MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017432	AGAA	2	8	638321	638328	75 %	0 %	25 %	0 %	385242874
12502	NC_017432	CCT	2	6	638362	638367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242874
12503	NC_017432	CT	3	6	638366	638371	0 %	50 %	0 %	50 %	385242874
12504	NC_017432	CTA	2	6	638380	638385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242874
12505	NC_017432	GAAA	2	8	638474	638481	75 %	0 %	25 %	0 %	385242874
12506	NC_017432	A	6	6	638479	638484	100 %	0 %	0 %	0 %	385242874
12507	NC_017432	CTCTTT	2	12	638582	638593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242874
12508	NC_017432	ATATCC	2	12	638599	638610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242874
12509	NC_017432	AGC	2	6	638637	638642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242874
12510	NC_017432	T	6	6	638697	638702	0 %	100 %	0 %	0 %	385242874
12511	NC_017432	TAAACA	2	12	638710	638721	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385242874
12512	NC_017432	AGG	2	6	638819	638824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242875
12513	NC_017432	ACAT	2	8	638876	638883	50 %	25 %	0 %	25 %	385242875
12514	NC_017432	CAA	2	6	638886	638891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242875
12515	NC_017432	GA	3	6	638912	638917	50 %	0 %	50 %	0 %	385242875
12516	NC_017432	TCC	2	6	638948	638953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242875
12517	NC_017432	A	7	7	638959	638965	100 %	0 %	0 %	0 %	385242875
12518	NC_017432	ATGC	2	8	638975	638982	25 %	25 %	25 %	25 %	385242875
12519	NC_017432	ACGA	2	8	639015	639022	50 %	0 %	25 %	25 %	385242875
12520	NC_017432	GA	4	8	639074	639081	50 %	0 %	50 %	0 %	385242875
12521	NC_017432	AAG	2	6	639082	639087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242875
12522	NC_017432	CTA	2	6	639093	639098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242875
12523	NC_017432	A	6	6	639101	639106	100 %	0 %	0 %	0 %	385242875
12524	NC_017432	ACA	2	6	639177	639182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242876
12525	NC_017432	TCAT	2	8	639198	639205	25 %	50 %	0 %	25 %	385242876
12526	NC_017432	AAG	2	6	639212	639217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242876
12527	NC_017432	TCT	2	6	639219	639224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242876
12528	NC_017432	AAG	2	6	639239	639244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242876
12529	NC_017432	TTTC	2	8	639245	639252	0 %	75 %	0 %	25 %	385242876
12530	NC_017432	CAC	2	6	639261	639266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242876
12531	NC_017432	TCT	2	6	639273	639278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242876
12532	NC_017432	CAT	2	6	639338	639343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242876
12533	NC_017432	CCA	2	6	639432	639437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242876
12534	NC_017432	ATA	2	6	639438	639443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242876
12535	NC_017432	CAT	2	6	639464	639469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242876
12536	NC_017432	GAA	2	6	639560	639565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242877
12537	NC_017432	AATC	2	8	639579	639586	50 %	25 %	0 %	25 %	385242877
12538	NC_017432	ACC	2	6	639694	639699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242877
12539	NC_017432	TTC	2	6	639714	639719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242877
12540	NC_017432	TCC	2	6	639789	639794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242877
12541	NC_017432	AAC	2	6	639798	639803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242877
12542	NC_017432	CTT	2	6	639815	639820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242877
12543	NC_017432	CCT	2	6	639892	639897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242877
12544	NC_017432	CAG	2	6	639905	639910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242877
12545	NC_017432	TCT	2	6	639971	639976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242877
12546	NC_017432	T	6	6	640011	640016	0 %	100 %	0 %	0 %	385242877
12547	NC_017432	TCC	2	6	640050	640055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242877
12548	NC_017432	TTTC	2	8	640145	640152	0 %	75 %	0 %	25 %	385242877
12549	NC_017432	AGAA	2	8	640174	640181	75 %	0 %	25 %	0 %	385242877
12550	NC_017432	CAC	2	6	640182	640187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242877
12551	NC_017432	TGC	2	6	640230	640235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242877
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12553	NC_017432	CT	3	6	640315	640320	0 %	50 %	0 %	50 %	385242877
12554	NC_017432	AAG	2	6	640418	640423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242877
12555	NC_017432	CAGC	2	8	640433	640440	25 %	0 %	25 %	50 %	385242877
12556	NC_017432	TAA	3	9	640503	640511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242877
12557	NC_017432	TC	4	8	640563	640570	0 %	50 %	0 %	50 %	385242877
12558	NC_017432	AGC	2	6	640605	640610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242877
12559	NC_017432	AAG	2	6	640611	640616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242877
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12561	NC_017432	CGT	2	6	640657	640662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242877
12562	NC_017432	T	6	6	640662	640667	0 %	100 %	0 %	0 %	385242877
12563	NC_017432	CGGAA	2	10	640927	640936	40 %	0 %	40 %	20 %	385242878
12564	NC_017432	TAA	2	6	640997	641002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242878
12565	NC_017432	CA	3	6	641024	641029	50 %	0 %	0 %	50 %	385242878
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12570	NC_017432	TCT	2	6	641361	641366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242878
12571	NC_017432	TA	3	6	641413	641418	50 %	50 %	0 %	0 %	385242878
12572	NC_017432	GTC	2	6	641424	641429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242878
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12579	NC_017432	GCTC	2	8	641823	641830	0 %	25 %	25 %	50 %	385242878
12580	NC_017432	AAG	2	6	641897	641902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242878
12581	NC_017432	TA	3	6	641986	641991	50 %	50 %	0 %	0 %	385242878
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12587	NC_017432	A	6	6	642162	642167	100 %	0 %	0 %	0 %	385242878
12588	NC_017432	CAT	2	6	642218	642223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242878
12589	NC_017432	GGA	2	6	642246	642251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242879
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12591	NC_017432	TTTC	2	8	642277	642284	0 %	75 %	0 %	25 %	385242879
12592	NC_017432	AGC	2	6	642297	642302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242879
12593	NC_017432	CTG	2	6	642303	642308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242879
12594	NC_017432	CTA	2	6	642314	642319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242879
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12605	NC_017432	AGA	2	6	642771	642776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242879
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12608	NC_017432	TTTC	2	8	643048	643055	0 %	75 %	0 %	25 %	385242879
12609	NC_017432	T	7	7	643082	643088	0 %	100 %	0 %	0 %	385242879
12610	NC_017432	CAA	2	6	643107	643112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242879
12611	NC_017432	ATCTTG	2	12	643114	643125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242879
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12613	NC_017432	CTT	2	6	643205	643210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242879
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12616	NC_017432	CT	3	6	643420	643425	0 %	50 %	0 %	50 %	385242879
12617	NC_017432	AGCG	2	8	643495	643502	25 %	0 %	50 %	25 %	385242879
12618	NC_017432	AGA	2	6	643542	643547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242879
12619	NC_017432	TCT	2	6	643549	643554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242879
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12621	NC_017432	GCT	2	6	643582	643587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242879
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12984	NC_017432	GAA	2	6	662974	662979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242895
12985	NC_017432	GAC	2	6	663040	663045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242895
12986	NC_017432	ATTG	2	8	663066	663073	25 %	50 %	25 %	0 %	385242895
12987	NC_017432	TCA	2	6	663110	663115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242895
12988	NC_017432	AACCA	2	10	663116	663125	60 %	0 %	0 %	40 %	385242895
12989	NC_017432	GCTAC	2	10	663179	663188	20 %	20 %	20 %	40 %	385242895
12990	NC_017432	AGA	2	6	663216	663221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242895
12991	NC_017432	TAC	2	6	663222	663227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242895
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