MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017432	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242310
502	NC_017432	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242310
503	NC_017432	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242310
504	NC_017432	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385242310
505	NC_017432	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242310
506	NC_017432	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385242310
507	NC_017432	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242310
508	NC_017432	TGT	2	6	29103	29108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242311
509	NC_017432	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242311
510	NC_017432	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242311
511	NC_017432	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242311
512	NC_017432	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385242311
513	NC_017432	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385242311
514	NC_017432	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385242311
515	NC_017432	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385242311
516	NC_017432	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	385242311
517	NC_017432	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242311
518	NC_017432	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385242311
519	NC_017432	T	8	8	29870	29877	0 %	100 %	0 %	0 %	385242311
520	NC_017432	ATG	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242311
521	NC_017432	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385242311
522	NC_017432	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385242312
523	NC_017432	GTT	2	6	30112	30117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242312
524	NC_017432	GAA	2	6	30121	30126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242312
525	NC_017432	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385242312
526	NC_017432	TCT	2	6	30187	30192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242312
527	NC_017432	ACT	2	6	30277	30282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242312
528	NC_017432	TTC	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242312
529	NC_017432	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385242312
530	NC_017432	CCT	2	6	30341	30346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242312
531	NC_017432	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385242312
532	NC_017432	T	6	6	30411	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	385242312
533	NC_017432	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385242312
534	NC_017432	GGC	2	6	30447	30452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242312
535	NC_017432	GAT	2	6	30526	30531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242312
536	NC_017432	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385242312
537	NC_017432	TAG	2	6	30548	30553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242312
538	NC_017432	GTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242312
539	NC_017432	TAA	2	6	30732	30737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242312
540	NC_017432	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385242312
541	NC_017432	GAA	2	6	30871	30876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242312
542	NC_017432	AGA	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242312
543	NC_017432	TCG	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242312
544	NC_017432	ATG	2	6	30988	30993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242312
545	NC_017432	TGG	2	6	31002	31007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242312
546	NC_017432	GAA	2	6	31033	31038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242312
547	NC_017432	ATT	2	6	31069	31074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242312
548	NC_017432	ATG	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242312
549	NC_017432	AAG	2	6	31204	31209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242312
550	NC_017432	T	6	6	31210	31215	0 %	100 %	0 %	0 %	385242312
551	NC_017432	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385242312
552	NC_017432	A	7	7	31252	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	385242312
553	NC_017432	ACA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242313
554	NC_017432	TGT	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242313
555	NC_017432	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385242313
556	NC_017432	T	6	6	31438	31443	0 %	100 %	0 %	0 %	385242313
557	NC_017432	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385242313
558	NC_017432	A	6	6	31533	31538	100 %	0 %	0 %	0 %	385242313
559	NC_017432	A	6	6	31564	31569	100 %	0 %	0 %	0 %	385242313
560	NC_017432	TGC	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242313
561	NC_017432	AGC	2	6	31610	31615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242313
562	NC_017432	GATA	2	8	31646	31653	50 %	25 %	25 %	0 %	385242314
563	NC_017432	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385242314
564	NC_017432	AAG	2	6	31859	31864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242314
565	NC_017432	AAG	2	6	31866	31871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242314
566	NC_017432	CTT	2	6	31905	31910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242314
567	NC_017432	CGT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242314
568	NC_017432	TGA	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242314
569	NC_017432	GAG	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242314
570	NC_017432	GCG	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242314
571	NC_017432	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385242314
572	NC_017432	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385242314
573	NC_017432	AGA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242314
574	NC_017432	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385242314
575	NC_017432	AAG	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242314
576	NC_017432	ATT	2	6	32471	32476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242314
577	NC_017432	T	6	6	32576	32581	0 %	100 %	0 %	0 %	385242314
578	NC_017432	AGG	2	6	32826	32831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242315
579	NC_017432	GGT	2	6	32881	32886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242315
580	NC_017432	GCT	2	6	33043	33048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242315
581	NC_017432	GCT	2	6	33076	33081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242315
582	NC_017432	GAA	2	6	33187	33192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242316
583	NC_017432	A	6	6	33191	33196	100 %	0 %	0 %	0 %	385242316
584	NC_017432	TGT	2	6	33282	33287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242316
585	NC_017432	TGA	2	6	33333	33338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242316
586	NC_017432	GTT	2	6	33421	33426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242316
587	NC_017432	AGG	2	6	33470	33475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242316
588	NC_017432	CTT	2	6	33494	33499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242316
589	NC_017432	T	6	6	33516	33521	0 %	100 %	0 %	0 %	385242316
590	NC_017432	GTT	2	6	33534	33539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242316
591	NC_017432	CAG	2	6	33704	33709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242316
592	NC_017432	TC	3	6	33764	33769	0 %	50 %	0 %	50 %	385242316
593	NC_017432	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385242316
594	NC_017432	CTG	2	6	33874	33879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242317
595	NC_017432	ACA	2	6	33891	33896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242317
596	NC_017432	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385242317
597	NC_017432	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242317
598	NC_017432	ATT	2	6	33994	33999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242317
599	NC_017432	T	6	6	34046	34051	0 %	100 %	0 %	0 %	385242317
600	NC_017432	TTA	2	6	34076	34081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242317
601	NC_017432	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	385242317
602	NC_017432	GAA	2	6	34169	34174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242317
603	NC_017432	AAG	2	6	34216	34221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242317
604	NC_017432	AGA	2	6	34267	34272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242317
605	NC_017432	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	385242317
606	NC_017432	TGC	2	6	34304	34309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242317
607	NC_017432	TGT	2	6	34328	34333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242317
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610	NC_017432	GAA	2	6	34389	34394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242317
611	NC_017432	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	385242318
612	NC_017432	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	385242318
613	NC_017432	GAT	2	6	34600	34605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242318
614	NC_017432	GA	4	8	34607	34614	50 %	0 %	50 %	0 %	385242318
615	NC_017432	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385242318
616	NC_017432	AGA	2	6	34666	34671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242318
617	NC_017432	TTA	2	6	34729	34734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242319
618	NC_017432	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242319
619	NC_017432	GGCA	2	8	34901	34908	25 %	0 %	50 %	25 %	385242319
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621	NC_017432	GAA	2	6	35100	35105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242319
622	NC_017432	TGT	2	6	35129	35134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242319
623	NC_017432	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	385242319
624	NC_017432	GAG	2	6	35170	35175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242319
625	NC_017432	CAG	2	6	35184	35189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242319
626	NC_017432	AGA	2	6	35303	35308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242319
627	NC_017432	TGCT	2	8	35311	35318	0 %	50 %	25 %	25 %	385242319
628	NC_017432	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	385242319
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630	NC_017432	GAA	2	6	35534	35539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242319
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745	NC_017432	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	385242323
746	NC_017432	A	7	7	42085	42091	100 %	0 %	0 %	0 %	385242323
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