MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017432	ATA	2	6	211915	211920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242475
4002	NC_017432	TCT	2	6	211921	211926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242475
4003	NC_017432	ACG	2	6	211965	211970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242475
4004	NC_017432	TTC	2	6	212004	212009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242475
4005	NC_017432	TAAC	2	8	212024	212031	50 %	25 %	0 %	25 %	385242475
4006	NC_017432	TCT	2	6	212032	212037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242475
4007	NC_017432	ATA	2	6	212055	212060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242475
4008	NC_017432	TGT	2	6	212191	212196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242475
4009	NC_017432	TAC	2	6	212235	212240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242475
4010	NC_017432	AAG	2	6	212266	212271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242475
4011	NC_017432	TTTA	2	8	212301	212308	25 %	75 %	0 %	0 %	385242475
4012	NC_017432	TTC	2	6	212321	212326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242475
4013	NC_017432	AAC	2	6	212469	212474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242475
4014	NC_017432	T	6	6	212490	212495	0 %	100 %	0 %	0 %	385242475
4015	NC_017432	CACGA	2	10	212505	212514	40 %	0 %	20 %	40 %	385242475
4016	NC_017432	ATTT	2	8	212606	212613	25 %	75 %	0 %	0 %	385242475
4017	NC_017432	AAT	2	6	212637	212642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242475
4018	NC_017432	GC	3	6	212686	212691	0 %	0 %	50 %	50 %	385242475
4019	NC_017432	AAT	2	6	212748	212753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242475
4020	NC_017432	CCT	2	6	212755	212760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242475
4021	NC_017432	AATT	2	8	212844	212851	50 %	50 %	0 %	0 %	385242475
4022	NC_017432	TTG	2	6	212876	212881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242475
4023	NC_017432	GAG	2	6	212902	212907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242475
4024	NC_017432	GCA	2	6	213061	213066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242475
4025	NC_017432	CAA	2	6	213107	213112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242475
4026	NC_017432	AAT	2	6	213327	213332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242475
4027	NC_017432	GAT	2	6	213393	213398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242475
4028	NC_017432	TTC	2	6	213399	213404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242475
4029	NC_017432	TTTA	2	8	213405	213412	25 %	75 %	0 %	0 %	385242475
4030	NC_017432	ATT	2	6	213443	213448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242476
4031	NC_017432	TTG	2	6	213589	213594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242476
4032	NC_017432	TC	3	6	213619	213624	0 %	50 %	0 %	50 %	385242476
4033	NC_017432	TTC	2	6	213658	213663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242476
4034	NC_017432	AGT	2	6	213676	213681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242476
4035	NC_017432	AACA	2	8	213703	213710	75 %	0 %	0 %	25 %	385242476
4036	NC_017432	TCT	2	6	213729	213734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242476
4037	NC_017432	TGGA	2	8	213761	213768	25 %	25 %	50 %	0 %	385242476
4038	NC_017432	TTC	2	6	213815	213820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242476
4039	NC_017432	TA	3	6	213835	213840	50 %	50 %	0 %	0 %	385242476
4040	NC_017432	TTC	2	6	213863	213868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242476
4041	NC_017432	GCA	2	6	213873	213878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242476
4042	NC_017432	GCT	2	6	213882	213887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242476
4043	NC_017432	GGA	2	6	213939	213944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242476
4044	NC_017432	T	6	6	214007	214012	0 %	100 %	0 %	0 %	385242476
4045	NC_017432	AACG	2	8	214055	214062	50 %	0 %	25 %	25 %	385242476
4046	NC_017432	TCA	2	6	214098	214103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242476
4047	NC_017432	CTTT	2	8	214116	214123	0 %	75 %	0 %	25 %	385242476
4048	NC_017432	CCAT	2	8	214146	214153	25 %	25 %	0 %	50 %	385242476
4049	NC_017432	GA	3	6	214164	214169	50 %	0 %	50 %	0 %	385242476
4050	NC_017432	T	6	6	214184	214189	0 %	100 %	0 %	0 %	385242476
4051	NC_017432	AGG	2	6	214208	214213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242476
4052	NC_017432	CATT	2	8	214230	214237	25 %	50 %	0 %	25 %	385242476
4053	NC_017432	AGA	2	6	214264	214269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242476
4054	NC_017432	CAA	2	6	214277	214282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242476
4055	NC_017432	ATA	4	12	214320	214331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242476
4056	NC_017432	GCT	2	6	214389	214394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242476
4057	NC_017432	GAA	2	6	214474	214479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242476
4058	NC_017432	ACG	2	6	214490	214495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242476
4059	NC_017432	AGCG	2	8	214600	214607	25 %	0 %	50 %	25 %	385242476
4060	NC_017432	CT	3	6	214637	214642	0 %	50 %	0 %	50 %	385242476
4061	NC_017432	CT	3	6	214645	214650	0 %	50 %	0 %	50 %	385242476
4062	NC_017432	AGC	2	6	214652	214657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242476
4063	NC_017432	A	6	6	214724	214729	100 %	0 %	0 %	0 %	385242476
4064	NC_017432	CAC	2	6	214744	214749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242476
4065	NC_017432	TGTTT	2	10	214794	214803	0 %	80 %	20 %	0 %	385242476
4066	NC_017432	CTA	2	6	214846	214851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242476
4067	NC_017432	TCT	2	6	214866	214871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242476
4068	NC_017432	TAGA	2	8	214897	214904	50 %	25 %	25 %	0 %	385242476
4069	NC_017432	CTTGT	2	10	214975	214984	0 %	60 %	20 %	20 %	385242476
4070	NC_017432	ATT	2	6	214991	214996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242476
4071	NC_017432	CAT	2	6	215065	215070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242476
4072	NC_017432	AGA	2	6	215167	215172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242476
4073	NC_017432	CG	3	6	215270	215275	0 %	0 %	50 %	50 %	385242476
4074	NC_017432	CTGGAT	2	12	215302	215313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385242476
4075	NC_017432	GTA	2	6	215527	215532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242476
4076	NC_017432	ACC	2	6	215541	215546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242476
4077	NC_017432	CTTG	2	8	215569	215576	0 %	50 %	25 %	25 %	385242476
4078	NC_017432	GAAATA	2	12	215625	215636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385242476
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4081	NC_017432	CGT	2	6	215818	215823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242476
4082	NC_017432	TTTCT	2	10	215825	215834	0 %	80 %	0 %	20 %	385242476
4083	NC_017432	TAA	2	6	215854	215859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242477
4084	NC_017432	CTG	2	6	215892	215897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242477
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4086	NC_017432	ACG	2	6	216160	216165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242477
4087	NC_017432	ACA	2	6	216407	216412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242478
4088	NC_017432	AATA	2	8	216452	216459	75 %	25 %	0 %	0 %	385242478
4089	NC_017432	CTT	2	6	216502	216507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242478
4090	NC_017432	AAC	2	6	216510	216515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242478
4091	NC_017432	TTG	2	6	216635	216640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242478
4092	NC_017432	TCC	2	6	216645	216650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242478
4093	NC_017432	AAG	2	6	216685	216690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242478
4094	NC_017432	CTT	2	6	216691	216696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242478
4095	NC_017432	CTT	2	6	216718	216723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242478
4096	NC_017432	TGC	2	6	216778	216783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242478
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4099	NC_017432	CCA	2	6	216879	216884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242478
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4102	NC_017432	TAC	2	6	216955	216960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242478
4103	NC_017432	CTT	2	6	217018	217023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242478
4104	NC_017432	CTC	2	6	217043	217048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242478
4105	NC_017432	TA	3	6	217145	217150	50 %	50 %	0 %	0 %	385242479
4106	NC_017432	ATG	2	6	217198	217203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242479
4107	NC_017432	TGT	2	6	217206	217211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242479
4108	NC_017432	GC	3	6	217271	217276	0 %	0 %	50 %	50 %	385242479
4109	NC_017432	AGA	2	6	217333	217338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242479
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4112	NC_017432	CAC	2	6	217528	217533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242479
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4115	NC_017432	ATGA	2	8	217648	217655	50 %	25 %	25 %	0 %	385242479
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4117	NC_017432	GCA	2	6	217770	217775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242479
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4122	NC_017432	TCC	2	6	217915	217920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242479
4123	NC_017432	T	6	6	217921	217926	0 %	100 %	0 %	0 %	385242479
4124	NC_017432	TAA	2	6	218001	218006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242479
4125	NC_017432	AGC	2	6	218047	218052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242479
4126	NC_017432	GAT	2	6	218082	218087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242479
4127	NC_017432	T	7	7	218224	218230	0 %	100 %	0 %	0 %	385242479
4128	NC_017432	AGA	2	6	218514	218519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242480
4129	NC_017432	AGT	2	6	218539	218544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242480
4130	NC_017432	CTC	2	6	218598	218603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242480
4131	NC_017432	AAC	2	6	218612	218617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242480
4132	NC_017432	ACA	2	6	218638	218643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242480
4133	NC_017432	TC	3	6	218715	218720	0 %	50 %	0 %	50 %	385242480
4134	NC_017432	TTC	2	6	218721	218726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
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4136	NC_017432	TAC	2	6	218754	218759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242480
4137	NC_017432	TGC	2	6	218772	218777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242480
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4140	NC_017432	TAA	2	6	218907	218912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242480
4141	NC_017432	TCT	2	6	218972	218977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
4142	NC_017432	GTC	2	6	218978	218983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242480
4143	NC_017432	TCT	2	6	219017	219022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
4144	NC_017432	TTC	2	6	219070	219075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
4145	NC_017432	CTT	2	6	219126	219131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
4146	NC_017432	AAT	2	6	219205	219210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242480
4147	NC_017432	ATT	2	6	219292	219297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242480
4148	NC_017432	CTT	2	6	219315	219320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
4149	NC_017432	GTT	2	6	219326	219331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242480
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4151	NC_017432	TTCC	2	8	219380	219387	0 %	50 %	0 %	50 %	385242480
4152	NC_017432	TTC	2	6	219444	219449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
4153	NC_017432	ATC	2	6	219469	219474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242480
4154	NC_017432	TAA	3	9	219579	219587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242480
4155	NC_017432	TA	3	6	219684	219689	50 %	50 %	0 %	0 %	385242480
4156	NC_017432	CTG	2	6	219726	219731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242480
4157	NC_017432	CTT	2	6	219747	219752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242480
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4163	NC_017432	CTC	2	6	220431	220436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242481
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4165	NC_017432	A	6	6	220461	220466	100 %	0 %	0 %	0 %	385242481
4166	NC_017432	CTC	2	6	220476	220481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242481
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4203	NC_017432	CTAT	2	8	222206	222213	25 %	50 %	0 %	25 %	385242483
4204	NC_017432	GAT	2	6	222419	222424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242483
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4210	NC_017432	GCA	2	6	222671	222676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242483
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4213	NC_017432	TCG	2	6	222790	222795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242483
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4216	NC_017432	GA	4	8	222882	222889	50 %	0 %	50 %	0 %	385242483
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4221	NC_017432	CA	3	6	223030	223035	50 %	0 %	0 %	50 %	385242484
4222	NC_017432	GAT	2	6	223054	223059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242484
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4224	NC_017432	TCA	2	6	223113	223118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242484
4225	NC_017432	TCT	2	6	223184	223189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242484
4226	NC_017432	A	7	7	223201	223207	100 %	0 %	0 %	0 %	385242484
4227	NC_017432	A	6	6	223225	223230	100 %	0 %	0 %	0 %	385242484
4228	NC_017432	TTA	2	6	223253	223258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242484
4229	NC_017432	GTTC	2	8	223273	223280	0 %	50 %	25 %	25 %	385242484
4230	NC_017432	ATG	2	6	223286	223291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242484
4231	NC_017432	TATT	2	8	223314	223321	25 %	75 %	0 %	0 %	385242484
4232	NC_017432	T	6	6	223363	223368	0 %	100 %	0 %	0 %	385242484
4233	NC_017432	GAT	2	6	223375	223380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242484
4234	NC_017432	ACTCCA	2	12	223405	223416	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385242484
4235	NC_017432	GCT	2	6	223428	223433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242484
4236	NC_017432	GCA	2	6	223464	223469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242484
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4238	NC_017432	T	6	6	223515	223520	0 %	100 %	0 %	0 %	385242484
4239	NC_017432	AGA	2	6	223529	223534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242484
4240	NC_017432	AGA	2	6	223559	223564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242484
4241	NC_017432	TAC	2	6	223570	223575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242484
4242	NC_017432	TAA	2	6	223578	223583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242484
4243	NC_017432	CAT	2	6	223617	223622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242484
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4245	NC_017432	CTGCTT	2	12	223637	223648	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385242484
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4362	NC_017432	CTT	2	6	229466	229471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242490
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4490	NC_017432	A	6	6	236181	236186	100 %	0 %	0 %	0 %	385242494
4491	NC_017432	A	7	7	236203	236209	100 %	0 %	0 %	0 %	385242494
4492	NC_017432	CAT	2	6	236226	236231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242494
4493	NC_017432	ACA	2	6	236263	236268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242495
4494	NC_017432	TTCAC	2	10	236305	236314	20 %	40 %	0 %	40 %	385242495
4495	NC_017432	CTT	3	9	236360	236368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242495
4496	NC_017432	ATA	2	6	236383	236388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242495
4497	NC_017432	CTGT	2	8	236435	236442	0 %	50 %	25 %	25 %	385242495
4498	NC_017432	AAC	2	6	236506	236511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242495
4499	NC_017432	AGA	2	6	236739	236744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242495
4500	NC_017432	TCT	2	6	236974	236979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242495

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