MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017436	ACA	2	6	81861	81866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244156
1502	NC_017436	GCG	2	6	81893	81898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244156
1503	NC_017436	T	6	6	81936	81941	0 %	100 %	0 %	0 %	385244156
1504	NC_017436	TGG	3	9	81962	81970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244156
1505	NC_017436	CAG	2	6	82038	82043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244156
1506	NC_017436	GTT	2	6	82049	82054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244156
1507	NC_017436	TATT	2	8	82059	82066	25 %	75 %	0 %	0 %	385244156
1508	NC_017436	GTG	2	6	82083	82088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244156
1509	NC_017436	CCT	2	6	82133	82138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244156
1510	NC_017436	GGAAG	2	10	82261	82270	40 %	0 %	60 %	0 %	385244156
1511	NC_017436	ATT	2	6	82280	82285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244156
1512	NC_017436	TTG	2	6	82302	82307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244156
1513	NC_017436	TTC	2	6	82310	82315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244156
1514	NC_017436	T	6	6	82344	82349	0 %	100 %	0 %	0 %	385244156
1515	NC_017436	GAA	2	6	82383	82388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244156
1516	NC_017436	GAA	2	6	82412	82417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244156
1517	NC_017436	GA	3	6	82474	82479	50 %	0 %	50 %	0 %	385244156
1518	NC_017436	GTTC	2	8	82484	82491	0 %	50 %	25 %	25 %	385244156
1519	NC_017436	GCT	2	6	82619	82624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244156
1520	NC_017436	GTGC	2	8	82631	82638	0 %	25 %	50 %	25 %	385244156
1521	NC_017436	TAA	2	6	82681	82686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244156
1522	NC_017436	CAT	2	6	82697	82702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244156
1523	NC_017436	GAA	2	6	82709	82714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244156
1524	NC_017436	GA	3	6	82794	82799	50 %	0 %	50 %	0 %	385244156
1525	NC_017436	TAC	2	6	82845	82850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244157
1526	NC_017436	T	6	6	82869	82874	0 %	100 %	0 %	0 %	385244157
1527	NC_017436	T	7	7	82881	82887	0 %	100 %	0 %	0 %	385244157
1528	NC_017436	T	6	6	82894	82899	0 %	100 %	0 %	0 %	385244157
1529	NC_017436	GTA	2	6	82980	82985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244157
1530	NC_017436	T	6	6	82991	82996	0 %	100 %	0 %	0 %	385244157
1531	NC_017436	TATG	2	8	83015	83022	25 %	50 %	25 %	0 %	385244157
1532	NC_017436	TAT	2	6	83044	83049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244157
1533	NC_017436	GTCTGT	2	12	83058	83069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385244157
1534	NC_017436	TCA	2	6	83078	83083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244157
1535	NC_017436	TCAT	2	8	83086	83093	25 %	50 %	0 %	25 %	385244157
1536	NC_017436	CAA	2	6	83128	83133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244157
1537	NC_017436	ACTG	2	8	83138	83145	25 %	25 %	25 %	25 %	385244157
1538	NC_017436	CATT	2	8	83153	83160	25 %	50 %	0 %	25 %	385244157
1539	NC_017436	AGA	2	6	83186	83191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244157
1540	NC_017436	AGCA	2	8	83192	83199	50 %	0 %	25 %	25 %	385244157
1541	NC_017436	TC	3	6	83214	83219	0 %	50 %	0 %	50 %	385244157
1542	NC_017436	TTA	2	6	83235	83240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244157
1543	NC_017436	ATTA	2	8	83345	83352	50 %	50 %	0 %	0 %	385244157
1544	NC_017436	TTTG	2	8	83385	83392	0 %	75 %	25 %	0 %	385244157
1545	NC_017436	TTG	2	6	83482	83487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244157
1546	NC_017436	GAT	2	6	83579	83584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244157
1547	NC_017436	TCTA	2	8	83669	83676	25 %	50 %	0 %	25 %	385244157
1548	NC_017436	CTA	2	6	83697	83702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244157
1549	NC_017436	TAT	2	6	83750	83755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244157
1550	NC_017436	TAAG	2	8	83774	83781	50 %	25 %	25 %	0 %	385244157
1551	NC_017436	AGT	2	6	83863	83868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244158
1552	NC_017436	TAT	2	6	83890	83895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244158
1553	NC_017436	TGC	2	6	83905	83910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244158
1554	NC_017436	AAG	2	6	83925	83930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244158
1555	NC_017436	AG	3	6	83948	83953	50 %	0 %	50 %	0 %	385244158
1556	NC_017436	GAA	2	6	83981	83986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244158
1557	NC_017436	CAG	2	6	84120	84125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244158
1558	NC_017436	TAA	2	6	84166	84171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244158
1559	NC_017436	AG	3	6	84215	84220	50 %	0 %	50 %	0 %	385244158
1560	NC_017436	TTC	2	6	84234	84239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244158
1561	NC_017436	GAAG	2	8	84278	84285	50 %	0 %	50 %	0 %	385244158
1562	NC_017436	A	6	6	84302	84307	100 %	0 %	0 %	0 %	385244158
1563	NC_017436	AGA	2	6	84352	84357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244158
1564	NC_017436	TTC	2	6	84430	84435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244158
1565	NC_017436	TAAA	2	8	84444	84451	75 %	25 %	0 %	0 %	385244158
1566	NC_017436	ATCC	2	8	84515	84522	25 %	25 %	0 %	50 %	385244158
1567	NC_017436	TGG	2	6	84543	84548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244158
1568	NC_017436	TGA	2	6	84576	84581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244158
1569	NC_017436	TCC	2	6	84583	84588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244158
1570	NC_017436	ACA	2	6	84607	84612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244158
1571	NC_017436	TTTC	2	8	84662	84669	0 %	75 %	0 %	25 %	385244158
1572	NC_017436	AGAT	2	8	84703	84710	50 %	25 %	25 %	0 %	385244158
1573	NC_017436	CTT	2	6	84740	84745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244158
1574	NC_017436	T	6	6	84766	84771	0 %	100 %	0 %	0 %	385244158
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1580	NC_017436	GAAA	2	8	85284	85291	75 %	0 %	25 %	0 %	385244159
1581	NC_017436	T	6	6	85421	85426	0 %	100 %	0 %	0 %	385244159
1582	NC_017436	TGG	2	6	85522	85527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244159
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1596	NC_017436	TTG	2	6	86127	86132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244159
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1601	NC_017436	AG	3	6	86530	86535	50 %	0 %	50 %	0 %	385244159
1602	NC_017436	TTA	2	6	86539	86544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244159
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1604	NC_017436	TA	3	6	86852	86857	50 %	50 %	0 %	0 %	385244159
1605	NC_017436	T	6	6	86951	86956	0 %	100 %	0 %	0 %	385244159
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1610	NC_017436	GGAT	2	8	88273	88280	25 %	25 %	50 %	0 %	385244160
1611	NC_017436	CTT	2	6	88289	88294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244160
1612	NC_017436	GAA	2	6	88319	88324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244160
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1614	NC_017436	GTA	2	6	88470	88475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244160
1615	NC_017436	GA	3	6	88518	88523	50 %	0 %	50 %	0 %	385244160
1616	NC_017436	TAT	2	6	88559	88564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244160
1617	NC_017436	CATT	2	8	88603	88610	25 %	50 %	0 %	25 %	385244160
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1620	NC_017436	TTCTGA	2	12	88672	88683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385244160
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1622	NC_017436	A	6	6	88777	88782	100 %	0 %	0 %	0 %	385244160
1623	NC_017436	CGA	2	6	88783	88788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244160
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1626	NC_017436	AG	3	6	88866	88871	50 %	0 %	50 %	0 %	385244160
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