MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017434	GCG	2	6	81893	81898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243276
1503	NC_017434	T	6	6	81936	81941	0 %	100 %	0 %	0 %	385243276
1504	NC_017434	TGG	3	9	81962	81970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243276
1505	NC_017434	CAG	2	6	82038	82043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243276
1506	NC_017434	GTT	2	6	82049	82054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243276
1507	NC_017434	TATT	2	8	82059	82066	25 %	75 %	0 %	0 %	385243276
1508	NC_017434	GTG	2	6	82083	82088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243276
1509	NC_017434	CCT	2	6	82133	82138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243276
1510	NC_017434	GGAAG	2	10	82261	82270	40 %	0 %	60 %	0 %	385243276
1511	NC_017434	ATT	2	6	82280	82285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243276
1512	NC_017434	TTG	2	6	82302	82307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243276
1513	NC_017434	TTC	2	6	82310	82315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243276
1514	NC_017434	T	6	6	82344	82349	0 %	100 %	0 %	0 %	385243276
1515	NC_017434	GAA	2	6	82383	82388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243276
1516	NC_017434	GAA	2	6	82412	82417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243276
1517	NC_017434	GA	3	6	82474	82479	50 %	0 %	50 %	0 %	385243276
1518	NC_017434	GTTC	2	8	82484	82491	0 %	50 %	25 %	25 %	385243276
1519	NC_017434	GCT	2	6	82619	82624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243276
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1521	NC_017434	TAA	2	6	82681	82686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243276
1522	NC_017434	CAT	2	6	82697	82702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243276
1523	NC_017434	GAA	2	6	82709	82714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243276
1524	NC_017434	GA	3	6	82794	82799	50 %	0 %	50 %	0 %	385243276
1525	NC_017434	TAC	2	6	82845	82850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243277
1526	NC_017434	T	6	6	82869	82874	0 %	100 %	0 %	0 %	385243277
1527	NC_017434	T	7	7	82881	82887	0 %	100 %	0 %	0 %	385243277
1528	NC_017434	T	6	6	82894	82899	0 %	100 %	0 %	0 %	385243277
1529	NC_017434	GTA	2	6	82980	82985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243277
1530	NC_017434	T	6	6	82991	82996	0 %	100 %	0 %	0 %	385243277
1531	NC_017434	TATG	2	8	83015	83022	25 %	50 %	25 %	0 %	385243277
1532	NC_017434	TAT	2	6	83044	83049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243277
1533	NC_017434	GTCTGT	2	12	83058	83069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385243277
1534	NC_017434	TCA	2	6	83078	83083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243277
1535	NC_017434	TCAT	2	8	83086	83093	25 %	50 %	0 %	25 %	385243277
1536	NC_017434	CAA	2	6	83128	83133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243277
1537	NC_017434	ACTG	2	8	83138	83145	25 %	25 %	25 %	25 %	385243277
1538	NC_017434	CATT	2	8	83153	83160	25 %	50 %	0 %	25 %	385243277
1539	NC_017434	AGA	2	6	83186	83191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243277
1540	NC_017434	AGCA	2	8	83192	83199	50 %	0 %	25 %	25 %	385243277
1541	NC_017434	TC	3	6	83214	83219	0 %	50 %	0 %	50 %	385243277
1542	NC_017434	TTA	2	6	83235	83240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243277
1543	NC_017434	ATTA	2	8	83345	83352	50 %	50 %	0 %	0 %	385243277
1544	NC_017434	TTTG	2	8	83385	83392	0 %	75 %	25 %	0 %	385243277
1545	NC_017434	TTG	2	6	83482	83487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243277
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1548	NC_017434	CTA	2	6	83697	83702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243277
1549	NC_017434	TAT	2	6	83750	83755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243277
1550	NC_017434	TAAG	2	8	83774	83781	50 %	25 %	25 %	0 %	385243277
1551	NC_017434	AGT	2	6	83863	83868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243278
1552	NC_017434	TAT	2	6	83890	83895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243278
1553	NC_017434	TGC	2	6	83905	83910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243278
1554	NC_017434	AAG	2	6	83925	83930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243278
1555	NC_017434	AG	3	6	83948	83953	50 %	0 %	50 %	0 %	385243278
1556	NC_017434	GAA	2	6	83981	83986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243278
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1559	NC_017434	AG	3	6	84215	84220	50 %	0 %	50 %	0 %	385243278
1560	NC_017434	TTC	2	6	84234	84239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243278
1561	NC_017434	GAAG	2	8	84278	84285	50 %	0 %	50 %	0 %	385243278
1562	NC_017434	A	6	6	84302	84307	100 %	0 %	0 %	0 %	385243278
1563	NC_017434	AGA	2	6	84352	84357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243278
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1567	NC_017434	TGG	2	6	84543	84548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243278
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1570	NC_017434	ACA	2	6	84607	84612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243278
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1572	NC_017434	AGAT	2	8	84703	84710	50 %	25 %	25 %	0 %	385243278
1573	NC_017434	CTT	2	6	84740	84745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243278
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1605	NC_017434	T	6	6	86951	86956	0 %	100 %	0 %	0 %	385243279
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1611	NC_017434	CTT	2	6	88289	88294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243280
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1614	NC_017434	GTA	2	6	88470	88475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243280
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