MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017434	TATC	2	8	281681	281688	25 %	50 %	0 %	25 %	385243458
5502	NC_017434	AGCT	2	8	281702	281709	25 %	25 %	25 %	25 %	385243458
5503	NC_017434	CTG	2	6	281868	281873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243458
5504	NC_017434	ACG	2	6	281907	281912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243458
5505	NC_017434	TAA	2	6	281970	281975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243458
5506	NC_017434	ATA	2	6	281977	281982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243458
5507	NC_017434	ATA	2	6	282032	282037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243458
5508	NC_017434	TGC	2	6	282039	282044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243458
5509	NC_017434	GGA	2	6	282268	282273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243458
5510	NC_017434	AGA	2	6	282315	282320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243458
5511	NC_017434	GAG	2	6	282395	282400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243458
5512	NC_017434	GTT	2	6	282405	282410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243458
5513	NC_017434	TTC	2	6	282472	282477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243458
5514	NC_017434	TCT	2	6	282556	282561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243458
5515	NC_017434	AGT	2	6	282570	282575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243458
5516	NC_017434	GCT	2	6	282602	282607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243458
5517	NC_017434	TTC	2	6	282623	282628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243458
5518	NC_017434	CCA	2	6	282634	282639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243458
5519	NC_017434	CT	3	6	282646	282651	0 %	50 %	0 %	50 %	385243458
5520	NC_017434	TAT	2	6	282665	282670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243458
5521	NC_017434	ACA	2	6	282679	282684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243458
5522	NC_017434	CT	3	6	282758	282763	0 %	50 %	0 %	50 %	385243458
5523	NC_017434	ATA	2	6	282801	282806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243458
5524	NC_017434	CT	3	6	282897	282902	0 %	50 %	0 %	50 %	385243458
5525	NC_017434	TCT	2	6	282937	282942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243458
5526	NC_017434	GTA	2	6	283029	283034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243458
5527	NC_017434	AC	3	6	283108	283113	50 %	0 %	0 %	50 %	385243458
5528	NC_017434	TCT	2	6	283114	283119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243458
5529	NC_017434	ATG	2	6	283175	283180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243458
5530	NC_017434	CTA	2	6	283271	283276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243458
5531	NC_017434	CTT	2	6	283334	283339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243458
5532	NC_017434	CAG	2	6	283452	283457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243458
5533	NC_017434	CTC	2	6	283506	283511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243458
5534	NC_017434	TAC	2	6	283530	283535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243458
5535	NC_017434	GCT	2	6	283580	283585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243458
5536	NC_017434	GAA	2	6	283626	283631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243458
5537	NC_017434	ATA	2	6	283673	283678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243458
5538	NC_017434	CGTT	2	8	283680	283687	0 %	50 %	25 %	25 %	385243458
5539	NC_017434	ATTC	2	8	283689	283696	25 %	50 %	0 %	25 %	385243458
5540	NC_017434	CAT	2	6	284008	284013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243459
5541	NC_017434	T	9	9	284013	284021	0 %	100 %	0 %	0 %	385243459
5542	NC_017434	ATC	2	6	284056	284061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243459
5543	NC_017434	TTC	2	6	284097	284102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243459
5544	NC_017434	GT	3	6	284121	284126	0 %	50 %	50 %	0 %	385243459
5545	NC_017434	CTG	2	6	284177	284182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243459
5546	NC_017434	CCA	2	6	284302	284307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243459
5547	NC_017434	CAC	2	6	284493	284498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243459
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5549	NC_017434	CTCC	2	8	284575	284582	0 %	25 %	0 %	75 %	385243459
5550	NC_017434	AAGC	2	8	284597	284604	50 %	0 %	25 %	25 %	385243459
5551	NC_017434	ATG	2	6	284614	284619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243459
5552	NC_017434	T	6	6	284670	284675	0 %	100 %	0 %	0 %	385243459
5553	NC_017434	CTC	2	6	284676	284681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243459
5554	NC_017434	GAT	2	6	284725	284730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243459
5555	NC_017434	A	7	7	284731	284737	100 %	0 %	0 %	0 %	385243459
5556	NC_017434	AG	3	6	284798	284803	50 %	0 %	50 %	0 %	385243459
5557	NC_017434	CTT	2	6	285101	285106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243460
5558	NC_017434	ACT	2	6	285130	285135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243460
5559	NC_017434	GCTGT	2	10	285143	285152	0 %	40 %	40 %	20 %	385243460
5560	NC_017434	GTC	2	6	285211	285216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243460
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5562	NC_017434	ACT	2	6	285258	285263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243460
5563	NC_017434	ACT	2	6	285327	285332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243460
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5565	NC_017434	T	7	7	285373	285379	0 %	100 %	0 %	0 %	385243460
5566	NC_017434	CTCCTA	2	12	285380	285391	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385243460
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5569	NC_017434	ATC	2	6	285605	285610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243460
5570	NC_017434	TGGC	2	8	285615	285622	0 %	25 %	50 %	25 %	385243460
5571	NC_017434	TTCGA	2	10	285634	285643	20 %	40 %	20 %	20 %	385243460
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5574	NC_017434	TTG	2	6	285683	285688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243460
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5580	NC_017434	T	7	7	285953	285959	0 %	100 %	0 %	0 %	385243461
5581	NC_017434	GAA	2	6	286007	286012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243461
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5593	NC_017434	TCTTT	2	10	286391	286400	0 %	80 %	0 %	20 %	385243461
5594	NC_017434	TTTA	2	8	286411	286418	25 %	75 %	0 %	0 %	385243461
5595	NC_017434	A	8	8	286499	286506	100 %	0 %	0 %	0 %	385243461
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5602	NC_017434	AGTA	2	8	286894	286901	50 %	25 %	25 %	0 %	385243462
5603	NC_017434	TA	3	6	286981	286986	50 %	50 %	0 %	0 %	385243462
5604	NC_017434	TTC	2	6	287083	287088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243462
5605	NC_017434	TTC	2	6	287285	287290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243463
5606	NC_017434	GTTT	2	8	287333	287340	0 %	75 %	25 %	0 %	385243463
5607	NC_017434	CTT	2	6	287371	287376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243463
5608	NC_017434	A	6	6	287402	287407	100 %	0 %	0 %	0 %	385243463
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5614	NC_017434	CTAT	2	8	287843	287850	25 %	50 %	0 %	25 %	385243463
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5618	NC_017434	TA	3	6	287935	287940	50 %	50 %	0 %	0 %	385243463
5619	NC_017434	GGT	2	6	287991	287996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243463
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5621	NC_017434	GAA	2	6	288066	288071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243463
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5623	NC_017434	TAT	2	6	288167	288172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243463
5624	NC_017434	TGA	2	6	288176	288181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243463
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5991	NC_017434	GCA	2	6	306453	306458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243482
5992	NC_017434	GCT	2	6	306492	306497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243482
5993	NC_017434	AGA	2	6	306541	306546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243482
5994	NC_017434	A	6	6	306555	306560	100 %	0 %	0 %	0 %	385243482
5995	NC_017434	A	6	6	306614	306619	100 %	0 %	0 %	0 %	385243482
5996	NC_017434	GTT	2	6	306674	306679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243482
5997	NC_017434	AGCTTA	2	12	306765	306776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385243482
5998	NC_017434	TCCA	2	8	306811	306818	25 %	25 %	0 %	50 %	385243482
5999	NC_017434	TGC	2	6	306850	306855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243482
6000	NC_017434	TATT	2	8	306882	306889	25 %	75 %	0 %	0 %	385243482

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