MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017436	GAA	2	6	281604	281609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244338
5502	NC_017436	TATC	2	8	281679	281686	25 %	50 %	0 %	25 %	385244338
5503	NC_017436	AGCT	2	8	281700	281707	25 %	25 %	25 %	25 %	385244338
5504	NC_017436	CTG	2	6	281866	281871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244338
5505	NC_017436	ACG	2	6	281905	281910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244338
5506	NC_017436	TAA	2	6	281968	281973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244338
5507	NC_017436	ATA	2	6	281975	281980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244338
5508	NC_017436	ATA	2	6	282030	282035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244338
5509	NC_017436	TGC	2	6	282037	282042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244338
5510	NC_017436	GGA	2	6	282266	282271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244338
5511	NC_017436	AGA	2	6	282313	282318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244338
5512	NC_017436	GAG	2	6	282393	282398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244338
5513	NC_017436	GTT	2	6	282403	282408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244338
5514	NC_017436	TTC	2	6	282470	282475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244338
5515	NC_017436	TCT	2	6	282554	282559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244338
5516	NC_017436	AGT	2	6	282568	282573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244338
5517	NC_017436	GCT	2	6	282600	282605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244338
5518	NC_017436	TTC	2	6	282621	282626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244338
5519	NC_017436	CCA	2	6	282632	282637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244338
5520	NC_017436	CT	3	6	282644	282649	0 %	50 %	0 %	50 %	385244338
5521	NC_017436	TAT	2	6	282663	282668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244338
5522	NC_017436	ACA	2	6	282677	282682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244338
5523	NC_017436	CT	3	6	282756	282761	0 %	50 %	0 %	50 %	385244338
5524	NC_017436	ATA	2	6	282799	282804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244338
5525	NC_017436	CT	3	6	282895	282900	0 %	50 %	0 %	50 %	385244338
5526	NC_017436	TCT	2	6	282935	282940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244338
5527	NC_017436	GTA	2	6	283027	283032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244338
5528	NC_017436	AC	3	6	283106	283111	50 %	0 %	0 %	50 %	385244338
5529	NC_017436	TCT	2	6	283112	283117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244338
5530	NC_017436	ATG	2	6	283173	283178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244338
5531	NC_017436	CTA	2	6	283269	283274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244338
5532	NC_017436	CTT	2	6	283332	283337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244338
5533	NC_017436	CAG	2	6	283450	283455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244338
5534	NC_017436	CTC	2	6	283504	283509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244338
5535	NC_017436	TAC	2	6	283528	283533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244338
5536	NC_017436	GCT	2	6	283578	283583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244338
5537	NC_017436	GAA	2	6	283624	283629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244338
5538	NC_017436	ATA	2	6	283671	283676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244338
5539	NC_017436	CGTT	2	8	283678	283685	0 %	50 %	25 %	25 %	385244338
5540	NC_017436	ATTC	2	8	283687	283694	25 %	50 %	0 %	25 %	385244338
5541	NC_017436	CAT	2	6	284006	284011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244339
5542	NC_017436	T	9	9	284011	284019	0 %	100 %	0 %	0 %	385244339
5543	NC_017436	ATC	2	6	284054	284059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244339
5544	NC_017436	TTC	2	6	284095	284100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244339
5545	NC_017436	GT	3	6	284119	284124	0 %	50 %	50 %	0 %	385244339
5546	NC_017436	CTG	2	6	284175	284180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244339
5547	NC_017436	CCA	2	6	284300	284305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244339
5548	NC_017436	CAC	2	6	284491	284496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244339
5549	NC_017436	CCT	2	6	284525	284530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244339
5550	NC_017436	CTCC	2	8	284573	284580	0 %	25 %	0 %	75 %	385244339
5551	NC_017436	AAGC	2	8	284595	284602	50 %	0 %	25 %	25 %	385244339
5552	NC_017436	ATG	2	6	284612	284617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244339
5553	NC_017436	T	6	6	284668	284673	0 %	100 %	0 %	0 %	385244339
5554	NC_017436	CTC	2	6	284674	284679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244339
5555	NC_017436	GAT	2	6	284723	284728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244339
5556	NC_017436	A	7	7	284729	284735	100 %	0 %	0 %	0 %	385244339
5557	NC_017436	AG	3	6	284796	284801	50 %	0 %	50 %	0 %	385244339
5558	NC_017436	CTT	2	6	285099	285104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244340
5559	NC_017436	ACT	2	6	285128	285133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244340
5560	NC_017436	GCTGT	2	10	285141	285150	0 %	40 %	40 %	20 %	385244340
5561	NC_017436	GTC	2	6	285209	285214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244340
5562	NC_017436	T	6	6	285228	285233	0 %	100 %	0 %	0 %	385244340
5563	NC_017436	ACT	2	6	285256	285261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244340
5564	NC_017436	ACT	2	6	285325	285330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244340
5565	NC_017436	TGC	2	6	285361	285366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244340
5566	NC_017436	T	7	7	285371	285377	0 %	100 %	0 %	0 %	385244340
5567	NC_017436	CTCCTA	2	12	285378	285389	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385244340
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5569	NC_017436	TC	3	6	285578	285583	0 %	50 %	0 %	50 %	385244340
5570	NC_017436	ATC	2	6	285603	285608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244340
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5572	NC_017436	TTCGA	2	10	285632	285641	20 %	40 %	20 %	20 %	385244340
5573	NC_017436	ATT	2	6	285667	285672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244340
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5578	NC_017436	TTG	2	6	285756	285761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244341
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5580	NC_017436	CTTT	2	8	285946	285953	0 %	75 %	0 %	25 %	385244341
5581	NC_017436	T	7	7	285951	285957	0 %	100 %	0 %	0 %	385244341
5582	NC_017436	GAA	2	6	286005	286010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244341
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5587	NC_017436	GAA	2	6	286241	286246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244341
5588	NC_017436	T	6	6	286250	286255	0 %	100 %	0 %	0 %	385244341
5589	NC_017436	TTC	2	6	286274	286279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244341
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5593	NC_017436	TTTG	2	8	286381	286388	0 %	75 %	25 %	0 %	385244341
5594	NC_017436	TCTTT	2	10	286389	286398	0 %	80 %	0 %	20 %	385244341
5595	NC_017436	TTTA	2	8	286409	286416	25 %	75 %	0 %	0 %	385244341
5596	NC_017436	A	8	8	286497	286504	100 %	0 %	0 %	0 %	385244341
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5599	NC_017436	TTC	2	6	286745	286750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244342
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5602	NC_017436	CTT	2	6	286834	286839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244342
5603	NC_017436	AGTA	2	8	286892	286899	50 %	25 %	25 %	0 %	385244342
5604	NC_017436	TA	3	6	286979	286984	50 %	50 %	0 %	0 %	385244342
5605	NC_017436	TTC	2	6	287081	287086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244342
5606	NC_017436	TTC	2	6	287283	287288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244343
5607	NC_017436	GTTT	2	8	287331	287338	0 %	75 %	25 %	0 %	385244343
5608	NC_017436	CTT	2	6	287369	287374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244343
5609	NC_017436	A	6	6	287400	287405	100 %	0 %	0 %	0 %	385244343
5610	NC_017436	TCT	2	6	287468	287473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244343
5611	NC_017436	TAG	2	6	287519	287524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244343
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5615	NC_017436	CTAT	2	8	287841	287848	25 %	50 %	0 %	25 %	385244343
5616	NC_017436	GAA	2	6	287854	287859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244343
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5618	NC_017436	ATG	2	6	287906	287911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244343
5619	NC_017436	TA	3	6	287933	287938	50 %	50 %	0 %	0 %	385244343
5620	NC_017436	GGT	2	6	287989	287994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244343
5621	NC_017436	CTT	2	6	288031	288036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244343
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5623	NC_017436	ATC	2	6	288134	288139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244343
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5979	NC_017436	A	6	6	305574	305579	100 %	0 %	0 %	0 %	385244360
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5990	NC_017436	ATTG	2	8	306334	306341	25 %	50 %	25 %	0 %	385244362
5991	NC_017436	AGG	3	9	306378	306386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244362
5992	NC_017436	GCA	2	6	306451	306456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244362
5993	NC_017436	GCT	2	6	306490	306495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244362
5994	NC_017436	AGA	2	6	306539	306544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244362
5995	NC_017436	A	6	6	306553	306558	100 %	0 %	0 %	0 %	385244362
5996	NC_017436	A	6	6	306612	306617	100 %	0 %	0 %	0 %	385244362
5997	NC_017436	GTT	2	6	306672	306677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244362
5998	NC_017436	AGCTTA	2	12	306763	306774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385244362
5999	NC_017436	TCCA	2	8	306809	306816	25 %	25 %	0 %	50 %	385244362
6000	NC_017436	TGC	2	6	306848	306853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244362

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