MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017436	GTTTT	2	10	257257	257266	0 %	80 %	20 %	0 %	385244317
5002	NC_017436	TTA	2	6	257281	257286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244317
5003	NC_017436	CATT	2	8	257305	257312	25 %	50 %	0 %	25 %	385244317
5004	NC_017436	CAC	2	6	257315	257320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244317
5005	NC_017436	GCT	2	6	257400	257405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244317
5006	NC_017436	TCA	2	6	257448	257453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244317
5007	NC_017436	TCT	2	6	257483	257488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244317
5008	NC_017436	TTC	2	6	257497	257502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244317
5009	NC_017436	TGC	2	6	257556	257561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244317
5010	NC_017436	GTT	2	6	257562	257567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244317
5011	NC_017436	TAAT	2	8	257572	257579	50 %	50 %	0 %	0 %	385244317
5012	NC_017436	A	6	6	257580	257585	100 %	0 %	0 %	0 %	385244317
5013	NC_017436	AGA	2	6	257597	257602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244317
5014	NC_017436	A	8	8	257823	257830	100 %	0 %	0 %	0 %	385244318
5015	NC_017436	TCA	2	6	257841	257846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244318
5016	NC_017436	GAT	2	6	257867	257872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244318
5017	NC_017436	GGC	2	6	257931	257936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244318
5018	NC_017436	TTC	2	6	257947	257952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244318
5019	NC_017436	ATT	2	6	257970	257975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244318
5020	NC_017436	CT	3	6	258003	258008	0 %	50 %	0 %	50 %	385244318
5021	NC_017436	AGG	2	6	258080	258085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244318
5022	NC_017436	TAC	2	6	258120	258125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244318
5023	NC_017436	CTT	2	6	258155	258160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244318
5024	NC_017436	TAA	2	6	258317	258322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244318
5025	NC_017436	CTT	3	9	258504	258512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244318
5026	NC_017436	AAAC	2	8	258534	258541	75 %	0 %	0 %	25 %	385244318
5027	NC_017436	AAT	2	6	258579	258584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244318
5028	NC_017436	TTTCT	2	10	258589	258598	0 %	80 %	0 %	20 %	385244318
5029	NC_017436	TTTA	2	8	258696	258703	25 %	75 %	0 %	0 %	385244318
5030	NC_017436	TC	3	6	258743	258748	0 %	50 %	0 %	50 %	385244318
5031	NC_017436	T	6	6	258753	258758	0 %	100 %	0 %	0 %	385244318
5032	NC_017436	TCT	3	9	258766	258774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244318
5033	NC_017436	GGC	2	6	258788	258793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244318
5034	NC_017436	GAT	2	6	258803	258808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244318
5035	NC_017436	TCT	2	6	258821	258826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244318
5036	NC_017436	A	6	6	258855	258860	100 %	0 %	0 %	0 %	385244318
5037	NC_017436	TCT	2	6	258873	258878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244318
5038	NC_017436	TGC	2	6	258887	258892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244318
5039	NC_017436	T	6	6	258930	258935	0 %	100 %	0 %	0 %	385244318
5040	NC_017436	TATT	2	8	258989	258996	25 %	75 %	0 %	0 %	385244318
5041	NC_017436	ACTT	2	8	259071	259078	25 %	50 %	0 %	25 %	385244318
5042	NC_017436	TGG	2	6	259170	259175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244318
5043	NC_017436	TCTT	2	8	259240	259247	0 %	75 %	0 %	25 %	385244318
5044	NC_017436	AAC	2	6	259281	259286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244318
5045	NC_017436	A	6	6	259475	259480	100 %	0 %	0 %	0 %	385244319
5046	NC_017436	GCA	2	6	259523	259528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244319
5047	NC_017436	TCT	2	6	259570	259575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244319
5048	NC_017436	TGC	2	6	259576	259581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244319
5049	NC_017436	TTA	2	6	259646	259651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244319
5050	NC_017436	CTT	2	6	259652	259657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244319
5051	NC_017436	CAA	2	6	259722	259727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244319
5052	NC_017436	CA	3	6	259843	259848	50 %	0 %	0 %	50 %	385244320
5053	NC_017436	CTT	2	6	259973	259978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244320
5054	NC_017436	CAA	2	6	259998	260003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244320
5055	NC_017436	TGCAA	2	10	260009	260018	40 %	20 %	20 %	20 %	385244320
5056	NC_017436	AAC	2	6	260019	260024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244320
5057	NC_017436	A	6	6	260061	260066	100 %	0 %	0 %	0 %	385244320
5058	NC_017436	TGC	2	6	260135	260140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244320
5059	NC_017436	TTC	2	6	260194	260199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244320
5060	NC_017436	TTGT	2	8	260209	260216	0 %	75 %	25 %	0 %	385244320
5061	NC_017436	CTGG	2	8	260217	260224	0 %	25 %	50 %	25 %	385244320
5062	NC_017436	TTG	2	6	260276	260281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244320
5063	NC_017436	TCT	2	6	260299	260304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244320
5064	NC_017436	CTT	2	6	260415	260420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244321
5065	NC_017436	T	6	6	260456	260461	0 %	100 %	0 %	0 %	385244321
5066	NC_017436	TAT	2	6	260497	260502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244321
5067	NC_017436	TTC	2	6	260503	260508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244321
5068	NC_017436	AGA	2	6	260573	260578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244321
5069	NC_017436	CTT	2	6	260621	260626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244321
5070	NC_017436	CT	3	6	260661	260666	0 %	50 %	0 %	50 %	385244321
5071	NC_017436	TC	3	6	260677	260682	0 %	50 %	0 %	50 %	385244321
5072	NC_017436	CT	3	6	260689	260694	0 %	50 %	0 %	50 %	385244321
5073	NC_017436	ACCTTT	2	12	260728	260739	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385244321
5074	NC_017436	T	6	6	260737	260742	0 %	100 %	0 %	0 %	385244321
5075	NC_017436	T	6	6	260856	260861	0 %	100 %	0 %	0 %	385244321
5076	NC_017436	T	6	6	260921	260926	0 %	100 %	0 %	0 %	385244321
5077	NC_017436	AGA	2	6	261053	261058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244321
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5079	NC_017436	CTT	2	6	261171	261176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244321
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5081	NC_017436	CTC	2	6	261269	261274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244321
5082	NC_017436	CAT	2	6	261350	261355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244321
5083	NC_017436	CTT	2	6	261374	261379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244321
5084	NC_017436	TGT	2	6	261390	261395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244321
5085	NC_017436	CAA	2	6	261424	261429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244321
5086	NC_017436	GCTT	2	8	261452	261459	0 %	50 %	25 %	25 %	385244321
5087	NC_017436	GAT	2	6	261468	261473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244321
5088	NC_017436	AAT	2	6	261474	261479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244321
5089	NC_017436	TTA	2	6	261486	261491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244321
5090	NC_017436	TAA	2	6	261506	261511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244321
5091	NC_017436	TTG	2	6	261547	261552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244321
5092	NC_017436	ACT	2	6	261578	261583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244321
5093	NC_017436	TAT	2	6	261617	261622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244321
5094	NC_017436	CCG	2	6	261628	261633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385244321
5095	NC_017436	CACT	2	8	261662	261669	25 %	25 %	0 %	50 %	385244321
5096	NC_017436	TC	4	8	261692	261699	0 %	50 %	0 %	50 %	385244321
5097	NC_017436	ATGA	2	8	261747	261754	50 %	25 %	25 %	0 %	385244321
5098	NC_017436	A	6	6	261797	261802	100 %	0 %	0 %	0 %	385244321
5099	NC_017436	TTG	2	6	261840	261845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244321
5100	NC_017436	A	6	6	261851	261856	100 %	0 %	0 %	0 %	385244321
5101	NC_017436	CTT	2	6	261879	261884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244321
5102	NC_017436	A	6	6	261935	261940	100 %	0 %	0 %	0 %	385244321
5103	NC_017436	ACT	2	6	261974	261979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244321
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5105	NC_017436	AGC	3	9	262016	262024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244321
5106	NC_017436	TGA	2	6	262076	262081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244321
5107	NC_017436	TC	3	6	262178	262183	0 %	50 %	0 %	50 %	385244321
5108	NC_017436	TAA	2	6	262213	262218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244321
5109	NC_017436	AAG	2	6	262247	262252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244321
5110	NC_017436	TAT	2	6	262268	262273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244321
5111	NC_017436	CTT	2	6	262280	262285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244321
5112	NC_017436	AC	3	6	262402	262407	50 %	0 %	0 %	50 %	385244321
5113	NC_017436	GTTC	2	8	262469	262476	0 %	50 %	25 %	25 %	385244321
5114	NC_017436	CT	3	6	262532	262537	0 %	50 %	0 %	50 %	385244321
5115	NC_017436	GCA	2	6	262611	262616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244321
5116	NC_017436	ATAG	2	8	262632	262639	50 %	25 %	25 %	0 %	385244321
5117	NC_017436	GCT	2	6	262683	262688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244321
5118	NC_017436	TCG	2	6	262822	262827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244321
5119	NC_017436	TCA	2	6	262830	262835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244321
5120	NC_017436	CGA	2	6	262979	262984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244321
5121	NC_017436	A	6	6	262998	263003	100 %	0 %	0 %	0 %	385244321
5122	NC_017436	GAA	2	6	263025	263030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244321
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5124	NC_017436	AGA	2	6	263093	263098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244321
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5363	NC_017436	ACGA	2	8	275293	275300	50 %	0 %	25 %	25 %	385244333
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5365	NC_017436	A	7	7	275339	275345	100 %	0 %	0 %	0 %	385244333
5366	NC_017436	TTGTC	2	10	275353	275362	0 %	60 %	20 %	20 %	385244333
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