MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017434	GAA	2	6	207967	207972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243392
4003	NC_017434	AAG	2	6	208070	208075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243392
4004	NC_017434	TGA	2	6	208077	208082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243392
4005	NC_017434	TAT	2	6	208085	208090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243392
4006	NC_017434	GGC	2	6	208109	208114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243392
4007	NC_017434	TTA	2	6	208157	208162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243393
4008	NC_017434	ATG	2	6	208169	208174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243393
4009	NC_017434	AAG	2	6	208202	208207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243393
4010	NC_017434	GGA	2	6	208294	208299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243393
4011	NC_017434	GAA	2	6	208332	208337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243393
4012	NC_017434	GC	3	6	208338	208343	0 %	0 %	50 %	50 %	385243393
4013	NC_017434	GTA	2	6	208369	208374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243393
4014	NC_017434	GC	3	6	208389	208394	0 %	0 %	50 %	50 %	385243393
4015	NC_017434	AGA	2	6	208464	208469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243393
4016	NC_017434	TC	3	6	208600	208605	0 %	50 %	0 %	50 %	385243393
4017	NC_017434	GAA	2	6	208627	208632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243393
4018	NC_017434	CCG	2	6	208677	208682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385243393
4019	NC_017434	TAGG	2	8	208784	208791	25 %	25 %	50 %	0 %	385243393
4020	NC_017434	CTC	2	6	208820	208825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243393
4021	NC_017434	TCT	2	6	208849	208854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243393
4022	NC_017434	CTT	3	9	208918	208926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243394
4023	NC_017434	TGT	2	6	208945	208950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243394
4024	NC_017434	AGA	2	6	209004	209009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243394
4025	NC_017434	TGA	2	6	209039	209044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243394
4026	NC_017434	CTT	2	6	209054	209059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243394
4027	NC_017434	T	6	6	209131	209136	0 %	100 %	0 %	0 %	385243394
4028	NC_017434	GCA	2	6	209201	209206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243394
4029	NC_017434	TCA	2	6	209218	209223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243394
4030	NC_017434	ACTA	2	8	209307	209314	50 %	25 %	0 %	25 %	385243394
4031	NC_017434	TCC	2	6	209323	209328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243394
4032	NC_017434	AC	3	6	209345	209350	50 %	0 %	0 %	50 %	385243394
4033	NC_017434	TAG	2	6	209363	209368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243394
4034	NC_017434	TGG	2	6	209418	209423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243394
4035	NC_017434	A	6	6	209440	209445	100 %	0 %	0 %	0 %	385243394
4036	NC_017434	ATAA	2	8	209481	209488	75 %	25 %	0 %	0 %	385243394
4037	NC_017434	GAG	2	6	209582	209587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243394
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4041	NC_017434	CT	3	6	209750	209755	0 %	50 %	0 %	50 %	385243394
4042	NC_017434	AGC	2	6	209772	209777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243394
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4044	NC_017434	GTA	2	6	209985	209990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243395
4045	NC_017434	TAG	2	6	210120	210125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243395
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4050	NC_017434	AGA	2	6	210260	210265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243395
4051	NC_017434	AG	3	6	210287	210292	50 %	0 %	50 %	0 %	385243395
4052	NC_017434	CT	3	6	210304	210309	0 %	50 %	0 %	50 %	385243395
4053	NC_017434	CTT	2	6	210330	210335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243395
4054	NC_017434	CTA	2	6	210396	210401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243395
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4057	NC_017434	CAA	2	6	210508	210513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243396
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4059	NC_017434	GAAC	2	8	210693	210700	50 %	0 %	25 %	25 %	385243396
4060	NC_017434	CA	4	8	210766	210773	50 %	0 %	0 %	50 %	385243396
4061	NC_017434	T	6	6	210831	210836	0 %	100 %	0 %	0 %	385243396
4062	NC_017434	CTC	2	6	210853	210858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243396
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4065	NC_017434	AGC	2	6	210962	210967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243396
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4092	NC_017434	CACGA	2	10	212012	212021	40 %	0 %	20 %	40 %	385243396
4093	NC_017434	ATTT	2	8	212113	212120	25 %	75 %	0 %	0 %	385243396
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4104	NC_017434	GAT	2	6	212900	212905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243396
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4106	NC_017434	TTTA	2	8	212912	212919	25 %	75 %	0 %	0 %	385243396
4107	NC_017434	ATT	2	6	212950	212955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243397
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4109	NC_017434	TC	3	6	213126	213131	0 %	50 %	0 %	50 %	385243397
4110	NC_017434	TTC	2	6	213165	213170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243397
4111	NC_017434	AGT	2	6	213183	213188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243397
4112	NC_017434	AACA	2	8	213210	213217	75 %	0 %	0 %	25 %	385243397
4113	NC_017434	TCT	2	6	213236	213241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243397
4114	NC_017434	TGGA	2	8	213268	213275	25 %	25 %	50 %	0 %	385243397
4115	NC_017434	TTC	2	6	213322	213327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243397
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4117	NC_017434	TTC	2	6	213370	213375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243397
4118	NC_017434	GCA	2	6	213380	213385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243397
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4120	NC_017434	GGA	2	6	213446	213451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243397
4121	NC_017434	T	6	6	213514	213519	0 %	100 %	0 %	0 %	385243397
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4123	NC_017434	TCA	2	6	213605	213610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243397
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4234	NC_017434	CTG	2	6	219234	219239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243401
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4237	NC_017434	TTC	2	6	219343	219348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243401
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4240	NC_017434	AGA	2	6	219866	219871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243402
4241	NC_017434	AAC	2	6	219891	219896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243402
4242	NC_017434	CTC	2	6	219939	219944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243402
4243	NC_017434	T	7	7	219959	219965	0 %	100 %	0 %	0 %	385243402
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4245	NC_017434	CTC	2	6	219984	219989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243402
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4362	NC_017434	A	7	7	224753	224759	100 %	0 %	0 %	0 %	385243406
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4490	NC_017434	TAA	2	6	231555	231560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243412
4491	NC_017434	AGA	2	6	231591	231596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243412
4492	NC_017434	GGA	2	6	231636	231641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243412
4493	NC_017434	TGA	2	6	231651	231656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243412
4494	NC_017434	TCC	2	6	231660	231665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243412
4495	NC_017434	AATG	2	8	231688	231695	50 %	25 %	25 %	0 %	385243412
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4499	NC_017434	A	6	6	231815	231820	100 %	0 %	0 %	0 %	385243413
4500	NC_017434	A	6	6	231889	231894	100 %	0 %	0 %	0 %	385243413

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