MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017434	TTA	2	6	257283	257288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243437
5002	NC_017434	CATT	2	8	257307	257314	25 %	50 %	0 %	25 %	385243437
5003	NC_017434	CAC	2	6	257317	257322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243437
5004	NC_017434	GCT	2	6	257402	257407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243437
5005	NC_017434	TCA	2	6	257450	257455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243437
5006	NC_017434	TCT	2	6	257485	257490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243437
5007	NC_017434	TTC	2	6	257499	257504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243437
5008	NC_017434	TGC	2	6	257558	257563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243437
5009	NC_017434	GTT	2	6	257564	257569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243437
5010	NC_017434	TAAT	2	8	257574	257581	50 %	50 %	0 %	0 %	385243437
5011	NC_017434	A	6	6	257582	257587	100 %	0 %	0 %	0 %	385243437
5012	NC_017434	AGA	2	6	257599	257604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243437
5013	NC_017434	A	8	8	257825	257832	100 %	0 %	0 %	0 %	385243438
5014	NC_017434	TCA	2	6	257843	257848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243438
5015	NC_017434	GAT	2	6	257869	257874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243438
5016	NC_017434	GGC	2	6	257933	257938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243438
5017	NC_017434	TTC	2	6	257949	257954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243438
5018	NC_017434	ATT	2	6	257972	257977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243438
5019	NC_017434	CT	3	6	258005	258010	0 %	50 %	0 %	50 %	385243438
5020	NC_017434	AGG	2	6	258082	258087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243438
5021	NC_017434	TAC	2	6	258122	258127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243438
5022	NC_017434	CTT	2	6	258157	258162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243438
5023	NC_017434	TAA	2	6	258319	258324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243438
5024	NC_017434	CTT	3	9	258506	258514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243438
5025	NC_017434	AAAC	2	8	258536	258543	75 %	0 %	0 %	25 %	385243438
5026	NC_017434	AAT	2	6	258581	258586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243438
5027	NC_017434	TTTCT	2	10	258591	258600	0 %	80 %	0 %	20 %	385243438
5028	NC_017434	TTTA	2	8	258698	258705	25 %	75 %	0 %	0 %	385243438
5029	NC_017434	TC	3	6	258745	258750	0 %	50 %	0 %	50 %	385243438
5030	NC_017434	T	6	6	258755	258760	0 %	100 %	0 %	0 %	385243438
5031	NC_017434	TCT	3	9	258768	258776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243438
5032	NC_017434	GGC	2	6	258790	258795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243438
5033	NC_017434	GAT	2	6	258805	258810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243438
5034	NC_017434	TCT	2	6	258823	258828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243438
5035	NC_017434	A	6	6	258857	258862	100 %	0 %	0 %	0 %	385243438
5036	NC_017434	TCT	2	6	258875	258880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243438
5037	NC_017434	TGC	2	6	258889	258894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243438
5038	NC_017434	T	6	6	258932	258937	0 %	100 %	0 %	0 %	385243438
5039	NC_017434	TATT	2	8	258991	258998	25 %	75 %	0 %	0 %	385243438
5040	NC_017434	ACTT	2	8	259073	259080	25 %	50 %	0 %	25 %	385243438
5041	NC_017434	TGG	2	6	259172	259177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243438
5042	NC_017434	TCTT	2	8	259242	259249	0 %	75 %	0 %	25 %	385243438
5043	NC_017434	AAC	2	6	259283	259288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243438
5044	NC_017434	A	6	6	259477	259482	100 %	0 %	0 %	0 %	385243439
5045	NC_017434	GCA	2	6	259525	259530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243439
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5047	NC_017434	TGC	2	6	259578	259583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243439
5048	NC_017434	TTA	2	6	259648	259653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243439
5049	NC_017434	CTT	2	6	259654	259659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243439
5050	NC_017434	CAA	2	6	259724	259729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243439
5051	NC_017434	CA	3	6	259845	259850	50 %	0 %	0 %	50 %	385243440
5052	NC_017434	CTT	2	6	259975	259980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243440
5053	NC_017434	CAA	2	6	260000	260005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243440
5054	NC_017434	TGCAA	2	10	260011	260020	40 %	20 %	20 %	20 %	385243440
5055	NC_017434	AAC	2	6	260021	260026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243440
5056	NC_017434	A	6	6	260063	260068	100 %	0 %	0 %	0 %	385243440
5057	NC_017434	TGC	2	6	260137	260142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243440
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5059	NC_017434	TTGT	2	8	260211	260218	0 %	75 %	25 %	0 %	385243440
5060	NC_017434	CTGG	2	8	260219	260226	0 %	25 %	50 %	25 %	385243440
5061	NC_017434	TTG	2	6	260278	260283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243440
5062	NC_017434	TCT	2	6	260301	260306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243440
5063	NC_017434	CTT	2	6	260417	260422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243441
5064	NC_017434	T	6	6	260458	260463	0 %	100 %	0 %	0 %	385243441
5065	NC_017434	TAT	2	6	260499	260504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243441
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5069	NC_017434	CT	3	6	260663	260668	0 %	50 %	0 %	50 %	385243441
5070	NC_017434	TC	3	6	260679	260684	0 %	50 %	0 %	50 %	385243441
5071	NC_017434	CT	3	6	260691	260696	0 %	50 %	0 %	50 %	385243441
5072	NC_017434	ACCTTT	2	12	260730	260741	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385243441
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5074	NC_017434	T	6	6	260858	260863	0 %	100 %	0 %	0 %	385243441
5075	NC_017434	T	6	6	260923	260928	0 %	100 %	0 %	0 %	385243441
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5081	NC_017434	CAT	2	6	261352	261357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243441
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5088	NC_017434	TTA	2	6	261488	261493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243441
5089	NC_017434	TAA	2	6	261508	261513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243441
5090	NC_017434	TTG	2	6	261549	261554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243441
5091	NC_017434	ACT	2	6	261580	261585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243441
5092	NC_017434	TAT	2	6	261619	261624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243441
5093	NC_017434	CCG	2	6	261630	261635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385243441
5094	NC_017434	CACT	2	8	261664	261671	25 %	25 %	0 %	50 %	385243441
5095	NC_017434	TC	4	8	261694	261701	0 %	50 %	0 %	50 %	385243441
5096	NC_017434	ATGA	2	8	261749	261756	50 %	25 %	25 %	0 %	385243441
5097	NC_017434	A	6	6	261799	261804	100 %	0 %	0 %	0 %	385243441
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5100	NC_017434	CTT	2	6	261881	261886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243441
5101	NC_017434	A	6	6	261937	261942	100 %	0 %	0 %	0 %	385243441
5102	NC_017434	ACT	2	6	261976	261981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243441
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5105	NC_017434	TGA	2	6	262078	262083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243441
5106	NC_017434	TC	3	6	262180	262185	0 %	50 %	0 %	50 %	385243441
5107	NC_017434	TAA	2	6	262215	262220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243441
5108	NC_017434	AAG	2	6	262249	262254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243441
5109	NC_017434	TAT	2	6	262270	262275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243441
5110	NC_017434	CTT	2	6	262282	262287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243441
5111	NC_017434	AC	3	6	262404	262409	50 %	0 %	0 %	50 %	385243441
5112	NC_017434	GTTC	2	8	262471	262478	0 %	50 %	25 %	25 %	385243441
5113	NC_017434	CT	3	6	262534	262539	0 %	50 %	0 %	50 %	385243441
5114	NC_017434	GCA	2	6	262613	262618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243441
5115	NC_017434	ATAG	2	8	262634	262641	50 %	25 %	25 %	0 %	385243441
5116	NC_017434	GCT	2	6	262685	262690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243441
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5118	NC_017434	TCA	2	6	262832	262837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243441
5119	NC_017434	CGA	2	6	262981	262986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243441
5120	NC_017434	A	6	6	263000	263005	100 %	0 %	0 %	0 %	385243441
5121	NC_017434	GAA	2	6	263027	263032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243441
5122	NC_017434	CCTTT	2	10	263057	263066	0 %	60 %	0 %	40 %	385243441
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5124	NC_017434	TCT	2	6	263126	263131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243441
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5245	NC_017434	ATG	2	6	270345	270350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243448
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5365	NC_017434	TTGTC	2	10	275355	275364	0 %	60 %	20 %	20 %	385243453
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5373	NC_017434	A	6	6	275639	275644	100 %	0 %	0 %	0 %	385243454
5374	NC_017434	TGGT	2	8	275728	275735	0 %	50 %	50 %	0 %	385243454
5375	NC_017434	TTG	2	6	275748	275753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243454
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5378	NC_017434	TGT	2	6	275854	275859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243454
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5490	NC_017434	TGC	2	6	281365	281370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243458
5491	NC_017434	TGTT	2	8	281393	281400	0 %	75 %	25 %	0 %	385243458
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