MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2125	NC_017432	TTC	2	6	113530	113535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242385
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2142	NC_017432	T	6	6	114457	114462	0 %	100 %	0 %	0 %	385242386
2143	NC_017432	CTG	2	6	114552	114557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242386
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2146	NC_017432	GA	4	8	114628	114635	50 %	0 %	50 %	0 %	385242386
2147	NC_017432	AGAA	2	8	114658	114665	75 %	0 %	25 %	0 %	385242386
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2221	NC_017432	TCC	2	6	118719	118724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242390
2222	NC_017432	TTTA	2	8	118737	118744	25 %	75 %	0 %	0 %	385242390
2223	NC_017432	CTG	2	6	118935	118940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242390
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2229	NC_017432	TACT	2	8	119125	119132	25 %	50 %	0 %	25 %	385242390
2230	NC_017432	GTT	2	6	119169	119174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242390
2231	NC_017432	TAT	2	6	119204	119209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242390
2232	NC_017432	GAT	2	6	119220	119225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242390
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2234	NC_017432	TC	3	6	119342	119347	0 %	50 %	0 %	50 %	385242390
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2236	NC_017432	GCTA	2	8	119467	119474	25 %	25 %	25 %	25 %	385242391
2237	NC_017432	GA	3	6	119478	119483	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2238	NC_017432	AAG	2	6	119486	119491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242391
2239	NC_017432	GCT	3	9	119492	119500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242391
2240	NC_017432	GTA	2	6	119551	119556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242391
2241	NC_017432	CCA	2	6	119559	119564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242391
2242	NC_017432	TC	3	6	119566	119571	0 %	50 %	0 %	50 %	385242391
2243	NC_017432	GCTA	2	8	119599	119606	25 %	25 %	25 %	25 %	385242391
2244	NC_017432	CGGC	2	8	119648	119655	0 %	0 %	50 %	50 %	385242391
2245	NC_017432	AGC	2	6	119689	119694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242391
2246	NC_017432	TGC	2	6	119698	119703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242391
2247	NC_017432	TCC	2	6	119710	119715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242391
2248	NC_017432	AG	3	6	119756	119761	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2249	NC_017432	GA	4	8	119799	119806	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2250	NC_017432	GGC	2	6	119839	119844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242391
2251	NC_017432	T	6	6	119938	119943	0 %	100 %	0 %	0 %	385242391
2252	NC_017432	TCT	2	6	120023	120028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242391
2253	NC_017432	GA	3	6	120132	120137	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2254	NC_017432	ATC	2	6	120226	120231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242391
2255	NC_017432	TTGGTA	2	12	120527	120538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385242392
2256	NC_017432	TG	3	6	120566	120571	0 %	50 %	50 %	0 %	385242392
2257	NC_017432	TCA	2	6	120574	120579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242392
2258	NC_017432	GAA	2	6	120598	120603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2259	NC_017432	CGC	2	6	120627	120632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242392
2260	NC_017432	TGC	2	6	120645	120650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242392
2261	NC_017432	CTG	2	6	120653	120658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242392
2262	NC_017432	AGC	2	6	120676	120681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242392
2263	NC_017432	CTTC	2	8	120874	120881	0 %	50 %	0 %	50 %	385242392
2264	NC_017432	GTA	2	6	120883	120888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242392
2265	NC_017432	AGGATC	2	12	120906	120917	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385242392
2266	NC_017432	CTT	2	6	121058	121063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242392
2267	NC_017432	CAG	2	6	121100	121105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242392
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2269	NC_017432	CT	3	6	121191	121196	0 %	50 %	0 %	50 %	385242392
2270	NC_017432	GAA	2	6	121245	121250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2271	NC_017432	TCC	2	6	121336	121341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242392
2272	NC_017432	ATG	2	6	121445	121450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242392
2273	NC_017432	TGC	2	6	121462	121467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242392
2274	NC_017432	CTT	2	6	121487	121492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242392
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2276	NC_017432	GAA	2	6	121600	121605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2277	NC_017432	TTTC	2	8	121682	121689	0 %	75 %	0 %	25 %	385242392
2278	NC_017432	AAC	2	6	121733	121738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242392
2279	NC_017432	AAG	2	6	121754	121759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2280	NC_017432	TGA	2	6	121781	121786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242392
2281	NC_017432	GTT	2	6	121809	121814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242392
2282	NC_017432	AT	3	6	121893	121898	50 %	50 %	0 %	0 %	385242392
2283	NC_017432	GTT	2	6	121933	121938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242392
2284	NC_017432	CAA	2	6	121950	121955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242392
2285	NC_017432	AAG	2	6	121958	121963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2286	NC_017432	AGA	2	6	122025	122030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2287	NC_017432	TGA	2	6	122037	122042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242392
2288	NC_017432	CTT	2	6	122080	122085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242392
2289	NC_017432	TC	3	6	122103	122108	0 %	50 %	0 %	50 %	385242392
2290	NC_017432	ATC	2	6	122286	122291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242392
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2292	NC_017432	GA	3	6	122433	122438	50 %	0 %	50 %	0 %	385242392
2293	NC_017432	GCTTC	2	10	122441	122450	0 %	40 %	20 %	40 %	385242392
2294	NC_017432	TCTA	2	8	122482	122489	25 %	50 %	0 %	25 %	385242392
2295	NC_017432	ACT	2	6	122643	122648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242393
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2297	NC_017432	AG	3	6	122739	122744	50 %	0 %	50 %	0 %	385242393
2298	NC_017432	T	6	6	122755	122760	0 %	100 %	0 %	0 %	385242393
2299	NC_017432	AGCT	2	8	122788	122795	25 %	25 %	25 %	25 %	385242393
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2301	NC_017432	GGC	2	6	122920	122925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242393
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2303	NC_017432	ATA	2	6	123013	123018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242393
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2311	NC_017432	GA	3	6	123653	123658	50 %	0 %	50 %	0 %	385242394
2312	NC_017432	GGGTTT	2	12	123676	123687	0 %	50 %	50 %	0 %	385242394
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2317	NC_017432	GCAA	2	8	123779	123786	50 %	0 %	25 %	25 %	385242394
2318	NC_017432	TTA	2	6	123824	123829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242394
2319	NC_017432	TTA	2	6	123865	123870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242394
2320	NC_017432	GGA	2	6	123882	123887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242394
2321	NC_017432	CTT	2	6	123909	123914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242394
2322	NC_017432	TTGCAT	2	12	123958	123969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242394
2323	NC_017432	A	7	7	123976	123982	100 %	0 %	0 %	0 %	385242394
2324	NC_017432	CTG	2	6	123985	123990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242394
2325	NC_017432	TGA	2	6	124012	124017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242394
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2327	NC_017432	ATCG	2	8	124044	124051	25 %	25 %	25 %	25 %	385242394
2328	NC_017432	AG	3	6	124065	124070	50 %	0 %	50 %	0 %	385242394
2329	NC_017432	AGC	2	6	124253	124258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242394
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2331	NC_017432	TGA	2	6	124312	124317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242394
2332	NC_017432	AAGAGA	2	12	124327	124338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242394
2333	NC_017432	TAC	2	6	124365	124370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242394
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2335	NC_017432	TTG	2	6	124388	124393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242394
2336	NC_017432	GA	3	6	124435	124440	50 %	0 %	50 %	0 %	385242394
2337	NC_017432	TAG	2	6	124454	124459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242394
2338	NC_017432	CTTC	2	8	124461	124468	0 %	50 %	0 %	50 %	385242394
2339	NC_017432	TCA	2	6	124581	124586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242394
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2341	NC_017432	ATAA	2	8	124664	124671	75 %	25 %	0 %	0 %	385242394
2342	NC_017432	TGAA	2	8	124749	124756	50 %	25 %	25 %	0 %	385242395
2343	NC_017432	TAA	2	6	125044	125049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242395
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2345	NC_017432	CTT	2	6	125109	125114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242395
2346	NC_017432	GGA	2	6	125210	125215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242395
2347	NC_017432	TCT	2	6	125228	125233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242395
2348	NC_017432	CAG	2	6	125285	125290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242395
2349	NC_017432	TCA	2	6	125301	125306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242395
2350	NC_017432	TGA	2	6	125317	125322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242395
2351	NC_017432	T	6	6	125359	125364	0 %	100 %	0 %	0 %	385242395
2352	NC_017432	TTAA	2	8	125473	125480	50 %	50 %	0 %	0 %	385242395
2353	NC_017432	T	7	7	125558	125564	0 %	100 %	0 %	0 %	385242396
2354	NC_017432	AGA	2	6	125585	125590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242396
2355	NC_017432	CT	3	6	125661	125666	0 %	50 %	0 %	50 %	385242396
2356	NC_017432	GA	3	6	125747	125752	50 %	0 %	50 %	0 %	385242396
2357	NC_017432	GTA	2	6	125763	125768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242396
2358	NC_017432	GTT	2	6	125783	125788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242396
2359	NC_017432	GAA	2	6	125871	125876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242396
2360	NC_017432	TGAT	2	8	125901	125908	25 %	50 %	25 %	0 %	385242396
2361	NC_017432	AGA	2	6	125942	125947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242396
2362	NC_017432	GAA	2	6	126087	126092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242396
2363	NC_017432	CAA	2	6	126196	126201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242396
2364	NC_017432	CTTT	2	8	126204	126211	0 %	75 %	0 %	25 %	385242396
2365	NC_017432	T	7	7	126209	126215	0 %	100 %	0 %	0 %	385242396
2366	NC_017432	TACAA	2	10	126230	126239	60 %	20 %	0 %	20 %	385242396
2367	NC_017432	GCA	2	6	126442	126447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242397
2368	NC_017432	TCT	2	6	126454	126459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242397
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2370	NC_017432	CAT	2	6	126596	126601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242397
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2491	NC_017432	GGA	2	6	132209	132214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242400
2492	NC_017432	TGA	2	6	132278	132283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242400
2493	NC_017432	GTT	2	6	132300	132305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242400
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2495	NC_017432	GGAG	2	8	132341	132348	25 %	0 %	75 %	0 %	385242400
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2499	NC_017432	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	385242400
2500	NC_017432	GCT	2	6	132441	132446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242400

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