MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_017436	ATCG	2	8	611769	611776	25 %	25 %	25 %	25 %	385244631
12002	NC_017436	AGA	2	6	611831	611836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244631
12003	NC_017436	GAA	2	6	611853	611858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244631
12004	NC_017436	AG	3	6	611892	611897	50 %	0 %	50 %	0 %	385244631
12005	NC_017436	CT	3	6	611898	611903	0 %	50 %	0 %	50 %	385244631
12006	NC_017436	TTAC	2	8	611920	611927	25 %	50 %	0 %	25 %	385244631
12007	NC_017436	TAA	2	6	611936	611941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244631
12008	NC_017436	CCT	2	6	611965	611970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244631
12009	NC_017436	TTTA	2	8	611973	611980	25 %	75 %	0 %	0 %	385244631
12010	NC_017436	CT	3	6	612013	612018	0 %	50 %	0 %	50 %	385244631
12011	NC_017436	ATT	2	6	612037	612042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244631
12012	NC_017436	TTTG	2	8	612071	612078	0 %	75 %	25 %	0 %	385244631
12013	NC_017436	ATT	2	6	612089	612094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244631
12014	NC_017436	GGCT	2	8	612111	612118	0 %	25 %	50 %	25 %	385244631
12015	NC_017436	TCT	2	6	612163	612168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244631
12016	NC_017436	ATT	2	6	612176	612181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244631
12017	NC_017436	TGG	2	6	612225	612230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244631
12018	NC_017436	T	6	6	612260	612265	0 %	100 %	0 %	0 %	385244631
12019	NC_017436	ATG	2	6	612282	612287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244631
12020	NC_017436	ATTGG	2	10	612288	612297	20 %	40 %	40 %	0 %	385244631
12021	NC_017436	A	6	6	612318	612323	100 %	0 %	0 %	0 %	385244631
12022	NC_017436	AGC	2	6	612371	612376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244631
12023	NC_017436	TTG	2	6	612433	612438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244631
12024	NC_017436	TCAA	2	8	612598	612605	50 %	25 %	0 %	25 %	385244632
12025	NC_017436	TTG	2	6	612611	612616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244632
12026	NC_017436	CGCT	2	8	612644	612651	0 %	25 %	25 %	50 %	385244632
12027	NC_017436	TTTG	2	8	612669	612676	0 %	75 %	25 %	0 %	385244632
12028	NC_017436	ATC	2	6	612724	612729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244632
12029	NC_017436	A	9	9	612769	612777	100 %	0 %	0 %	0 %	385244632
12030	NC_017436	CTT	2	6	612811	612816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244632
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12032	NC_017436	TTTG	2	8	612845	612852	0 %	75 %	25 %	0 %	385244632
12033	NC_017436	CTCTC	2	10	612853	612862	0 %	40 %	0 %	60 %	385244632
12034	NC_017436	ATAG	2	8	612898	612905	50 %	25 %	25 %	0 %	385244632
12035	NC_017436	GAA	2	6	612991	612996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244632
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12038	NC_017436	GAA	2	6	613099	613104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244632
12039	NC_017436	AAAAC	2	10	613113	613122	80 %	0 %	0 %	20 %	385244632
12040	NC_017436	AAC	2	6	613142	613147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244632
12041	NC_017436	GCTC	2	8	613242	613249	0 %	25 %	25 %	50 %	385244632
12042	NC_017436	AG	3	6	613276	613281	50 %	0 %	50 %	0 %	385244632
12043	NC_017436	TAG	2	6	613341	613346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244632
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12045	NC_017436	GCA	2	6	613390	613395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244632
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12047	NC_017436	A	8	8	613499	613506	100 %	0 %	0 %	0 %	385244632
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12052	NC_017436	TAT	3	9	613680	613688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244632
12053	NC_017436	ATT	2	6	613729	613734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244632
12054	NC_017436	TTC	2	6	613849	613854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244632
12055	NC_017436	TCA	2	6	613862	613867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244632
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12057	NC_017436	AG	3	6	613921	613926	50 %	0 %	50 %	0 %	385244632
12058	NC_017436	TTA	2	6	613931	613936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244632
12059	NC_017436	ATT	2	6	613978	613983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244632
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12062	NC_017436	TGC	2	6	614220	614225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244632
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12064	NC_017436	CA	3	6	614391	614396	50 %	0 %	0 %	50 %	385244632
12065	NC_017436	A	7	7	614407	614413	100 %	0 %	0 %	0 %	385244632
12066	NC_017436	TC	3	6	614465	614470	0 %	50 %	0 %	50 %	385244632
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12081	NC_017436	A	6	6	615265	615270	100 %	0 %	0 %	0 %	385244632
12082	NC_017436	TGG	2	6	615296	615301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244632
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12093	NC_017436	GAA	2	6	615784	615789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244632
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12097	NC_017436	AAAG	2	8	615987	615994	75 %	0 %	25 %	0 %	385244632
12098	NC_017436	AG	3	6	616003	616008	50 %	0 %	50 %	0 %	385244632
12099	NC_017436	TC	3	6	616010	616015	0 %	50 %	0 %	50 %	385244632
12100	NC_017436	TAAA	2	8	616037	616044	75 %	25 %	0 %	0 %	385244632
12101	NC_017436	TTAT	2	8	616060	616067	25 %	75 %	0 %	0 %	385244632
12102	NC_017436	CT	4	8	616108	616115	0 %	50 %	0 %	50 %	385244632
12103	NC_017436	TC	3	6	616151	616156	0 %	50 %	0 %	50 %	385244632
12104	NC_017436	T	6	6	616167	616172	0 %	100 %	0 %	0 %	385244632
12105	NC_017436	GAT	2	6	616180	616185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244632
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12107	NC_017436	ACT	2	6	616552	616557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244633
12108	NC_017436	TA	3	6	616581	616586	50 %	50 %	0 %	0 %	385244633
12109	NC_017436	TGAAT	2	10	616726	616735	40 %	40 %	20 %	0 %	385244633
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12113	NC_017436	TCC	2	6	616897	616902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244633
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12115	NC_017436	TCT	2	6	617066	617071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244633
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12121	NC_017436	T	6	6	617460	617465	0 %	100 %	0 %	0 %	385244634
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12123	NC_017436	TTA	2	6	617480	617485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244634
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12234	NC_017436	A	7	7	622727	622733	100 %	0 %	0 %	0 %	385244640
12235	NC_017436	CTTCT	2	10	622735	622744	0 %	60 %	0 %	40 %	385244640
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12240	NC_017436	T	6	6	622953	622958	0 %	100 %	0 %	0 %	385244640
12241	NC_017436	TCG	2	6	622960	622965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244640
12242	NC_017436	TCGC	2	8	622980	622987	0 %	25 %	25 %	50 %	385244640
12243	NC_017436	GGA	2	6	623196	623201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244641
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12364	NC_017436	GCA	2	6	629324	629329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244644
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12488	NC_017436	CTC	2	6	635241	635246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244650
12489	NC_017436	TAT	2	6	635248	635253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244650
12490	NC_017436	TGG	2	6	635277	635282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244650
12491	NC_017436	AGC	2	6	635293	635298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244650
12492	NC_017436	TTG	2	6	635340	635345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244650
12493	NC_017436	GGCT	2	8	635375	635382	0 %	25 %	50 %	25 %	385244650
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