MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_017436	GGT	2	6	1006372	1006377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244940
19502	NC_017436	GTT	2	6	1006412	1006417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244940
19503	NC_017436	TCA	2	6	1006423	1006428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244940
19504	NC_017436	AGAT	2	8	1006455	1006462	50 %	25 %	25 %	0 %	385244940
19505	NC_017436	CAT	2	6	1006497	1006502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244940
19506	NC_017436	ACA	2	6	1006564	1006569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244940
19507	NC_017436	T	6	6	1006575	1006580	0 %	100 %	0 %	0 %	385244940
19508	NC_017436	ATGA	2	8	1006596	1006603	50 %	25 %	25 %	0 %	385244940
19509	NC_017436	AATTAA	2	12	1006632	1006643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244940
19510	NC_017436	GCT	2	6	1006648	1006653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244940
19511	NC_017436	AGT	2	6	1006693	1006698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244940
19512	NC_017436	ATT	2	6	1006726	1006731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244940
19513	NC_017436	GTT	2	6	1006771	1006776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244940
19514	NC_017436	AATT	2	8	1006845	1006852	50 %	50 %	0 %	0 %	385244940
19515	NC_017436	GCT	2	6	1006900	1006905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244940
19516	NC_017436	AGAA	2	8	1006923	1006930	75 %	0 %	25 %	0 %	385244940
19517	NC_017436	TG	3	6	1006982	1006987	0 %	50 %	50 %	0 %	385244940
19518	NC_017436	ATA	2	6	1007086	1007091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244940
19519	NC_017436	TAAA	2	8	1007153	1007160	75 %	25 %	0 %	0 %	385244940
19520	NC_017436	GAA	2	6	1007281	1007286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244940
19521	NC_017436	A	6	6	1007285	1007290	100 %	0 %	0 %	0 %	385244940
19522	NC_017436	TGA	2	6	1007291	1007296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244940
19523	NC_017436	TAGT	2	8	1007309	1007316	25 %	50 %	25 %	0 %	385244940
19524	NC_017436	CAC	2	6	1007322	1007327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244940
19525	NC_017436	AT	3	6	1007338	1007343	50 %	50 %	0 %	0 %	385244940
19526	NC_017436	TAA	2	6	1007345	1007350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244940
19527	NC_017436	CCT	2	6	1007500	1007505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244940
19528	NC_017436	AAT	2	6	1007529	1007534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244940
19529	NC_017436	GCAATA	2	12	1007578	1007589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385244940
19530	NC_017436	T	6	6	1007637	1007642	0 %	100 %	0 %	0 %	385244940
19531	NC_017436	CTT	2	6	1007663	1007668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244940
19532	NC_017436	TGTT	2	8	1008501	1008508	0 %	75 %	25 %	0 %	385244941
19533	NC_017436	GTTT	2	8	1008603	1008610	0 %	75 %	25 %	0 %	385244941
19534	NC_017436	ATG	2	6	1008639	1008644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244941
19535	NC_017436	GAA	2	6	1008648	1008653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244941
19536	NC_017436	TCT	2	6	1008679	1008684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244941
19537	NC_017436	TGC	2	6	1008689	1008694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244941
19538	NC_017436	GTT	2	6	1008748	1008753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244941
19539	NC_017436	TGC	2	6	1008775	1008780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244941
19540	NC_017436	TTAC	2	8	1008789	1008796	25 %	50 %	0 %	25 %	385244941
19541	NC_017436	CTTT	2	8	1008798	1008805	0 %	75 %	0 %	25 %	385244941
19542	NC_017436	TTTCC	2	10	1008806	1008815	0 %	60 %	0 %	40 %	385244941
19543	NC_017436	ATT	5	15	1008840	1008854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244941
19544	NC_017436	GCT	2	6	1008893	1008898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244941
19545	NC_017436	AGG	2	6	1008932	1008937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244941
19546	NC_017436	TAT	2	6	1009007	1009012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244941
19547	NC_017436	TAC	2	6	1009013	1009018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244941
19548	NC_017436	TTC	2	6	1009024	1009029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244941
19549	NC_017436	ATT	2	6	1009070	1009075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244941
19550	NC_017436	A	7	7	1009079	1009085	100 %	0 %	0 %	0 %	385244941
19551	NC_017436	CGT	2	6	1009086	1009091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244941
19552	NC_017436	TCC	2	6	1009211	1009216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244941
19553	NC_017436	TGGT	2	8	1009251	1009258	0 %	50 %	50 %	0 %	385244941
19554	NC_017436	CTC	2	6	1009276	1009281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244941
19555	NC_017436	TCT	2	6	1009338	1009343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244941
19556	NC_017436	CAA	2	6	1009507	1009512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244941
19557	NC_017436	GTAT	2	8	1009516	1009523	25 %	50 %	25 %	0 %	385244941
19558	NC_017436	CAG	2	6	1009567	1009572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244941
19559	NC_017436	TCA	2	6	1009591	1009596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244941
19560	NC_017436	CTT	2	6	1009666	1009671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244941
19561	NC_017436	TG	3	6	1009728	1009733	0 %	50 %	50 %	0 %	385244941
19562	NC_017436	TCT	2	6	1009901	1009906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244942
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19564	NC_017436	TTA	2	6	1009982	1009987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244942
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19567	NC_017436	CAG	2	6	1010108	1010113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244942
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19570	NC_017436	CCTT	2	8	1010188	1010195	0 %	50 %	0 %	50 %	385244942
19571	NC_017436	A	6	6	1010205	1010210	100 %	0 %	0 %	0 %	385244942
19572	NC_017436	TTC	2	6	1010251	1010256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244942
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19576	NC_017436	TAC	2	6	1010458	1010463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244942
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19578	NC_017436	AAGA	2	8	1010579	1010586	75 %	0 %	25 %	0 %	385244942
19579	NC_017436	TTC	2	6	1010773	1010778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244942
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19582	NC_017436	ATT	2	6	1010900	1010905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244942
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19585	NC_017436	GGT	2	6	1010960	1010965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244942
19586	NC_017436	CTTTAT	2	12	1010972	1010983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385244942
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19588	NC_017436	TTG	2	6	1011205	1011210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244942
19589	NC_017436	CTT	2	6	1011343	1011348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244942
19590	NC_017436	TTG	2	6	1011384	1011389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244942
19591	NC_017436	AGCTGG	2	12	1011400	1011411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385244942
19592	NC_017436	AG	3	6	1011488	1011493	50 %	0 %	50 %	0 %	385244942
19593	NC_017436	A	6	6	1011599	1011604	100 %	0 %	0 %	0 %	385244942
19594	NC_017436	ACG	2	6	1011627	1011632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244942
19595	NC_017436	ATT	2	6	1011638	1011643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244942
19596	NC_017436	ATGC	2	8	1011758	1011765	25 %	25 %	25 %	25 %	385244943
19597	NC_017436	AAG	2	6	1011946	1011951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244943
19598	NC_017436	T	6	6	1011973	1011978	0 %	100 %	0 %	0 %	385244943
19599	NC_017436	AGA	2	6	1012007	1012012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244943
19600	NC_017436	GATT	2	8	1012027	1012034	25 %	50 %	25 %	0 %	385244943
19601	NC_017436	A	6	6	1012095	1012100	100 %	0 %	0 %	0 %	385244943
19602	NC_017436	CAT	2	6	1012109	1012114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244943
19603	NC_017436	AAAG	2	8	1012126	1012133	75 %	0 %	25 %	0 %	385244943
19604	NC_017436	ATT	2	6	1012143	1012148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244943
19605	NC_017436	GAT	2	6	1012269	1012274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244943
19606	NC_017436	GCT	2	6	1012275	1012280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244943
19607	NC_017436	TTC	2	6	1012334	1012339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244943
19608	NC_017436	TGCTA	2	10	1012344	1012353	20 %	40 %	20 %	20 %	385244943
19609	NC_017436	TCCT	2	8	1012384	1012391	0 %	50 %	0 %	50 %	385244943
19610	NC_017436	TGTA	2	8	1012405	1012412	25 %	50 %	25 %	0 %	385244943
19611	NC_017436	GA	3	6	1012448	1012453	50 %	0 %	50 %	0 %	385244943
19612	NC_017436	AG	3	6	1012460	1012465	50 %	0 %	50 %	0 %	385244943
19613	NC_017436	GAG	2	6	1012468	1012473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244943
19614	NC_017436	ATC	2	6	1012492	1012497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244943
19615	NC_017436	TGA	2	6	1012499	1012504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244943
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