MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017436	CTT	2	6	635720	635725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244651
12503	NC_017436	TGC	2	6	635782	635787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244651
12504	NC_017436	ACCA	2	8	635810	635817	50 %	0 %	0 %	50 %	385244651
12505	NC_017436	CT	3	6	635848	635853	0 %	50 %	0 %	50 %	385244651
12506	NC_017436	ATT	2	6	635895	635900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244651
12507	NC_017436	AGG	2	6	635926	635931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244651
12508	NC_017436	ATC	2	6	635972	635977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244651
12509	NC_017436	ATG	2	6	636005	636010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244651
12510	NC_017436	CAG	2	6	636090	636095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244651
12511	NC_017436	ATC	2	6	636131	636136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244651
12512	NC_017436	CTC	2	6	636147	636152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244651
12513	NC_017436	CTAC	2	8	636166	636173	25 %	25 %	0 %	50 %	385244651
12514	NC_017436	TGG	2	6	636221	636226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244651
12515	NC_017436	ATT	2	6	636246	636251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244651
12516	NC_017436	CTA	2	6	636279	636284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244651
12517	NC_017436	TCC	2	6	636301	636306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244651
12518	NC_017436	TGC	2	6	636425	636430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244652
12519	NC_017436	AAT	2	6	636451	636456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244652
12520	NC_017436	CAA	2	6	636624	636629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244652
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12522	NC_017436	C	6	6	636730	636735	0 %	0 %	0 %	100 %	385244652
12523	NC_017436	TG	3	6	636748	636753	0 %	50 %	50 %	0 %	385244652
12524	NC_017436	GAG	2	6	636809	636814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244652
12525	NC_017436	CT	3	6	636815	636820	0 %	50 %	0 %	50 %	385244652
12526	NC_017436	TCT	2	6	636943	636948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244653
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12530	NC_017436	GCA	2	6	637142	637147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244653
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12532	NC_017436	CG	3	6	637184	637189	0 %	0 %	50 %	50 %	385244653
12533	NC_017436	GAA	2	6	637257	637262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244653
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12535	NC_017436	GGA	2	6	637398	637403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244653
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12537	NC_017436	AGCA	2	8	637465	637472	50 %	0 %	25 %	25 %	385244653
12538	NC_017436	GAA	2	6	637565	637570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244653
12539	NC_017436	ATT	2	6	637627	637632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244653
12540	NC_017436	GGC	2	6	637634	637639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244653
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12543	NC_017436	TCGTT	2	10	637747	637756	0 %	60 %	20 %	20 %	385244653
12544	NC_017436	TTG	2	6	637789	637794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244653
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12549	NC_017436	TGG	2	6	637965	637970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244654
12550	NC_017436	CCTT	2	8	637982	637989	0 %	50 %	0 %	50 %	385244654
12551	NC_017436	TCCAT	2	10	638048	638057	20 %	40 %	0 %	40 %	385244654
12552	NC_017436	AGAA	2	8	638058	638065	75 %	0 %	25 %	0 %	385244654
12553	NC_017436	CCT	2	6	638099	638104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244654
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12555	NC_017436	CTA	2	6	638117	638122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244654
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12557	NC_017436	A	6	6	638216	638221	100 %	0 %	0 %	0 %	385244654
12558	NC_017436	CTCTTT	2	12	638319	638330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244654
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12562	NC_017436	TAAACA	2	12	638447	638458	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385244654
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12565	NC_017436	CAA	2	6	638623	638628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244655
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12600	NC_017436	TCC	2	6	639787	639792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244657
12601	NC_017436	TTTC	2	8	639882	639889	0 %	75 %	0 %	25 %	385244657
12602	NC_017436	AGAA	2	8	639911	639918	75 %	0 %	25 %	0 %	385244657
12603	NC_017436	CAC	2	6	639919	639924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244657
12604	NC_017436	TGC	2	6	639967	639972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244657
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12607	NC_017436	AAG	2	6	640155	640160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244657
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12735	NC_017436	CAAGC	2	10	646751	646760	40 %	0 %	20 %	40 %	385244662
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