MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017434	GCA	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243231
502	NC_017434	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385243231
503	NC_017434	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385243231
504	NC_017434	TTC	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243231
505	NC_017434	CAG	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243231
506	NC_017434	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243231
507	NC_017434	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243231
508	NC_017434	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243231
509	NC_017434	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385243231
510	NC_017434	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243231
511	NC_017434	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385243231
512	NC_017434	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243231
513	NC_017434	TGT	2	6	29103	29108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243232
514	NC_017434	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243232
515	NC_017434	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243232
516	NC_017434	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243232
517	NC_017434	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385243232
518	NC_017434	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385243232
519	NC_017434	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385243232
520	NC_017434	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385243232
521	NC_017434	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	385243232
522	NC_017434	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243232
523	NC_017434	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385243232
524	NC_017434	T	8	8	29870	29877	0 %	100 %	0 %	0 %	385243232
525	NC_017434	ATG	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243232
526	NC_017434	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385243232
527	NC_017434	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385243233
528	NC_017434	GTT	2	6	30112	30117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243233
529	NC_017434	GAA	2	6	30121	30126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243233
530	NC_017434	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385243233
531	NC_017434	TCT	2	6	30187	30192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243233
532	NC_017434	ACT	2	6	30277	30282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243233
533	NC_017434	TTC	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243233
534	NC_017434	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385243233
535	NC_017434	CCT	2	6	30341	30346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243233
536	NC_017434	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385243233
537	NC_017434	T	6	6	30411	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	385243233
538	NC_017434	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385243233
539	NC_017434	GGC	2	6	30447	30452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243233
540	NC_017434	GAT	2	6	30526	30531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243233
541	NC_017434	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385243233
542	NC_017434	TAG	2	6	30548	30553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243233
543	NC_017434	GTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243233
544	NC_017434	TAA	2	6	30732	30737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243233
545	NC_017434	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385243233
546	NC_017434	GAA	2	6	30871	30876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243233
547	NC_017434	AGA	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243233
548	NC_017434	TCG	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243233
549	NC_017434	ATG	2	6	30988	30993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243233
550	NC_017434	TGG	2	6	31002	31007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243233
551	NC_017434	GAA	2	6	31033	31038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243233
552	NC_017434	ATT	2	6	31069	31074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243233
553	NC_017434	ATG	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243233
554	NC_017434	AAG	2	6	31204	31209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243233
555	NC_017434	T	6	6	31210	31215	0 %	100 %	0 %	0 %	385243233
556	NC_017434	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385243233
557	NC_017434	A	7	7	31252	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	385243233
558	NC_017434	ACA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243234
559	NC_017434	TGT	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243234
560	NC_017434	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385243234
561	NC_017434	T	6	6	31438	31443	0 %	100 %	0 %	0 %	385243234
562	NC_017434	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385243234
563	NC_017434	A	6	6	31533	31538	100 %	0 %	0 %	0 %	385243234
564	NC_017434	A	6	6	31564	31569	100 %	0 %	0 %	0 %	385243234
565	NC_017434	TGC	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243234
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568	NC_017434	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385243235
569	NC_017434	AAG	2	6	31859	31864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243235
570	NC_017434	AAG	2	6	31866	31871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243235
571	NC_017434	CTT	2	6	31905	31910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243235
572	NC_017434	CGT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243235
573	NC_017434	TGA	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243235
574	NC_017434	GAG	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243235
575	NC_017434	GCG	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243235
576	NC_017434	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385243235
577	NC_017434	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385243235
578	NC_017434	AGA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243235
579	NC_017434	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385243235
580	NC_017434	AAG	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243235
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583	NC_017434	AGG	2	6	32826	32831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243236
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592	NC_017434	CTT	2	6	33494	33499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243237
593	NC_017434	T	6	6	33516	33521	0 %	100 %	0 %	0 %	385243237
594	NC_017434	GTT	2	6	33534	33539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243237
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597	NC_017434	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385243237
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600	NC_017434	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385243238
601	NC_017434	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243238
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603	NC_017434	T	6	6	34046	34051	0 %	100 %	0 %	0 %	385243238
604	NC_017434	TTA	2	6	34076	34081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243238
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609	NC_017434	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	385243238
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612	NC_017434	ATG	2	6	34339	34344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243238
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619	NC_017434	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385243239
620	NC_017434	AGA	2	6	34666	34671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243239
621	NC_017434	TTA	2	6	34729	34734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243240
622	NC_017434	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243240
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626	NC_017434	TGT	2	6	35129	35134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243240
627	NC_017434	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	385243240
628	NC_017434	GAG	2	6	35170	35175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243240
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630	NC_017434	AGA	2	6	35303	35308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243240
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