MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017432	T	7	7	157397	157403	0 %	100 %	0 %	0 %	385242427
3002	NC_017432	CTTG	2	8	157540	157547	0 %	50 %	25 %	25 %	385242427
3003	NC_017432	GA	3	6	157556	157561	50 %	0 %	50 %	0 %	385242427
3004	NC_017432	GCA	2	6	157609	157614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242427
3005	NC_017432	CTTT	2	8	157617	157624	0 %	75 %	0 %	25 %	385242427
3006	NC_017432	CTCCAT	2	12	157641	157652	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385242427
3007	NC_017432	ATT	2	6	157719	157724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242427
3008	NC_017432	GAT	2	6	157745	157750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242427
3009	NC_017432	TTG	2	6	157759	157764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242427
3010	NC_017432	A	6	6	157788	157793	100 %	0 %	0 %	0 %	385242427
3011	NC_017432	T	6	6	157867	157872	0 %	100 %	0 %	0 %	385242427
3012	NC_017432	ATG	2	6	157917	157922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242427
3013	NC_017432	TG	3	6	157968	157973	0 %	50 %	50 %	0 %	385242427
3014	NC_017432	T	6	6	157987	157992	0 %	100 %	0 %	0 %	385242427
3015	NC_017432	AGA	2	6	158009	158014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242427
3016	NC_017432	TCCTTG	2	12	158237	158248	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385242428
3017	NC_017432	GAA	2	6	158258	158263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242428
3018	NC_017432	GTT	2	6	158275	158280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242428
3019	NC_017432	AAGTTT	2	12	158322	158333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385242428
3020	NC_017432	TTA	2	6	158446	158451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242428
3021	NC_017432	CG	3	6	158478	158483	0 %	0 %	50 %	50 %	385242428
3022	NC_017432	AGA	2	6	158504	158509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242428
3023	NC_017432	CAT	2	6	158513	158518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242428
3024	NC_017432	TTC	2	6	158608	158613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242428
3025	NC_017432	AGA	3	9	158618	158626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242428
3026	NC_017432	ATT	2	6	159074	159079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242429
3027	NC_017432	CAT	2	6	159226	159231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242429
3028	NC_017432	TCAA	2	8	159287	159294	50 %	25 %	0 %	25 %	385242429
3029	NC_017432	TGA	2	6	159484	159489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242429
3030	NC_017432	GAA	2	6	159512	159517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242429
3031	NC_017432	TC	3	6	159547	159552	0 %	50 %	0 %	50 %	385242429
3032	NC_017432	GT	3	6	159585	159590	0 %	50 %	50 %	0 %	385242429
3033	NC_017432	AAT	2	6	159629	159634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242429
3034	NC_017432	GGA	2	6	159641	159646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242429
3035	NC_017432	AGGAA	2	10	159670	159679	60 %	0 %	40 %	0 %	385242429
3036	NC_017432	TAG	2	6	159700	159705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242429
3037	NC_017432	AGG	2	6	159706	159711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242429
3038	NC_017432	CTG	2	6	159726	159731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242429
3039	NC_017432	AG	3	6	159757	159762	50 %	0 %	50 %	0 %	385242429
3040	NC_017432	TCT	2	6	159785	159790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242429
3041	NC_017432	AGG	2	6	159904	159909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242429
3042	NC_017432	GAA	2	6	159917	159922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242430
3043	NC_017432	AGA	2	6	159965	159970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242430
3044	NC_017432	ATAC	2	8	160089	160096	50 %	25 %	0 %	25 %	385242430
3045	NC_017432	AGG	2	6	160115	160120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242430
3046	NC_017432	AGG	2	6	160130	160135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242430
3047	NC_017432	CT	3	6	160228	160233	0 %	50 %	0 %	50 %	385242430
3048	NC_017432	GA	3	6	160238	160243	50 %	0 %	50 %	0 %	385242430
3049	NC_017432	ATT	2	6	160258	160263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242430
3050	NC_017432	ATA	2	6	160354	160359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242430
3051	NC_017432	AC	3	6	160378	160383	50 %	0 %	0 %	50 %	385242430
3052	NC_017432	A	8	8	160423	160430	100 %	0 %	0 %	0 %	385242430
3053	NC_017432	ATG	2	6	160504	160509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242430
3054	NC_017432	TCT	2	6	160519	160524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242430
3055	NC_017432	TTC	2	6	160733	160738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242430
3056	NC_017432	AGG	2	6	160744	160749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242430
3057	NC_017432	ACA	2	6	160760	160765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242431
3058	NC_017432	ATA	3	9	160770	160778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242431
3059	NC_017432	TTTC	2	8	160788	160795	0 %	75 %	0 %	25 %	385242431
3060	NC_017432	AACAGC	2	12	160873	160884	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385242431
3061	NC_017432	AGT	2	6	160916	160921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242431
3062	NC_017432	TGG	2	6	161002	161007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242431
3063	NC_017432	AG	3	6	161232	161237	50 %	0 %	50 %	0 %	385242431
3064	NC_017432	AGA	2	6	161245	161250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242431
3065	NC_017432	TC	3	6	161329	161334	0 %	50 %	0 %	50 %	385242431
3066	NC_017432	A	6	6	161347	161352	100 %	0 %	0 %	0 %	385242431
3067	NC_017432	CTG	2	6	161415	161420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242431
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3070	NC_017432	GCA	2	6	161501	161506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242431
3071	NC_017432	CTT	2	6	161520	161525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242431
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3073	NC_017432	TCT	2	6	161570	161575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242431
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3075	NC_017432	TGT	2	6	161602	161607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242431
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3080	NC_017432	GAA	3	9	162127	162135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242432
3081	NC_017432	TTTC	2	8	162230	162237	0 %	75 %	0 %	25 %	385242432
3082	NC_017432	ATCT	2	8	162256	162263	25 %	50 %	0 %	25 %	385242432
3083	NC_017432	CTT	2	6	162281	162286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242432
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3089	NC_017432	TAG	2	6	162449	162454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242432
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3093	NC_017432	TG	3	6	162722	162727	0 %	50 %	50 %	0 %	385242432
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3096	NC_017432	TCGA	2	8	162772	162779	25 %	25 %	25 %	25 %	385242432
3097	NC_017432	AGAGA	2	10	162901	162910	60 %	0 %	40 %	0 %	385242432
3098	NC_017432	ATT	2	6	162924	162929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242432
3099	NC_017432	GAGG	2	8	162949	162956	25 %	0 %	75 %	0 %	385242432
3100	NC_017432	TC	3	6	162962	162967	0 %	50 %	0 %	50 %	385242432
3101	NC_017432	TGT	2	6	163194	163199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242432
3102	NC_017432	CTT	3	9	163220	163228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242432
3103	NC_017432	TTG	2	6	163233	163238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242432
3104	NC_017432	AGC	2	6	163278	163283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242432
3105	NC_017432	AGG	2	6	163287	163292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242432
3106	NC_017432	GAA	2	6	163321	163326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242432
3107	NC_017432	AGCAA	2	10	163336	163345	60 %	0 %	20 %	20 %	385242432
3108	NC_017432	TAC	2	6	163362	163367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242432
3109	NC_017432	TGGC	2	8	163412	163419	0 %	25 %	50 %	25 %	385242432
3110	NC_017432	CCT	2	6	163501	163506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242432
3111	NC_017432	GT	3	6	163520	163525	0 %	50 %	50 %	0 %	385242432
3112	NC_017432	GAG	2	6	163529	163534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242432
3113	NC_017432	GAT	2	6	163555	163560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242432
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3115	NC_017432	GAT	2	6	163673	163678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242433
3116	NC_017432	TAT	2	6	163721	163726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242433
3117	NC_017432	TCAA	2	8	163731	163738	50 %	25 %	0 %	25 %	385242433
3118	NC_017432	CGA	2	6	163740	163745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242433
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3120	NC_017432	TGT	2	6	163893	163898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242433
3121	NC_017432	T	7	7	163937	163943	0 %	100 %	0 %	0 %	385242433
3122	NC_017432	ATT	2	6	163957	163962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242433
3123	NC_017432	GAG	2	6	164160	164165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242433
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3140	NC_017432	GA	3	6	164994	164999	50 %	0 %	50 %	0 %	385242433
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3156	NC_017432	AT	3	6	165969	165974	50 %	50 %	0 %	0 %	385242434
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3233	NC_017432	GAT	2	6	169412	169417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242434
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3237	NC_017432	AGA	2	6	169694	169699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242434
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3240	NC_017432	TTC	2	6	169897	169902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242434
3241	NC_017432	AGA	2	6	169937	169942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242434
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3243	NC_017432	AGA	2	6	170067	170072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242434
3244	NC_017432	AAGA	2	8	170082	170089	75 %	0 %	25 %	0 %	385242434
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3246	NC_017432	GCA	2	6	170172	170177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242435
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3491	NC_017432	ATT	2	6	184060	184065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242444
3492	NC_017432	A	7	7	184090	184096	100 %	0 %	0 %	0 %	385242444
3493	NC_017432	T	8	8	184102	184109	0 %	100 %	0 %	0 %	385242444
3494	NC_017432	ATA	2	6	184152	184157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242444
3495	NC_017432	A	6	6	184157	184162	100 %	0 %	0 %	0 %	385242444
3496	NC_017432	AGA	2	6	184315	184320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242445
3497	NC_017432	TGT	2	6	184374	184379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242445
3498	NC_017432	TCT	3	9	184443	184451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242445
3499	NC_017432	TTTC	2	8	184516	184523	0 %	75 %	0 %	25 %	385242445
3500	NC_017432	CTG	2	6	184564	184569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242445

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