MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017434	AAAG	2	8	155794	155801	75 %	0 %	25 %	0 %	385243345
3003	NC_017434	ATT	2	6	156136	156141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243346
3004	NC_017434	AT	3	6	156145	156150	50 %	50 %	0 %	0 %	385243346
3005	NC_017434	CTT	2	6	156183	156188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243346
3006	NC_017434	TGGAGA	2	12	156208	156219	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385243346
3007	NC_017434	GCTT	2	8	156251	156258	0 %	50 %	25 %	25 %	385243346
3008	NC_017434	GCA	2	6	156281	156286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243346
3009	NC_017434	TAGA	2	8	156303	156310	50 %	25 %	25 %	0 %	385243346
3010	NC_017434	AG	3	6	156378	156383	50 %	0 %	50 %	0 %	385243346
3011	NC_017434	CCCA	2	8	156431	156438	25 %	0 %	0 %	75 %	385243346
3012	NC_017434	CTT	2	6	156452	156457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243346
3013	NC_017434	ATG	2	6	156488	156493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243346
3014	NC_017434	TAA	2	6	156536	156541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243346
3015	NC_017434	T	7	7	156545	156551	0 %	100 %	0 %	0 %	385243346
3016	NC_017434	AGA	2	6	156601	156606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243346
3017	NC_017434	A	6	6	156637	156642	100 %	0 %	0 %	0 %	385243346
3018	NC_017434	GAA	3	9	156704	156712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243346
3019	NC_017434	GT	3	6	156767	156772	0 %	50 %	50 %	0 %	385243346
3020	NC_017434	AGC	2	6	156778	156783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243346
3021	NC_017434	TCT	2	6	156791	156796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243346
3022	NC_017434	AG	3	6	156806	156811	50 %	0 %	50 %	0 %	385243346
3023	NC_017434	AGG	2	6	156879	156884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243346
3024	NC_017434	AG	3	6	156907	156912	50 %	0 %	50 %	0 %	385243346
3025	NC_017434	AG	3	6	156924	156929	50 %	0 %	50 %	0 %	385243346
3026	NC_017434	AG	3	6	156989	156994	50 %	0 %	50 %	0 %	385243346
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3030	NC_017434	A	6	6	157078	157083	100 %	0 %	0 %	0 %	385243346
3031	NC_017434	ACAT	2	8	157094	157101	50 %	25 %	0 %	25 %	385243346
3032	NC_017434	ATT	2	6	157292	157297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243347
3033	NC_017434	T	7	7	157334	157340	0 %	100 %	0 %	0 %	385243347
3034	NC_017434	CTTG	2	8	157477	157484	0 %	50 %	25 %	25 %	385243347
3035	NC_017434	GA	3	6	157493	157498	50 %	0 %	50 %	0 %	385243347
3036	NC_017434	GCA	2	6	157546	157551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243347
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3038	NC_017434	CTCCAT	2	12	157578	157589	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385243347
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3042	NC_017434	A	6	6	157725	157730	100 %	0 %	0 %	0 %	385243347
3043	NC_017434	T	6	6	157804	157809	0 %	100 %	0 %	0 %	385243347
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3046	NC_017434	T	6	6	157924	157929	0 %	100 %	0 %	0 %	385243347
3047	NC_017434	AGA	2	6	157946	157951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243347
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3054	NC_017434	AGA	2	6	158441	158446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243348
3055	NC_017434	CAT	2	6	158450	158455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243348
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3058	NC_017434	ATT	2	6	159012	159017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243349
3059	NC_017434	CAT	2	6	159164	159169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243349
3060	NC_017434	TCAA	2	8	159225	159232	50 %	25 %	0 %	25 %	385243349
3061	NC_017434	TGA	2	6	159422	159427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243349
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3094	NC_017434	A	6	6	161285	161290	100 %	0 %	0 %	0 %	385243351
3095	NC_017434	CTG	2	6	161353	161358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243351
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3102	NC_017434	CT	4	8	161512	161519	0 %	50 %	0 %	50 %	385243351
3103	NC_017434	TGT	2	6	161540	161545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243351
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3107	NC_017434	GGAA	2	8	162050	162057	50 %	0 %	50 %	0 %	385243352
3108	NC_017434	GAA	3	9	162065	162073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243352
3109	NC_017434	TTTC	2	8	162168	162175	0 %	75 %	0 %	25 %	385243352
3110	NC_017434	ATCT	2	8	162194	162201	25 %	50 %	0 %	25 %	385243352
3111	NC_017434	CTT	2	6	162219	162224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243352
3112	NC_017434	CCA	2	6	162246	162251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243352
3113	NC_017434	GA	3	6	162273	162278	50 %	0 %	50 %	0 %	385243352
3114	NC_017434	TTG	2	6	162299	162304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243352
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3121	NC_017434	TG	3	6	162660	162665	0 %	50 %	50 %	0 %	385243352
3122	NC_017434	AGC	2	6	162678	162683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243352
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3493	NC_017434	GTTT	2	8	181585	181592	0 %	75 %	25 %	0 %	385243363
3494	NC_017434	CTT	2	6	181673	181678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243363
3495	NC_017434	AGA	2	6	181753	181758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243363
3496	NC_017434	TG	3	6	181786	181791	0 %	50 %	50 %	0 %	385243363
3497	NC_017434	AGGGG	2	10	181792	181801	20 %	0 %	80 %	0 %	385243363
3498	NC_017434	GA	3	6	181833	181838	50 %	0 %	50 %	0 %	385243363
3499	NC_017434	AGG	2	6	181861	181866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243363
3500	NC_017434	AGA	2	6	181873	181878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243363

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