MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC plasmid pCTDLC1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017433	CAAT	2	8	468	475	50 %	25 %	0 %	25 %	385244959
2	NC_017433	TATC	2	8	1316	1323	25 %	50 %	0 %	25 %	385244960
3	NC_017433	GAAG	2	8	1351	1358	50 %	0 %	50 %	0 %	385244960
4	NC_017433	TTGG	2	8	1506	1513	0 %	50 %	50 %	0 %	385244960
5	NC_017433	AACT	2	8	1575	1582	50 %	25 %	0 %	25 %	385244960
6	NC_017433	GGAA	2	8	1833	1840	50 %	0 %	50 %	0 %	385244960
7	NC_017433	CCGA	2	8	2205	2212	25 %	0 %	25 %	50 %	385244961
8	NC_017433	AATT	2	8	2276	2283	50 %	50 %	0 %	0 %	385244961
9	NC_017433	TGAT	2	8	2491	2498	25 %	50 %	25 %	0 %	385244961
10	NC_017433	GTTT	2	8	3122	3129	0 %	75 %	25 %	0 %	385244963
11	NC_017433	ATTA	2	8	3971	3978	50 %	50 %	0 %	0 %	385244964
12	NC_017433	TTTA	2	8	4035	4042	25 %	75 %	0 %	0 %	385244964
13	NC_017433	ATCC	2	8	4759	4766	25 %	25 %	0 %	50 %	385244964
14	NC_017433	GAAA	2	8	4879	4886	75 %	0 %	25 %	0 %	385244964
15	NC_017433	TTCC	2	8	5138	5145	0 %	50 %	0 %	50 %	385244965
16	NC_017433	AAAC	2	8	5259	5266	75 %	0 %	0 %	25 %	385244965
17	NC_017433	AAAG	2	8	5783	5790	75 %	0 %	25 %	0 %	385244965
18	NC_017433	TCCT	2	8	6964	6971	0 %	50 %	0 %	50 %	385244966
19	NC_017433	TTTC	2	8	7097	7104	0 %	75 %	0 %	25 %	385244966
20	NC_017433	CAGA	2	8	7123	7130	50 %	0 %	25 %	25 %	385244966

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.