MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 12773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017434	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243209
2	NC_017434	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243209
3	NC_017434	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243209
4	NC_017434	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243209
5	NC_017434	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243209
6	NC_017434	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243209
7	NC_017434	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243209
8	NC_017434	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243209
9	NC_017434	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243209
10	NC_017434	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243209
11	NC_017434	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243210
12	NC_017434	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243210
13	NC_017434	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243210
14	NC_017434	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243210
15	NC_017434	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243210
16	NC_017434	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243210
17	NC_017434	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243210
18	NC_017434	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243211
19	NC_017434	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243211
20	NC_017434	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243211
21	NC_017434	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243211
22	NC_017434	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243211
23	NC_017434	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243211
24	NC_017434	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243211
25	NC_017434	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243211
26	NC_017434	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243211
27	NC_017434	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243211
28	NC_017434	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243211
29	NC_017434	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243211
30	NC_017434	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243211
31	NC_017434	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243211
32	NC_017434	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243211
33	NC_017434	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243211
34	NC_017434	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243211
35	NC_017434	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243211
36	NC_017434	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243211
37	NC_017434	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243211
38	NC_017434	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243211
39	NC_017434	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243211
40	NC_017434	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243212
41	NC_017434	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243212
42	NC_017434	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243212
43	NC_017434	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243212
44	NC_017434	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243212
45	NC_017434	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243212
46	NC_017434	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243212
47	NC_017434	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243212
48	NC_017434	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243212
49	NC_017434	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243212
50	NC_017434	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243212
51	NC_017434	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243212
52	NC_017434	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243212
53	NC_017434	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243212
54	NC_017434	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243212
55	NC_017434	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243212
56	NC_017434	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243213
57	NC_017434	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243213
58	NC_017434	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243213
59	NC_017434	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243213
60	NC_017434	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243213
61	NC_017434	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243213
62	NC_017434	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243213
63	NC_017434	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243213
64	NC_017434	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243213
65	NC_017434	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243213
66	NC_017434	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243213
67	NC_017434	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243213
68	NC_017434	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243213
69	NC_017434	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243213
70	NC_017434	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243213
71	NC_017434	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243213
72	NC_017434	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243213
73	NC_017434	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243214
74	NC_017434	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243214
75	NC_017434	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243214
76	NC_017434	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243214
77	NC_017434	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243214
78	NC_017434	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243215
79	NC_017434	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243215
80	NC_017434	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243215
81	NC_017434	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243215
82	NC_017434	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243215
83	NC_017434	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243216
84	NC_017434	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243216
85	NC_017434	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243216
86	NC_017434	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243216
87	NC_017434	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243216
88	NC_017434	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243216
89	NC_017434	GAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243216
90	NC_017434	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243216
91	NC_017434	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243216
92	NC_017434	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243216
93	NC_017434	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243216
94	NC_017434	GTT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243216
95	NC_017434	AAG	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243216
96	NC_017434	GAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243216
97	NC_017434	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243217
98	NC_017434	AGA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243217
99	NC_017434	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243217
100	NC_017434	GAA	2	6	9689	9694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243217
101	NC_017434	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243217
102	NC_017434	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243217
103	NC_017434	GTA	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243218
104	NC_017434	AGC	2	6	9983	9988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243218
105	NC_017434	CTT	2	6	9997	10002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243218
106	NC_017434	ATG	2	6	10158	10163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243218
107	NC_017434	CGT	2	6	10185	10190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243218
108	NC_017434	GAC	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243218
109	NC_017434	GGT	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243218
110	NC_017434	GAA	2	6	10488	10493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243218
111	NC_017434	CAA	2	6	10510	10515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243218
112	NC_017434	GGA	2	6	10572	10577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243218
113	NC_017434	CGA	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243218
114	NC_017434	CTT	2	6	10735	10740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243218
115	NC_017434	TTG	2	6	10775	10780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243218
116	NC_017434	CTT	2	6	10789	10794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243218
117	NC_017434	ATC	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243218
118	NC_017434	TGT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243218
119	NC_017434	AGA	2	6	11011	11016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243218
120	NC_017434	AGG	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243218
121	NC_017434	GAT	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243218
122	NC_017434	CGA	2	6	11116	11121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243218
123	NC_017434	AAT	2	6	11329	11334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243219
124	NC_017434	AGG	2	6	11572	11577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243219
125	NC_017434	ATA	3	9	11582	11590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243219
126	NC_017434	TAT	2	6	11601	11606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243219
127	NC_017434	ACA	2	6	11612	11617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243219
128	NC_017434	TAC	2	6	11905	11910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243219
129	NC_017434	TCA	2	6	11912	11917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243219
130	NC_017434	TTC	2	6	11950	11955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243219
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133	NC_017434	CAA	2	6	12309	12314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243219
134	NC_017434	ATC	2	6	12332	12337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243219
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136	NC_017434	ATA	2	6	12565	12570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243220
137	NC_017434	TAC	2	6	12693	12698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243220
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