC_017436	T	6	6	118552	118557	0 %	100 %	0 %	0 %	385244189
2246	NC_017436	TTC	2	6	118638	118643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244189
2247	NC_017436	TCC	2	6	118651	118656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244189
2248	NC_017436	TTTA	2	8	118669	118676	25 %	75 %	0 %	0 %	385244189
2249	NC_017436	CTG	2	6	118867	118872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244189
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2251	NC_017436	TTGCCA	2	12	118919	118930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385244189
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2253	NC_017436	GAA	2	6	118956	118961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244189
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2255	NC_017436	TACT	2	8	119057	119064	25 %	50 %	0 %	25 %	385244189
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2269	NC_017436	GCTA	2	8	119531	119538	25 %	25 %	25 %	25 %	385244190
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2275	NC_017436	GA	4	8	119731	119738	50 %	0 %	50 %	0 %	385244190
2276	NC_017436	GGC	2	6	119771	119776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244190
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2278	NC_017436	TCT	2	6	119955	119960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244190
2279	NC_017436	GA	3	6	120064	120069	50 %	0 %	50 %	0 %	385244190
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2323	NC_017436	T	6	6	122687	122692	0 %	100 %	0 %	0 %	385244192
2324	NC_017436	AGCT	2	8	122720	122727	25 %	25 %	25 %	25 %	385244192
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2337	NC_017436	GA	3	6	123585	123590	50 %	0 %	50 %	0 %	385244193
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2343	NC_017436	GCAA	2	8	123711	123718	50 %	0 %	25 %	25 %	385244193
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2348	NC_017436	TTGCAT	2	12	123890	123901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385244193
2349	NC_017436	A	7	7	123908	123914	100 %	0 %	0 %	0 %	385244193
2350	NC_017436	CTG	2	6	123917	123922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244193
2351	NC_017436	TGA	2	6	123944	123949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244193
2352	NC_017436	ATT	2	6	123954	123959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244193
2353	NC_017436	ATCG	2	8	123976	123983	25 %	25 %	25 %	25 %	385244193
2354	NC_017436	AG	3	6	123997	124002	50 %	0 %	50 %	0 %	385244193
2355	NC_017436	AGC	2	6	124185	124190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244193
2356	NC_017436	TGT	2	6	124212	124217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244193
2357	NC_017436	TGA	2	6	124244	124249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244193
2358	NC_017436	AAGAGA	2	12	124259	124270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244193
2359	NC_017436	TAC	2	6	124297	124302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244193
2360	NC_017436	AGA	2	6	124314	124319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244193
2361	NC_017436	TTG	2	6	124320	124325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244193
2362	NC_017436	GA	3	6	124367	124372	50 %	0 %	50 %	0 %	385244193
2363	NC_017436	TAG	2	6	124386	124391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244193
2364	NC_017436	CTTC	2	8	124393	124400	0 %	50 %	0 %	50 %	385244193
2365	NC_017436	TCA	2	6	124513	124518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244193
2366	NC_017436	T	6	6	124542	124547	0 %	100 %	0 %	0 %	385244193
2367	NC_017436	ATAA	2	8	124595	124602	75 %	25 %	0 %	0 %	385244193
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