MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017432	CA	4	8	286839	286846	50 %	0 %	0 %	50 %	385242541
5502	NC_017432	CTT	2	6	286853	286858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242541
5503	NC_017432	TTTG	2	8	286884	286891	0 %	75 %	25 %	0 %	385242541
5504	NC_017432	TCTTT	2	10	286892	286901	0 %	80 %	0 %	20 %	385242541
5505	NC_017432	TTTA	2	8	286912	286919	25 %	75 %	0 %	0 %	385242541
5506	NC_017432	A	8	8	287000	287007	100 %	0 %	0 %	0 %	385242541
5507	NC_017432	TTA	2	6	287206	287211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242542
5508	NC_017432	T	6	6	287217	287222	0 %	100 %	0 %	0 %	385242542
5509	NC_017432	TTC	2	6	287248	287253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242542
5510	NC_017432	GAG	2	6	287295	287300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242542
5511	NC_017432	CGA	2	6	287303	287308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242542
5512	NC_017432	CTT	2	6	287337	287342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242542
5513	NC_017432	AAG	2	6	287372	287377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242542
5514	NC_017432	AGTA	2	8	287395	287402	50 %	25 %	25 %	0 %	385242542
5515	NC_017432	TA	3	6	287482	287487	50 %	50 %	0 %	0 %	385242542
5516	NC_017432	TTC	2	6	287584	287589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242542
5517	NC_017432	TTC	2	6	287786	287791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242543
5518	NC_017432	GTTT	2	8	287834	287841	0 %	75 %	25 %	0 %	385242543
5519	NC_017432	CTT	2	6	287872	287877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242543
5520	NC_017432	A	6	6	287903	287908	100 %	0 %	0 %	0 %	385242543
5521	NC_017432	TCT	2	6	287971	287976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242543
5522	NC_017432	TAG	2	6	288022	288027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242543
5523	NC_017432	ATC	2	6	288153	288158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242543
5524	NC_017432	TCC	2	6	288283	288288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242543
5525	NC_017432	GTC	2	6	288328	288333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242543
5526	NC_017432	CTAT	2	8	288344	288351	25 %	50 %	0 %	25 %	385242543
5527	NC_017432	GAA	2	6	288357	288362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242543
5528	NC_017432	T	6	6	288403	288408	0 %	100 %	0 %	0 %	385242543
5529	NC_017432	ATG	2	6	288409	288414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242543
5530	NC_017432	TA	3	6	288436	288441	50 %	50 %	0 %	0 %	385242543
5531	NC_017432	GGT	2	6	288492	288497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242543
5532	NC_017432	CTT	2	6	288534	288539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242543
5533	NC_017432	GAA	2	6	288567	288572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242543
5534	NC_017432	ATC	2	6	288637	288642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242543
5535	NC_017432	TAT	2	6	288668	288673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242543
5536	NC_017432	TGA	2	6	288677	288682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242543
5537	NC_017432	CTCA	2	8	288778	288785	25 %	25 %	0 %	50 %	385242543
5538	NC_017432	TGT	2	6	288794	288799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242543
5539	NC_017432	TGC	2	6	288803	288808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242543
5540	NC_017432	CTA	2	6	288859	288864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242543
5541	NC_017432	TG	3	6	288984	288989	0 %	50 %	50 %	0 %	385242543
5542	NC_017432	TA	3	6	288999	289004	50 %	50 %	0 %	0 %	385242543
5543	NC_017432	AACT	2	8	289020	289027	50 %	25 %	0 %	25 %	385242543
5544	NC_017432	CCT	2	6	289053	289058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242544
5545	NC_017432	ATG	2	6	289087	289092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242544
5546	NC_017432	A	6	6	289153	289158	100 %	0 %	0 %	0 %	385242544
5547	NC_017432	AGA	2	6	289183	289188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242544
5548	NC_017432	TCA	2	6	289252	289257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242544
5549	NC_017432	ATT	2	6	289312	289317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242544
5550	NC_017432	GTC	2	6	289321	289326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242544
5551	NC_017432	AATT	2	8	289337	289344	50 %	50 %	0 %	0 %	385242544
5552	NC_017432	TC	3	6	289355	289360	0 %	50 %	0 %	50 %	385242544
5553	NC_017432	A	6	6	289373	289378	100 %	0 %	0 %	0 %	385242544
5554	NC_017432	TCA	2	6	289545	289550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242544
5555	NC_017432	TCGT	2	8	289685	289692	0 %	50 %	25 %	25 %	385242544
5556	NC_017432	A	6	6	289761	289766	100 %	0 %	0 %	0 %	385242544
5557	NC_017432	TGT	2	6	289794	289799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242544
5558	NC_017432	TCAT	2	8	289844	289851	25 %	50 %	0 %	25 %	385242544
5559	NC_017432	ATA	2	6	289901	289906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242544
5560	NC_017432	CTT	2	6	289997	290002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242544
5561	NC_017432	GAAC	2	8	290008	290015	50 %	0 %	25 %	25 %	385242544
5562	NC_017432	AC	3	6	290027	290032	50 %	0 %	0 %	50 %	385242544
5563	NC_017432	ATT	2	6	290062	290067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242544
5564	NC_017432	ACA	2	6	290086	290091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242544
5565	NC_017432	CTC	2	6	290123	290128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242544
5566	NC_017432	CTG	2	6	290242	290247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242545
5567	NC_017432	TGC	2	6	290278	290283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242545
5568	NC_017432	TCT	3	9	290294	290302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242545
5569	NC_017432	AGA	2	6	290398	290403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242545
5570	NC_017432	GCT	2	6	290607	290612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242545
5571	NC_017432	TAA	2	6	290617	290622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242545
5572	NC_017432	CGAA	2	8	290674	290681	50 %	0 %	25 %	25 %	385242545
5573	NC_017432	CCT	2	6	290684	290689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242545
5574	NC_017432	TGT	2	6	290690	290695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242545
5575	NC_017432	CCT	2	6	290696	290701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242545
5576	NC_017432	ATT	2	6	290708	290713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242545
5577	NC_017432	AAG	2	6	290740	290745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242545
5578	NC_017432	CTT	2	6	290823	290828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242545
5579	NC_017432	AGT	2	6	290861	290866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242545
5580	NC_017432	CTT	2	6	290970	290975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242545
5581	NC_017432	AAC	2	6	290992	290997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242545
5582	NC_017432	AAGT	2	8	291020	291027	50 %	25 %	25 %	0 %	385242545
5583	NC_017432	TGCT	2	8	291040	291047	0 %	50 %	25 %	25 %	385242545
5584	NC_017432	CTG	2	6	291063	291068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242545
5585	NC_017432	TAA	2	6	291087	291092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242545
5586	NC_017432	T	6	6	291220	291225	0 %	100 %	0 %	0 %	385242545
5587	NC_017432	TTTC	2	8	291229	291236	0 %	75 %	0 %	25 %	385242545
5588	NC_017432	TA	3	6	291347	291352	50 %	50 %	0 %	0 %	385242545
5589	NC_017432	CTT	2	6	291443	291448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242546
5590	NC_017432	AGT	2	6	291453	291458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242546
5591	NC_017432	AT	3	6	291470	291475	50 %	50 %	0 %	0 %	385242546
5592	NC_017432	A	6	6	291521	291526	100 %	0 %	0 %	0 %	385242546
5593	NC_017432	TCT	2	6	291535	291540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242546
5594	NC_017432	TC	3	6	291554	291559	0 %	50 %	0 %	50 %	385242546
5595	NC_017432	GAC	2	6	291581	291586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242546
5596	NC_017432	TTCC	2	8	291610	291617	0 %	50 %	0 %	50 %	385242546
5597	NC_017432	AGT	2	6	291789	291794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242546
5598	NC_017432	TAA	2	6	291840	291845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242546
5599	NC_017432	AAG	2	6	291959	291964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242546
5600	NC_017432	GCAATG	2	12	292000	292011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385242546
5601	NC_017432	GTT	2	6	292047	292052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242546
5602	NC_017432	CTAA	2	8	292057	292064	50 %	25 %	0 %	25 %	385242546
5603	NC_017432	CAA	2	6	292100	292105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242546
5604	NC_017432	TCA	2	6	292106	292111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242546
5605	NC_017432	AAT	2	6	292459	292464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242547
5606	NC_017432	CTT	2	6	292499	292504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242547
5607	NC_017432	CT	3	6	292562	292567	0 %	50 %	0 %	50 %	385242547
5608	NC_017432	CAG	2	6	292630	292635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242547
5609	NC_017432	CGACAT	2	12	292680	292691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385242547
5610	NC_017432	ATT	2	6	292723	292728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242547
5611	NC_017432	TAC	2	6	292778	292783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242547
5612	NC_017432	CTT	2	6	292821	292826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242547
5613	NC_017432	AGCA	2	8	292880	292887	50 %	0 %	25 %	25 %	385242547
5614	NC_017432	T	6	6	292948	292953	0 %	100 %	0 %	0 %	385242548
5615	NC_017432	AGAT	2	8	292978	292985	50 %	25 %	25 %	0 %	385242548
5616	NC_017432	AGCT	2	8	293002	293009	25 %	25 %	25 %	25 %	385242548
5617	NC_017432	CGAG	2	8	293026	293033	25 %	0 %	50 %	25 %	385242548
5618	NC_017432	CTG	2	6	293071	293076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242548
5619	NC_017432	ATA	2	6	293173	293178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242548
5620	NC_017432	A	7	7	293291	293297	100 %	0 %	0 %	0 %	385242548
5621	NC_017432	GAA	2	6	293355	293360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242548
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5623	NC_017432	AGC	2	6	293600	293605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242548
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5886	NC_017432	A	6	6	306080	306085	100 %	0 %	0 %	0 %	385242560
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5997	NC_017432	A	7	7	311752	311758	100 %	0 %	0 %	0 %	385242566
5998	NC_017432	A	6	6	311769	311774	100 %	0 %	0 %	0 %	385242566
5999	NC_017432	GCA	2	6	311856	311861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242566
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