MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017436	GCA	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244111
502	NC_017436	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385244111
503	NC_017436	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385244111
504	NC_017436	TTC	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244111
505	NC_017436	CAG	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244111
506	NC_017436	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244111
507	NC_017436	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244111
508	NC_017436	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244111
509	NC_017436	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385244111
510	NC_017436	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244111
511	NC_017436	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385244111
512	NC_017436	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244111
513	NC_017436	TGT	2	6	29103	29108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244112
514	NC_017436	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244112
515	NC_017436	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244112
516	NC_017436	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244112
517	NC_017436	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385244112
518	NC_017436	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385244112
519	NC_017436	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385244112
520	NC_017436	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385244112
521	NC_017436	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	385244112
522	NC_017436	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244112
523	NC_017436	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385244112
524	NC_017436	T	8	8	29870	29877	0 %	100 %	0 %	0 %	385244112
525	NC_017436	ATG	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244112
526	NC_017436	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385244112
527	NC_017436	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
528	NC_017436	GTT	2	6	30112	30117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244113
529	NC_017436	GAA	2	6	30121	30126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244113
530	NC_017436	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385244113
531	NC_017436	TCT	2	6	30187	30192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244113
532	NC_017436	ACT	2	6	30277	30282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244113
533	NC_017436	TTC	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244113
534	NC_017436	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385244113
535	NC_017436	CCT	2	6	30341	30346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244113
536	NC_017436	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385244113
537	NC_017436	T	6	6	30411	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	385244113
538	NC_017436	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385244113
539	NC_017436	GGC	2	6	30447	30452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244113
540	NC_017436	GAT	2	6	30526	30531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244113
541	NC_017436	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385244113
542	NC_017436	TAG	2	6	30548	30553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244113
543	NC_017436	GTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244113
544	NC_017436	TAA	2	6	30732	30737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244113
545	NC_017436	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
546	NC_017436	GAA	2	6	30871	30876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244113
547	NC_017436	AGA	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244113
548	NC_017436	TCG	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244113
549	NC_017436	ATG	2	6	30988	30993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244113
550	NC_017436	TGG	2	6	31002	31007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244113
551	NC_017436	GAA	2	6	31033	31038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244113
552	NC_017436	ATT	2	6	31069	31074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244113
553	NC_017436	ATG	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244113
554	NC_017436	AAG	2	6	31204	31209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244113
555	NC_017436	T	6	6	31210	31215	0 %	100 %	0 %	0 %	385244113
556	NC_017436	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
557	NC_017436	A	7	7	31252	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	385244113
558	NC_017436	ACA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244114
559	NC_017436	TGT	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244114
560	NC_017436	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385244114
561	NC_017436	T	6	6	31438	31443	0 %	100 %	0 %	0 %	385244114
562	NC_017436	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385244114
563	NC_017436	A	6	6	31533	31538	100 %	0 %	0 %	0 %	385244114
564	NC_017436	A	6	6	31564	31569	100 %	0 %	0 %	0 %	385244114
565	NC_017436	TGC	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244114
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568	NC_017436	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385244115
569	NC_017436	AAG	2	6	31859	31864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244115
570	NC_017436	AAG	2	6	31866	31871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244115
571	NC_017436	CTT	2	6	31905	31910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244115
572	NC_017436	CGT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244115
573	NC_017436	TGA	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244115
574	NC_017436	GAG	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244115
575	NC_017436	GCG	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244115
576	NC_017436	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385244115
577	NC_017436	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385244115
578	NC_017436	AGA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244115
579	NC_017436	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385244115
580	NC_017436	AAG	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244115
581	NC_017436	ATT	2	6	32471	32476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244115
582	NC_017436	T	6	6	32576	32581	0 %	100 %	0 %	0 %	385244115
583	NC_017436	AGG	2	6	32826	32831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244116
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586	NC_017436	GCT	2	6	33076	33081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244116
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592	NC_017436	CTT	2	6	33494	33499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244117
593	NC_017436	T	6	6	33516	33521	0 %	100 %	0 %	0 %	385244117
594	NC_017436	GTT	2	6	33534	33539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244117
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597	NC_017436	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385244117
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600	NC_017436	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385244118
601	NC_017436	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244118
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603	NC_017436	T	6	6	34046	34051	0 %	100 %	0 %	0 %	385244118
604	NC_017436	TTA	2	6	34076	34081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244118
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609	NC_017436	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	385244118
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612	NC_017436	ATG	2	6	34339	34344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244118
613	NC_017436	AAG	2	6	34370	34375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244118
614	NC_017436	GAA	2	6	34389	34394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244118
615	NC_017436	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	385244119
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617	NC_017436	GAT	2	6	34600	34605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244119
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619	NC_017436	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385244119
620	NC_017436	AGA	2	6	34666	34671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244119
621	NC_017436	TTA	2	6	34729	34734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244120
622	NC_017436	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244120
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627	NC_017436	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	385244120
628	NC_017436	GAG	2	6	35170	35175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244120
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630	NC_017436	AGA	2	6	35303	35308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244120
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